| SARCI AGENCIAMENTO MARITIMO LTDA | ROCIO PEQUENO | Atividades de agenciamento marítimo | 2010 |
| SARITA DE SOUZA LTDA | ENSEADA | Restaurantes e similares | 2023 |
| SARITA DE SOUZA LTDA | ENSEADA | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2023 |
| SAUDE VISAO LTDA | CENTRO | Atividades de profissionais da área de saúde não especificadas anteriormente | 2012 |
| SAUDMAR EMPREENDIMENTOS S/C LTDA | UBATUBA | Corretagem no aluguel de imóveis | 1994 |
| SAURO COMERCIO E SERVICO AUTOMOTIVO LTDA | UBATUBA | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2020 |
| SB CONSTRUCOES LTDA | PRAIA DO ERVINO | Construção de edifícios | 2009 |
| SBM LOGISTICA OPERACOES PORTUARIAS LTDA | CENTRO | Aluguel de máquinas e equipamentos para construção sem operador, exceto andaimes | 2024 |
| SBM MAQ CALDEIRARIA E MONTAGEM EM GERAL LTDA | IPEROBA | Serviços de usinagem, tornearia e solda | 2022 |
| SBM SOLDA E MANUTENCOES LTDA | CENTRO | Serviços de usinagem, tornearia e solda | 2025 |
| SC IVANOSKI ALIMENTOS LTDA | UBATUBA | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2024 |
| SCANDELARI TOPOGRAFIA LTDA | PAULAS | Atividades de estudos geológicos | 2026 |
| SCARPA BUSINESS ASSESSORIA EMPRESARIAL LTDA | ROCIO GRANDE | Atividades de cobranças e informações cadastrais | 2022 |
| SCHEMMEL COMUNICACAO VISUAL LTDA | CENTRO | Impressão de material para uso publicitário | 2023 |
| SCHER-MAQ OPERACOES E SERVICOS DE MAQUINAS PESADAS LTDA | UBATUBA | Aluguel de outras máquinas e equipamentos comerciais e industriais não especificados anteriormente, sem operador | 2024 |
| SCHER-MAQ SERVICOS DE CARGA E DESCARGA LTDA | UBATUBA | Carga e descarga | 2022 |
| SCHLICHT INTERMEDIACAO E AGENCIAMENTO LTDA | UBATUBA | Atividades de intermediação e agenciamento de serviços e negócios em geral, exceto imobiliários | 2026 |
| SCHROEDER SERVICOS EMPRESARIAIS LTDA | ROCIO PEQUENO | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2022 |
| SCHUTTER DO BRASIL LTDA | CENTRO | Testes e análises técnicas | 2009 |
| SCPAR PORTO DE SAO FRANCISCO DO SUL S.A | CENTRO | Administração da infra-estrutura portuária | 2017 |
| SCS ARMAZENS GERAIS LTDA | ACARAI | Armazéns gerais - emissão de warrant | 2016 |
| SCS - COMERCIAL E SERVICOS QUIMICOS LTDA | ACARAI | Comércio atacadista de outros produtos químicos e petroquímicos não especificados anteriormente | 2002 |
| SCS - COMERCIAL E SERVICOS QUIMICOS LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, municipal | 2026 |
| SCS GERADORES LTDA | ACARAI | Comércio atacadista de Máquinas e equipamentos para uso industrial; partes e peças | 2015 |
| SCS SERVICOS LTDA | ACARAI | Atividades de intermediação e agenciamento de serviços e negócios em geral, exceto imobiliários | 1999 |
| SD INCORPORADORA LTDA | ENSEADA | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2020 |
| SDB COMERCIO DE ALIMENTOS LTDA | SAO JOSE DO ACARAI | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - supermercados | 2020 |
| SEA LINE AGENCIA MARITIMA LTDA | CENTRO | Atividades de despachantes aduaneiros | 1991 |
| SEA PACIFICO LTDA | AGUA BRANCA | Holdings de instituições não-financeiras | 2023 |
| SEA WAY DESPACHOS ADUANEIROS E ASSESSORIA COMERCIAL NA IMPORTACAO E EXPORTACAO LTDA | CENTRO | Atividades de despachantes aduaneiros | 1998 |
| SEABRIDGE LTDA | ROCIO GRANDE | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2024 |
| SEACAN SERVICOS MEDICOS LTDA | UBATUBA | Atividade médica ambulatorial com recursos para realização de procedimentos cirúrgicos | 2012 |
| SEAPORT SERVICOS MARITIMOS E PORTUARIOS LTDA | CENTRO | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 2019 |
| SEATRADE OPERADORES PORTUARIOS LTDA | CENTRO | Atividades de agenciamento marítimo | 2021 |
| SEATRADE SERVICOS PORTUARIOS E LOGISTICOS LTDA | CENTRO | Atividades de agenciamento marítimo | 1988 |
| SEATRADE SERVICOS PORTUARIOS E LOGISTICOS LTDA | ROCIO GRANDE | Atividades de agenciamento marítimo | 2015 |
| SEATRANSPORT AGENCIAMENTOS MARITIMOS LTDA | CENTRO | Atividades de agenciamento marítimo | 1998 |
| SEGTRAB CONSULTORIA EM SEGURANCA DO TRABALHO LTDA | CENTRO | Outras atividades profissionais, científicas e técnicas não especificadas anteriormente | 2013 |
| SEHA PROJETOS LTDA | IPEROBA | Serviços de engenharia | 2017 |
| SEKALOG TRANSPORTES LTDA | RETA | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2015 |
| SELENE IMPORTS LTDA | UBATUBA | Comércio varejista de artigos de iluminação | 2022 |
| SELMA COSTA UTILIDADE LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2025 |
| SELMA COSTA VARIEDADES LTDA | ENSEADA | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2025 |
| SENSI AMBIENTAL LTDA | RETA | Gestão de redes de esgoto | 2020 |
| SEOM LTDA | UBATUBA | Atividades de produção cinematográfica, de vídeos e de programas de televisão não especificadas anteriormente | 2019 |
| SER SOCIAL - CONSULTORIA, PROJETOS E DESENVOLVIMENTO SOCIAL LTDA | ROCIO GRANDE | Serviços de assistência social sem alojamento | 2026 |
| SERGIO ONESTI IMOVEIS LTDA | PRAIA GRANDE | Compra e venda de imóveis próprios | 1979 |
| SERGIO PORPERIO DOS SANTOS LTDA | PAULAS | Serviços de usinagem, tornearia e solda | 2014 |
| SERRA VEICULOS MULTIMARCAS LTDA | IPEROBA | Comércio a varejo de automóveis, camionetas e utilitários usados | 2023 |
| SERRARIA PERSUHN LTDA | RETA | Serrarias com desdobramento de madeira em bruto | 2004 |