| R FASANARO NUTRICAO ANIMAL LTDA | JARDIM REGINA | Promoção de vendas | 2018 |
| R. FREITAS CONSTRUTORA LTDA | VILA SAO LUCIO | Construção de edifícios | 2011 |
| R. GONCALVES CALCADOS E CONFECCOES LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2011 |
| R&H HOLDING LTDA | COLINAS DO PARAISO | Holdings de instituições não-financeiras | 2021 |
| R K D' ALMEIDA PECAS AGRICOLAS LTDA | VILA SAO LUCIO | Comércio atacadista de máquinas, aparelhos e equipamentos para uso agropecuário; partes e peças | 2014 |
| R.K.M CONSTRUCOES LTDA | VILA CARMELO | Construção de edifícios | 2013 |
| R.K.M CONSTRUCOES LTDA | PORTAL DAS BRISAS | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2019 |
| R.K.M CONSTRUCOES LTDA | PORTAL DAS BRISAS | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2020 |
| R L GAMBARATO ENGENHARIA LTDA | VILA DOS LAVRADORES | Serviços de engenharia | 2025 |
| R LEITE CARVALHO CONTABILIDADE E ASSESSORIA FINANCEIRA LTDA | JARDIM ITAMARATI | Atividades de contabilidade | 2023 |
| R&M COMERCIO DE TINTAS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de tintas e materiais para pintura | 2025 |
| R. M. DA SILVA UNIPESSOAL LTDA | JARDIM PARAISO | Higiene e embelezamento de animais domésticos | 2015 |
| R.M.M.J. COMERCIO ATACADISTA LTDA | BOA VISTA | Comércio atacadista especializado em outros produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2014 |
| R. MARUBAYASHI AGROPECUARIA LTDA | VILA MARIA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2026 |
| R NONATO DE FREITAS MOREIRA JUNIOR LTDA | JARDIM PARAISO | Atividades de atenção ambulatorial não especificadas anteriormente | 2019 |
| R.O.S - UTILIDADES LTDA | RESIDENCIAL BEM-TE-VI II | Comércio varejista de outros artigos de uso pessoal e doméstico não especificados anteriormente | 2025 |
| R. PACTO LTDA | CENTRO | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 2015 |
| R PETRIAGGI DIAS ACADEMIA LTDA | VILA SAO LUCIO | Atividades de condicionamento físico | 2019 |
| R & R ADMINISTRADORA DE IMOVEIS LTDA | JARDIM PARAISO | Corretagem no aluguel de imóveis | 2021 |
| R R B F BAR E HOSPEDAGEM LTDA | CENTRO | Bares e outros estabelecimentos especializados em servir bebidas, com entretenimento | 2024 |
| R&R CLIMATIZACAO E SOLUCOES EM AR CONDICIONADO LTDA | CENTRO | Instalação e manutenção de sistemas centrais de ar condicionado, de ventilação e refrigeração | 2026 |
| R.R ESTOFADOS COMERCIO VAREJISTA DE MOVEIS LTDA | VILA NOVA BOTUCATU | Comércio varejista de móveis | 2025 |
| R&S INDUSTRIA E COMERCIO DE ALIMENTOS PET LTDA | CONJ. HAB. ENG. FRANCISCO BLASI | Fabricação de alimentos para animais | 2022 |
| R. S. SCAPOL ADMINISTRACAO E CORRETAGEM DE SEGUROS LTDA | CENTRO | Corretores e agentes de seguros, de planos de previdência complementar e de saúde | 2015 |
| R. SILVA MACHADO VENDAS E SERVICOS LTDA | VILA SAO JOSE | Promoção de vendas | 2025 |
| R & V SERVICOS MEDICOS S/S | JARDIM SANTA THEREZA | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2004 |
| R VIEIRA SERVICOS ADMINISTRATIVOS LTDA | JARDIM PARAISO II | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2026 |
| R2D CONSULTORIA AGRICOLA LTDA | JARDIM AEROPORTO | Serviços de agronomia e de consultoria às atividades agrícolas e pecuárias | 2021 |
| R2M CONSULTORIA E CAPACITACAO LTDA | VILA SAO LUCIO | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2016 |
| R2T SERVICOS EMPRESARIAIS LTDA | CENTRO | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2025 |
| R4D BIOTECH PESQUISA E DESENVOLVIMENTO EM SAUDE LTDA | JARDIM AEROPORTO | Fabricação de medicamentos para uso veterinário | 2019 |
| R4D BIOTECH PESQUISA E DESENVOLVIMENTO EM SAUDE LTDA | VILA SAO LUCIO | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2022 |
| RA ARAUJO CONSULTORIA E GESTAO EMPRESARIAL LTDA | VILA DOS LAVRADORES | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2026 |
| RAC CALCADOS E CONFECCOES LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2026 |
| RACHEL PAULO FERRONATO SOCIEDADE INDIVIDUAL DE ADVOCACIA | SOCIEDADE HIPICA DE BOTUCATU | Serviços advocatícios | 2024 |
| RACING PRO COMPANY LTDA | LIVIA | Agenciamento de profissionais para atividades esportivas, culturais e artísticas | 2026 |
| RAD ADMINISTRACAO E EMPREENDIMENTOS LTDA | CENTRO | Compra e venda de imóveis próprios | 1994 |
| RADANEST SOLUCOES MEDICAS LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial com recursos para realização de procedimentos cirúrgicos | 2021 |
| RADIO CLUBE DE BOTUCATU LTDA | VILA PAULISTA | Atividades de rádio | 1988 |
| RADIO EMISSORA DE BOTUCATU LTDA | VILA DOS LAVRADORES | Atividades de rádio | 1966 |
| RADIO MUNICIPALISTA DE BOTUCATU LTDA | CENTRO | Atividades de rádio | 1983 |
| RADIO PIONEIRA DE BOTUCATU FM STEREO LTDA | VILA ASSUMPCAO | Atividades de rádio | 1988 |
| RADIOLOGIA ODONTOLOGICA DE BOTUCATU LTDA | CENTRO | Serviços de diagnóstico por imagem com uso de radiação ionizante, exceto tomografia | 2023 |
| RADIORAL LTDA | CENTRO | Serviços de diagnóstico por imagem com uso de radiação ionizante, exceto tomografia | 1996 |
| RAFA REGIS TREINAMENTOS LTDA | ALTO | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2021 |
| RAFAEL ALMEIDA DE PAULA | ZONA RURAL | Criação de bovinos para corte | 2025 |
| RAFAEL ALVES DOMINGUES E OUTRA | JARDIM AEROPORTO | Horticultura, exceto morango | 2007 |
| RAFAEL AUGUSTO DE LIMA DALIO SOCIEDADE INDIVIDUAL DE ADVOCACIA | RESIDENCIAL OURO VERDE | Serviços advocatícios | 2018 |
| RAFAEL BASSETTO | DISTRITO INDUSTRIAL | Criação de bovinos, exceto para corte e leite | 2024 |
| RAFAEL CASSIOLATO DE OLIVEIRA | MONTE ALEGRE | Criação de bovinos para corte | 2007 |