| EMPRESA BRASILEIRA DE CORREIOS E TELEGRAFOS | MARILIA | Atividades do Correio Nacional | 1998 |
| EMPRESA BRASILEIRA DE CORREIOS E TELEGRAFOS | CENTRO | Atividades do Correio Nacional | 1999 |
| EMPRESA GONTIJO DE TRANSPORTES S/A | FRAGATA | Serviços de reservas e outros serviços de turismo não especificados anteriormente | 2021 |
| EMPRESA JORNALISTICA JORNAL DA MANHA LTDA | CENTRO | Edição integrada à impressão de jornais diários | 1981 |
| EMPRESA MUNICIPAL DE MOBILIDADE URBANA DE MARILIA - EMDURB | CENTRO | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 1987 |
| EMPRESA PRINCESA DO NORTE S.A | CENTRO | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, intermunicipal em região metropolitana | 1983 |
| EMPRESA PRINCESA DO NORTE S.A | JOQUEI CLUBE | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, intermunicipal, exceto em região metropolitana | 2007 |
| EMPRESAS REUNIDAS PAULISTA DE TRANSPORTES LTDA | FRAGATA | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, intermunicipal, exceto em região metropolitana | 1993 |
| EMS INCORPORACOES LTDA | BETEL | Obras de fundações | 1993 |
| EMSILVA CONSTRUCOES LTDA | JARDIM TEOTONIO VILELA | Obras de alvenaria | 2026 |
| EMTL PEDROSA COBRANCAS E INFORMACOES CADASTRAIS LTDA | BARBOSA | Atividades de cobranças e informações cadastrais | 2020 |
| EMW ADMINISTRACAO, INVESTIMENTOS E PARTICIPACOES LTDA | JARDIM MARIA IZABEL | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 1997 |
| ENAG HOLDING LTDA | JARDIM PARATI | Compra e venda de imóveis próprios | 2023 |
| ENAM KIDS COMERCIO DE ROUPAS E ACESSORIOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2023 |
| ENCANTOS DE QUEIJO EMPORIO GOURMET LTDA | JARDIM NAZARETH | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2020 |
| ENCANTOS DE QUEIJO EMPORIO LTDA | JARDIM MARIA MARTHA | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2023 |
| ENCOL S/A ENGENHARIA COMERCIO E INDUSTRIA FALIDO | CENTRO | Construção de edifícios | 1993 |
| ENCONTROS DE CRAQUES ESPORTIVOS & EVENTOS LTDA | JARDIM TEOTONIO VILELA | Produção e promoção de eventos esportivos | 2022 |
| ENDOCAN BRASIL TECNOLOGIA E SAUDE LTDA | PARQUE DAS ESMERALDAS | Comércio atacadista de medicamentos e drogas de uso humano | 2026 |
| ENDOCARE SAUDE INTEGRADA LTDA | FRAGATA | Atividades de profissionais da área de saúde não especificadas anteriormente | 2022 |
| ENDOR SERVICOS ASSOCIADOS LTDA | JARDIM ALVORADA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2004 |
| ENDURANCE SECURITIZADORA S/A | JARDIM TANGARA | Securitização de créditos | 2021 |
| ENEDINO PAULO DA SILVA | TIVERON | Cultivo de amendoim | 2024 |
| ENEDINO PAULO DA SILVA | AREA RURAL DE MARILIA | Cultivo de amendoim | 2024 |
| ENERGICAP CAPACITORES DE ENERGIA LTDA | ALTO CAFEZAL | Fabricação de outros equipamentos e aparelhos elétricos não especificados anteriormente | 2002 |
| ENERGYGOOD COMPANY SERVICOS LTDA | JARDIM MARIA IZABEL | Locação de automóveis sem condutor | 2024 |
| ENERLUZ MANUTENCAO ELETRICA LTDA | CASCATA | Instalação e manutenção elétrica | 1999 |
| ENERTEC REPRESENTACOES COMERCIAIS LTDA | BANZATO | Representantes comerciais e agentes do comércio de mercadorias em geral não especializado | 2011 |
| ENFERMAGEM NURSE BRASIL LTDA | JARDIM ESPLANADA | Atividades de enfermagem | 2023 |
| ENFK COMERCIAL LTDA | JARDIM MARIA MARTHA | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2007 |
| ENG-X CONSTRUTORA LTDA | DISTRITO INDUSTRIAL | Construção de edifícios | 2020 |
| ENGAJA MAIS DIGITAL LTDA | JARDIM TANGARA | Marketing direto | 2025 |
| ENGECLINMED ASSISTENCIA TECNICA DE EQUIPAMENTOS MEDICOS E HOSPITALARES LTDA | JARDIM APARECIDA NASSER | Manutenção e reparação de aparelhos eletromédicos e eletroterapêuticos e equipamentos de irradiação | 2020 |
| ENGECOLD ENGENHARIA TERMICA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 2011 |
| ENGECOR ENGENHARIA E CONSTRUCAO DE MARILIA LTDA | NOVA MARILIA | Serviços de engenharia | 1990 |
| ENGENHAR AR CONDICIONADO E REFRIGERACAO LTDA | EXPEDICIONARIO ALBERTO HERRERA | Manutenção e reparação de máquinas e aparelhos de refrigeração e ventilação para uso industrial e comercial | 2020 |
| ENGETECH BRASIL LTDA | ANTENOR BARION | Construção de edifícios | 2023 |
| ENGETRES INCORPORADORA LTDA | FRAGATA | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 1982 |
| ENGETRIN ENGENHARIA E CONSTRUCOES LTDA | SANTA GERTRUDES | Construção de edifícios | 1999 |
| ENGETRIZ ENGENHARIA DE FUNDACOES LTDA | VILA OPERARIA ALIMENTACAO II | Obras de fundações | 2019 |
| ENGOMADINHOS KIDS COMERCIO DE ROUPAS E SERVICOS DE BELEZA LTDA | JARDIM MARIA IZABEL | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2026 |
| ENGSUGAR ENGENHARIA S.A | BOA VISTA | Serviços de engenharia | 2007 |
| ENICILIO CARLI | CASCATINHA 136 | Criação de bovinos para leite | 2007 |
| ENIO NEVES SOCIEDADE INDIVIDUAL DE ADVOCACIA | JARDIM TANGARA | Serviços advocatícios | 2022 |
| ENRICO GATTI TECH LTDA | THEREZA BASSAN DE ARGOLLO FERRAO | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2025 |
| ENRICO LEONARDO ORLANDO CONSULTORIA EM TECNOLOGIA DA INFORMACAO LTDA | FRAGATA | Desenvolvimento e licenciamento de programas de computador customizáveis | 2021 |
| ENRIJO LTDA | JARDIM VITORIA | Comércio varejista de cosméticos, produtos de perfumaria e de higiene pessoal | 1992 |
| ENS COMERCIO IMPORTACAO E EXPORTACAO LTDA | JARDIM CRISTO REI | Comércio varejista de ferragens e ferramentas | 2017 |
| ENSINO MEDICO OAF LTDA | ALTO CAFEZAL | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2023 |
| ENSOPI PARTICIPACOES LTDA | RESIDENCIAL DE RECREIO MARIA IZABEL | Holdings de instituições não-financeiras | 2022 |