| FONSECA & MONTEIRO LTDA | CENTRO | Fabricação de estruturas metálicas | 2024 |
| FORMIGARI COMERCIO DE MOVEIS LTDA | UBATUBA | Comércio varejista de móveis | 2021 |
| FORT PNEUS AUTOCENTER LTDA | CENTRO | Serviços de manutenção e reparação mecânica de veículos automotores | 2024 |
| FORTUNE GESTAO EMPRESARIAL LTDA | UBATUBA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2026 |
| FOX TRANSPORTES DE CONTAINERS LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, municipal | 2024 |
| FOX TRANSPORTES E LOCACAO LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, municipal | 2009 |
| FR AGRO FERTILIZANTES LTDA | ROCIO GRANDE | Comércio atacadista de defensivos agrícolas, adubos, fertilizantes e corretivos do solo | 2022 |
| FRANCA & SILVA CONSTRUCOES LTDA | ROCIO PEQUENO | Construção de edifícios | 2002 |
| FRANCIELE ELETRO LTDA | UBATUBA | Comércio varejista de móveis | 2022 |
| FRANKKE MANUTENCAO E LIMPEZA LTDA | TAPERA | Obras de alvenaria | 2013 |
| FRC SERVICOS ADMINISTRATIVOS LTDA | RETA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2020 |
| FRED'S CONTAINER LTDA | UBATUBA | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2015 |
| FREIRE COMISSARIA DE DESPACHOS LTDA | CENTRO | Comissaria de despachos | 1988 |
| FRONTEND CARGO SERVICE LTDA | ACARAI | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2004 |
| FTN - FORUM DE TURISMO DE NEGOCIOS E EVENTOS LTDA | PRAIA GRANDE | Serviços de organização de feiras, congressos, exposições e festas | 2011 |
| FUCCIO ODONTOLOGIA ESPECIALIZADA LTDA | ACARAI | Atividade odontológica | 2021 |
| FULL PORT 8 OPERACAO PORTUARIA E ARMAZENAGEM LTDA | CENTRO | Atividades do Operador Portuário | 2013 |
| FULLSERV SOLUCOES E SERVICOS LTDA | ROCIO GRANDE | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2022 |
| FUNDACAO CULTURAL ILHA DE SAO FRANCISCO DO SUL | CENTRO | Artes cênicas, espetáculos e atividades complementares não especificadas anteriormente | 1988 |
| FUNDACAO EDUCACIONAL DA REGIAO DE JOINVILLE | IPEROBA | Educação superior - graduação | 2005 |
| FUNDACAO EDUCACIONAL DA REGIAO DE JOINVILLE | ILHA | Outras atividades de ensino não especificadas anteriormente | 2006 |
| FUNDACAO INSTITUTO DE PREVIDENCIA SOCIAL DOS SERVIDORES DE SAO FRANCISCO DO SUL - IPRESF | CENTRO | Seguridade social obrigatória | 2015 |
| FUNDO MUNICIPAL DA INFANCIA E DO ADOLESCENTE - FIA | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1993 |
| FUNDO MUNICIPAL DE ASSISTENCIA SOCIAL | CENTRO | Administração pública em geral | 1994 |
| FUNDO MUNICIPAL DE CULTURA | CENTRO | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 2024 |
| FUNDO MUNICIPAL DE DEFESA CIVIL DE SAO FRANCISCO DO SUL | CENTRO HISTORICO | Defesa Civil | 2011 |
| FUNDO MUNICIPAL DE EDUCACAO DE SAO FRANCISCO DO SUL | CENTRO | Administração pública em geral | 2018 |
| FUNDO MUNICIPAL DE HABITACAO DE INTERESSE SOCIAL | CENTRO | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 2009 |
| FUNDO MUNICIPAL DE SAUDE DE SAO FRANCISCO DO SUL | ROCIO GRANDE | Outras atividades de atenção à saúde humana não especificadas anteriormente | 1999 |
| FUNDO MUNICIPAL DO ESPORTE DE SAO FRANCISCO DO SUL | ACARAI | Administração pública em geral | 2017 |
| FUNDO MUNICIPAL DO IDOSO | CENTRO | Administração pública em geral | 2010 |
| FUNERARIA MAO AMIGA LTDA | AGUA BRANCA | Serviços de funerárias | 2008 |
| FUNERARIA MIL FLORES LTDA | ROCIO GRANDE | Serviços de funerárias | 1991 |
| FUSAO INDUSTRIA DE EQUIPAMENTOS E SUBESTACOES LTDA | AGUA BRANCA | Fabricação de artigos de serralheria, exceto esquadrias | 2021 |
| FUSION CONSTRUTORA E INCORPORADORA LTDA | ROCIO GRANDE | Compra e venda de imóveis próprios | 1995 |
| FUTURA COMERCIO E NEGOCIOS INTERNACIONAIS LTDA | ROCIO PEQUENO | Comércio atacadista de tecidos | 2003 |
| FUYUKI SUSHI LTDA | UBATUBA | Restaurantes e similares | 2024 |
| FV CHOCOLATES LTDA | CENTRO | Comércio varejista de doces, balas, bombons e semelhantes | 2012 |
| FWG IMPEX ASSESSORIA MARITIMA LTDA | CENTRO | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2024 |
| FXF SOLDAS ESPECIAIS E MONTAGENS INDUSTRIAIS LTDA | UBATUBA | Serviços de usinagem, tornearia e solda | 2023 |
| FY COMERCIO DE ALIMENTOS LTDA | PRAIA DO ERVINO | Comércio varejista de mercadorias em lojas de conveniência | 2007 |
| G.E. SERVICOS DE COMUNICACAO LTDA | UBATUBA | Serviços de comunicação multimídia - SCM | 2021 |
| G.S.B ASSESSORIA LTDA | RETA | Preparação de documentos e serviços especializados de apoio administrativo não especificados anteriormente | 2024 |
| G-TUR TRANSPORTE RODOVIARIO PASSAGEIROS LTDA | TAPERA | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, sob regime de fretamento, intermunicipal, interestadual e internacional | 2001 |
| G&W LAVANDERIA EXPRESS LTDA | UBATUBA | Lavanderias | 2024 |
| G12 SERVICOS ADMINISTRATIVOS LTDA | CENTRO | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2023 |
| GABOARDI & KOCHE HOLDINGS GRUPO FAMILIAR LTDA | ROCIO GRANDE | Holdings de instituições não-financeiras | 2017 |
| GABRIELA DA SILVA FERNANDES LTDA | ENSEADA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2023 |
| GABRIELLE KLUG BACELLI LTDA | UBATUBA | Serviços de engenharia | 2026 |
| GABRIELLY FRITZ DE AMORIM LTDA | UBATUBA | Preparação de documentos e serviços especializados de apoio administrativo não especificados anteriormente | 2021 |