| ELIZANGELA DE OLIVEIRA PONTE FAGUNDES SERVICOS MEDICOS LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2002 |
| ELLCA 2 SERVICOS & LOCACOES LTDA | CENTRO | Instalação e manutenção elétrica | 2018 |
| ELO CORRETORA DE SEGUROS LTDA | CENTRO | Corretores e agentes de seguros, de planos de previdência complementar e de saúde | 1992 |
| ELORA PRODUTOS E SERVICOS LTDA | CANTAGALO | Representantes comerciais e agentes do comércio de mercadorias em geral não especializado | 2021 |
| EMA PATRIMONIAL LTDA | CIDADE NOVA | Atividades de administração de fundos por contrato ou comissão | 2022 |
| EMBALAGENS DE PLASTICO TR LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos de papelaria | 2026 |
| EMBALAGENS TRES RIOS INDUSTRIA E COMERCIO LTDA | MOURA BRASIL | Fabricação de embalagens de material plástico | 2009 |
| EME4 INDUSTRIA DE PLASTICOS LTDA | BARRINHA | Fabricação de artefatos de material plástico para usos industriais | 2010 |
| EMOTION COMERCIO DE ROUPAS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2006 |
| EMPILHAFORT - LOCACAO E MANUTENCAO DE EMPILHADEIRAS LTDA | VILA ISABEL | Aluguel de outras máquinas e equipamentos comerciais e industriais não especificados anteriormente, sem operador | 2022 |
| EMPILHAMAQ LOCACAO DE EMPILHADEIRAS LTDA | VILA ISABEL | Aluguel de imóveis próprios | 1998 |
| EMPORIO BOA VISTA TR LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2019 |
| EMPORIO DO PAO PANIFICADORA E DISTRIBUIDORA DE BEBIDAS E PRODUTOS ALIMENTICIOS EM GERAL LTDA | CENTRO | Fabricação de produtos de padaria e confeitaria com predominância de produção própria | 2010 |
| EMPORIUM PADARIA E DELICATESSEN LTDA | CENTRO | Fabricação de produtos de padaria e confeitaria com predominância de produção própria | 2025 |
| EMPREENDIMENTOS HOTELEIROS GARCAS LTDA | MOURA BRASIL | Motéis | 1970 |
| EMPREENDIMENTOS SALLES & PRADO LTDA | NOVA NITEROI | Coleta de resíduos não-perigosos | 2021 |
| EMPREITECH COMERCIO E SERVICO LTDA | NOVA NITEROI | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2021 |
| EMPREITEIRA DE OBRAS MARCLEY E MARLON LTDA | CENTRO | Obras de alvenaria | 2014 |
| EMPREITEIRA DUARTE TRIRRIENSE LTDA | JARDIM PRIMAVERA | Construção de edifícios | 1996 |
| EMPREITEIRA HELON LTDA | VILA ISABEL | Construção de edifícios | 2005 |
| EMPRESA BRASILEIRA DE CORREIOS E TELEGRAFOS | CENTRO | Atividades do Correio Nacional | 1974 |
| EMPRESA BRASILEIRA DE CORREIOS E TELEGRAFOS | CENTRO | Atividades do Correio Nacional | 1995 |
| EMPRESA BRASILEIRA DE INT TEC E CIENCIA LTDA | CENTRO | Pesquisas de mercado e de opinião pública | 2021 |
| EMPRESA DE ASSIST TECNICA E EXTENSAO RURAL DO ESTADO RJ | CENTRO | Atividades de apoio à agricultura não especificadas anteriormente | 1977 |
| EMPRESA DE CIMENTOS LIZ S.A | WERNECK MARINE | Fabricação de cimento | 1986 |
| EMPRESA JORNALISTICA PALAN LIMITADA | CENTRO | Impressão de livros, revistas e outras publicações periódicas | 1982 |
| EN ENGENHARIA LIMITADA | CANTAGALO | Comércio varejista de material elétrico | 2021 |
| ENDURO TR LTDA | CENTRO | Marketing direto | 2026 |
| ENDUROMOTOS PECAS E ACESSORIOS PARA MOTOS LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de motocicletas e motonetas novas | 2000 |
| ENFOQUE CONSULTORIA E ASSESSORIA RURAL JUNIOR | TRIANGULO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2002 |
| ENGENHARIA ULTRA MAX DE TRES RIOS LTDA | VILA ISABEL | Serviços de engenharia | 2018 |
| ENTIDADE FILANTROPICA NOSSA SENHORA DAS GRA | VILA ISABEL | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2001 |
| ENTRE RIOS FOTOS LTDA | CENTRO | Atividades de produção de fotografias, exceto aérea e submarina | 1996 |
| ENTRE RIOS HOTEL LTDA | PRIMEIRO | Hotéis | 1977 |
| ENTRERRIENSE FUTEBOL CLUBE | CENTRO | Clubes sociais, esportivos e similares | 1978 |
| ENTRERRIENSE JORNAL LTDA | CENTRO | Impressão de livros, revistas e outras publicações periódicas | 2002 |
| EPI VOLUNTEER BRASIL | VILA ISABEL | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2026 |
| EPIFANIO & SOUSA DISTRIBUIDORA E COMERCIO LTDA | MONTE CASTELO | Comércio varejista de bebidas | 2023 |
| ESG SEGURANCA DO TRABALHO, CURSOS E TREINAMENTOS LTDA | VILA ISABEL | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2024 |
| ESL COMERCIO DE ALIMENTOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2015 |
| ESPACO DE FESTAS E EVENTOS TOCA DO TUCANO LTDA | TRIANGULO | Casas de festas e eventos | 2021 |
| ESPACO DO CORPO BOUTIQUE LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 1990 |
| ESPACO FITNESS TRES RIOS LTDA | CENTRO | Atividades de condicionamento físico | 2024 |
| ESPETTO BEACH DELIVERY LTDA | TRIANGULO | Fornecimento de alimentos preparados preponderantemente para consumo domiciliar | 2023 |
| ESPETTO BEACH LTDA | TRIANGULO | Restaurantes e similares | 2022 |
| ESPETTO STEAKHOUSE CERVEJARIA E ESPETERIA LTDA | TRIANGULO | Restaurantes e similares | 2017 |
| ESPETTO STEAKHOUSE DELIVERY LTDA | TRIANGULO | Fornecimento de alimentos preparados preponderantemente para consumo domiciliar | 2021 |
| ESPIRITO SANTO E LIMA SOCIEDADE DE ADVOGADOS | CENTRO | Serviços advocatícios | 2023 |
| ESPORTE CLUBE AREAL | AREAL | Clubes sociais, esportivos e similares | 1980 |
| ESQUADRA DIGITAL LTDA | VILA ISABEL | Atividades de monitoramento de sistemas de segurança eletrônico | 2018 |