| ELOI CELULARES LTDA | CENTRO | Comércio varejista especializado de equipamentos de telefonia e comunicação | 2025 |
| ELOIR VALSICHI LUCINDO | MONTE ALEGRE | Criação de frangos para corte | 2006 |
| ELOY THEODORO JOSE DO PRADO LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2023 |
| ELPA CONSULTORIA LTDA | JARDIM CENTRAL | Serviços de agronomia e de consultoria às atividades agrícolas e pecuárias | 1999 |
| ELUMA PETS LTDA | VILA PAULISTA | Fabricação de outros produtos de metal não especificados anteriormente | 2026 |
| ELUS DIGITAL INTERMEDIACAO DE NEGOCIOS LTDA | CENTRO | Atividades de intermediação e agenciamento de serviços e negócios em geral, exceto imobiliários | 2023 |
| ELVIRA CLARA ALVES CORREA | BAIRRO FAXINAL | Horticultura, exceto morango | 2008 |
| ELY ASSETS & BUSINESS CONSULTORIA LTDA | VILA NOGUEIRA | Consultoria em tecnologia da informação | 2020 |
| ELZA APARECIDA DORADO DE BARROS SOCIEDADE UNIPESSOAL LTDA | JARDIM DOM HENRIQUE | Restaurantes e similares | 2025 |
| ELZA ROSA DE SOUZA HALLAI | MONTE ALEGRE | Criação de frangos para corte | 2007 |
| ELZIO RODRIGUES DUARTE | ZONA RURAL | Cultivo de eucalipto | 2008 |
| ELZO DOMINGOS MOLINA | ZONA RURAL | Criação de bovinos para corte | 2014 |
| EM CONSTRUCOES LTDA | VILA PINHEIRO-TANQUINHO | Obras de alvenaria | 2025 |
| EMANUEL RICARDO BITTENCOURT DOS SANTOS | AREA RURAL DE BOTUCATU | Horticultura, exceto morango | 2020 |
| EMANUEL RODRIGO BEZERRA GIMENEZ LTDA | VILA PAULISTA | Comércio varejista de materiais de construção não especificados anteriormente | 2017 |
| EMANUEL SANTOS SOCIEDADE INDIVIDUAL DE ADVOCACIA | PARQUE RESIDENCIAL VINTE E QUATRO DE MAIO | Serviços advocatícios | 2023 |
| EMBAUBA INOVA SIMPLES (I.S.) | UNESP CAMPUS DE BOTUCATU | Pesquisa e desenvolvimento experimental em ciências físicas e naturais | 2025 |
| EMBRAER S.A | AEROPORTO | Fabricação de aeronaves | 2006 |
| EMCAU ARQUITETURA LTDA | JARDIM PARAISO | Serviços de arquitetura | 2026 |
| EME4 INDUSTRIA DE PLASTICOS LTDA | CHACARA FLORESTA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 1996 |
| EMERGEAGRO SERVICOS AGRICOLAS LTDA | JARDIM AEROPORTO | Pesquisa e desenvolvimento experimental em ciências físicas e naturais | 2020 |
| EMERSON ALVES DE MOURA | ZONA RURAL | Horticultura, exceto morango | 2019 |
| EMERSON BIAZON REPRESENTACOES LTDA | VILA BELA VISTA | Representantes comerciais e agentes do comércio de produtos alimentícios, bebidas e fumo | 2016 |
| EMERSON DE PAIVA SIQUEIRA E OUTRO | AREA RURAL DE BOTUCATU | Cultivo de frutas de lavoura permanente não especificadas anteriormente | 2022 |
| EMERSON GERALDO GOMES | PORTO SAID | Pesca de peixes em água doce | 2012 |
| Emerson Polato Sociedade Individual de Advocacia | VILA DOS LAVRADORES | Serviços advocatícios | 2022 |
| EMERSON PROENCA CONSULTORIA LTDA | JARDIM PARAISO | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2019 |
| EMILIANO ABRAAO SAMPAIO NOVAIS | RURAL | Cultivo de milho | 2001 |
| EMILIANO ABRAAO SAMPAIO NOVAIS | RURAL | Cultivo de cana-de-açúcar | 2007 |
| EMILIE CRISTINA SIMONETTI LOPES FISIOTERAPEUTA LTDA | JARDIM PLANALTO | Atividades de fisioterapia | 2025 |
| EMILIO AUGUSTO PILAN JUNIOR LTDA | CENTRO | Cabeleireiros, manicure e pedicure | 2015 |
| EMILIO CARLOS CURCELLI | FAXINAL | Criação de bovinos para corte | 2014 |
| EMILIO CARLOS LONGO | ANHUMAS | Criação de bovinos para corte | 2008 |
| EMILIO CASSETTARI LTDA | VILA CARMELO | Atividade odontológica | 2021 |
| EMILLY GABRIELE MENZEN | ZONA RURAL | Horticultura, exceto morango | 2023 |
| EMILY CRISTINA CORREA DA SILVA SERVICOS ODONTOLOGICOS LTDA | JARDIM DONA CAROLINA | Atividade odontológica | 2025 |
| EMPATIA MUNDOMIX LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2020 |
| EMPATIA MUNDOMIX LTDA | JARDIM PARAISO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2021 |
| EMPORIO CANECAO LTDA | VILA SAO LUCIO | Comércio varejista de bebidas | 2022 |
| EMPORIO CFG BOTUCATU LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2026 |
| EMPORIO DA LINGUICA BOTUCATU LTDA | VILA CARMELO | Fornecimento de alimentos preparados preponderantemente para consumo domiciliar | 2025 |
| EMPORIO DA TILAPIA LTDA | VILA SAO LUCIO | Restaurantes e similares | 2020 |
| EMPORIO DA TILAPIA LTDA | CENTRO | Restaurantes e similares | 2021 |
| EMPORIO DE PRODUTOS NATURAIS SAO JOSE DE BOTUCATU LTDA | VILA PADOVAN | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2010 |
| EMPORIO INFANTIL COMERCIO DE ALIMENTOS LTDA | VILA SAO LUCIO | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2026 |
| EMPORIO PET & REPET LTDA | JARDIM ITAMARATI | Comércio varejista de animais vivos e de artigos e alimentos para animais de estimação | 2021 |
| EMPORIO SABORES DA SERRA LTDA | PARK RESIDENCIAL CONVIVIO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2015 |
| EMPORIO SERRANA LTDA - EM RECUPERACAO JUDICIAL | JARDIM PARAISO II | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2022 |
| EMPREENDIMENTO ESTANCIA FUNARI SCP | RUBIAO JUNIOR | Loteamento de imóveis próprios | 2018 |
| EMPREITEIRA QUATRO MORROS LTDA | CHACARA RECREIO DO HAVAI | Construção de edifícios | 2018 |
Malha municipal: IBGE