| SINDICATO DOS EMPREGADOS NO COMERCIO DE BOTUCATU | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1970 |
| SINDICATO DOS ENGENHEIROS NO ESTADO DE SAO PAULO | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 2011 |
| SINDICATO DOS SERVIDORES PUBLICOS MUNICIPAIS BOTUCATU | VILA SAO LUCIO | Atividades de organizações sindicais | 1992 |
| SINDICATO DOS TRAB. NAS IND. DA CONST. MOB. DE BOTUCATU | VILA SAO LUCIO | Atividades de organizações sindicais | 1990 |
| SINDICATO DOS TRABALHADORES E EMPREGADOS RURAIS DE BOTUCATU, ANHEMBI, ITATINGA E BOFETE | VILA SAO LUCIO | Atividades de organizações sindicais | 1986 |
| SINDICATO DOS TRABALHADORES EM TRANSPORTES RODOVIARIOS DE SAO MANUEL E REGIAO | VILA DOS LAVRADORES | Atividades de organizações sindicais | 2002 |
| SINDICATO RURAL DE BOTUCATU | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1970 |
| SINDICATO TRAB IND QUIMICAS E FARM DE BOTUCATU E REGIAO | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1991 |
| SINDICATO TRAB NAS INDUSTRIAS MET MEC MAT ELET BOTUCATU | VILA DOS LAVRADORES | Atividades de organizações sindicais | 1973 |
| SINODO SUDOESTE PAULISTA - SDP | CENTRO | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2020 |
| SINTER TOOLS IMPORTACAO E EXPORTACAO DE FERRAMENTAS E ELETRONICOS LTDA | VILA CASA BRANCA | Comércio varejista de ferragens e ferramentas | 2004 |
| SINVAL LUIZ FURLAN E OUTROS | ZONA RURAL | Cultivo de cana-de-açúcar | 2021 |
| SINVAL LUIZ FURLAN E OUTROS | AREA RURAL DE BOTUCATU | Cultivo de cana-de-açúcar | 2022 |
| SINVAL LUIZ FURLAN E OUTROS | ZONA RURAL | Cultivo de cana-de-açúcar | 2022 |
| SINVAL LUIZ FURLAN E OUTROS | ZONA RURAL | Cultivo de cana-de-açúcar | 2022 |
| SIPIAO DISTRIBUIDORA DE PECAS AUTOMOTIVAS LTDA | JARDIM ITAMARATI | Comércio por atacado de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2017 |
| SIQUEIRA PARTICIPACOES E ADMINISTRACAO LTDA | CENTRO | Compra e venda de imóveis próprios | 2026 |
| SIQUEIRA & SIQUEIRA COMERCIO DE FERRO LTDA | VILA ASSUMPCAO | Comércio varejista de ferragens e ferramentas | 2017 |
| SIRINAICA INDUSTRIA E COMERCIO DE PLASTICOS LTDA | JARDIM CENTENARIO | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2008 |
| SISTEMA IMAGEM TECNOLOGIA DA INFORMACAO LTDA | BAIRRO ALTO | Suporte técnico, manutenção e outros serviços em tecnologia da informação | 2008 |
| SISTEMA PREVER BRASIL LTDA | CHACARA FLORESTA | Consultoria em tecnologia da informação | 2018 |
| SISTEMAS ELETRONICOS DE TRANSMISSAO DE DADOS DO BRASIL LTDA | CENTRO | Desenvolvimento e licenciamento de programas de computador customizáveis | 2018 |
| SISTEMAX TELECOMUNICACOES LTDA | VILA NOVA BOTUCATU | Comércio atacadista de equipamentos de informática | 2002 |
| SITIO ROMPE MATO | AREA RURAL DE BOTUCATU | Cultivo de cana-de-açúcar | 2025 |
| SIVALDO PEDRO DA SILVA | LOTEAMENTO RECREIO BARRA DO CAPIVARA (VITORIANA) | Horticultura, exceto morango | 2024 |
| SKI SORVETES LTDA | VILA DOS LAVRADORES | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2020 |
| SKW INDUSTRIAL LTDA | RESIDENCIAL PLAZA MARTIN | Fabricação de peças e acessórios para os sistemas de marcha e transmissão de veículos automotores | 2013 |
| SKYMETAL SOLUTIONS LTDA | LOTEAMENTO JARDIM ELDORADO | Serviços de usinagem, tornearia e solda | 2024 |
| SKYROPE COMERCIO DE PRODUTOS ESPORTIVOS LTDA | VILA SAO JUDAS THADEU | Comércio atacadista de outros equipamentos e artigos de uso pessoal e doméstico não especificados anteriormente | 2023 |
| SL REAL ESTATE PROPERTY LTDA | JARDIM BOM PASTOR | Compra e venda de imóveis próprios | 2024 |
| SM ANDRE LTDA | JARDIM CAMBUI | Holdings de instituições não-financeiras | 2025 |
| SMART PLUS EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS LTDA | VILA SAO LUCIO | Loteamento de imóveis próprios | 2006 |
| SMART PRINT GRAFICA DIGITAL LTDA | CENTRO | Atividades de pós-produção cinematográfica, de vídeos e de programas de televisão não especificadas anteriormente | 2017 |
| SMART SOLUTIONS TO BUSINESS LTDA | RECANTO ARVORE GRANDE | Suporte técnico, manutenção e outros serviços em tecnologia da informação | 2014 |
| SMART TEC CONSULTORIA EMPRESARIAL LTDA | JARDIM PARAISO | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2015 |
| SMARTCICLO LAVANDERIA LTDA | VILA PAULISTA | Lavanderias | 2026 |
| SMARTPEC SOLUCOES PARA O AGRONEGOCIO LTDA | COLINAS DO PARAISO | Serviços de agronomia e de consultoria às atividades agrícolas e pecuárias | 2025 |
| SMS SUPPLY CHAIN SOLUTIONS LTDA | JARDIM PARAISO | Desenvolvimento e licenciamento de programas de computador customizáveis | 2022 |
| SNACKS MOLECADA UTILIDADES E ALIMENTOS LTDA | VILA MARIA | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2009 |
| SOARES & ISSA RESTAURANTE LTDA | VILA REAL | Restaurantes e similares | 2023 |
| SOBRAL E HIRAMA LTDA | CENTRO | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 2019 |
| SOCENAM SERVICOS MEDICOS LTDA | SOCIEDADE HIPICA DE BOTUCATU | Atividade médica ambulatorial com recursos para realização de exames complementares | 2023 |
| SOCIEDADE AGRICOLA SANTA ADELIA S/S | CENTRO | Cultivo de cana-de-açúcar | 1988 |
| SOCIEDADE AMIGOS DE VILA SONIA | VILA SONIA | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1982 |
| SOCIEDADE AMIGOS DO VALE DO SOL | VALE DO SOL | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1981 |
| SOCIEDADE ASSISTENCIAL CASA DO CAMINHO | VILA SONIA | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1986 |
| SOCIEDADE BOTUCATUENSE DE PSICOLOGIA ANALITICA | VILA CASA BRANCA | Atividades de psicologia e psicanálise | 2021 |
| SOCIEDADE BRASILEIRA DE RESTAURACAO ECOLOGICA-SOBRE | ALTOS DO PARAISO | Outras atividades associativas profissionais | 2016 |
| SOCIEDADE CULTURAL DENADAI LTDA | CENTRO | Ensino de dança | 2013 |
| SOCIEDADE DE ADVOGADOS GABRIEL RIBEIRO | CENTRO | Serviços advocatícios | 2015 |