| MINISTERIO COMUNIDADE EVANGELICA CRISTO PARA TODOS BONITO MS | DONARIA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2024 |
| MINISTERIO INTERNACIONAL JESUS REI DA GLORIA BONITO MS | CENTRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2024 |
| MIOTTO & RODRIGUES LTDA | ZONA RURAL | Cultivo de soja | 2021 |
| MIRAGE AERO COMBUSTIVEIS LTDA | AEROPORTO MUNICIPAL DE BONITO | Comércio varejista de combustíveis para veículos automotores | 2008 |
| MITERRA RESTAURANTE LTDA | CENTRO | Restaurantes e similares | 2025 |
| MITRA DIOCESANA DE JARDIM | NÃO INFORMADO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1981 |
| MJ AGROPECUARIA LTDA | ZONA RURAL | Cultivo de soja | 2019 |
| MJ CONSTRUCOES LTDA | CENTRO | Construção de edifícios | 2020 |
| MJE SERVICO IMOBILIARIO LTDA | CENTRO | Corretagem na compra e venda e avaliação de imóveis | 2021 |
| MK GESTAO ADMINISTRATIVA LTDA | JARDIM ANDREIA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2025 |
| MKL CONSTRUTORA LTDA | VILA CHEROGAMI | Serviços especializados para construção não especificados anteriormente | 2026 |
| MONTANA INDUSTRIA E COMERCIO DE SUPLEMENTOS MINERAIS E RACOES LTDA | CENTRO | Comércio varejista de medicamentos veterinários | 2023 |
| MONTEIRO ENGENHARIA E EMPREENDIMENTOS LTDA | CENTRO | Serviços de engenharia | 2023 |
| MONTEIRO TRANSPORTES LTDA | ZONA RURAL | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2009 |
| MONYQUE CALCADOS LTDA | PARQUE DAS AGUAS | Comércio varejista de calçados | 2025 |
| MOTUS COMERCIO DE VEICULOS E MOTOS LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de motocicletas e motonetas novas | 2025 |
| MOVIDA TREINAMENTO FUNCIONAL LTDA | DONARIA | Atividades de condicionamento físico | 2018 |
| MOVIMENTO DEMOCRATICO BRASILEIRO - MDB | CENTRO | Atividades de organizações políticas | 2004 |
| MRC MATERIAIS DE CONSTRUCAO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2011 |
| MRC MATERIAIS DE CONSTRUCAO LTDA | ZONA RURAL | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2011 |
| MS EQUIPAMENTOS LTDA | VILA MACHADO | Comércio atacadista de máquinas, aparelhos e equipamentos para uso agropecuário; partes e peças | 2021 |
| MS VISAO CAMPO GRANDE LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2026 |
| MSL TRANSPORTES RODOVIARIOS LTDA | ZONA RURAL | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, municipal | 2015 |
| MULTI-FREQUENCIA LTDA | MONTE CRISTO | Produção de filmes para publicidade | 2013 |
| MULTI LOCACOES DE MAQUINAS LTDA | CENTRO | Obras de terraplenagem | 2018 |
| MULTIMALHAS & CONFECCOES LTDA | CENTRO | Confecção de peças de vestuário, exceto roupas íntimas e as confeccionadas sob medida | 2006 |
| MUNDO DIGITAL LTDA | CENTRO | Comércio varejista especializado de eletrodomésticos e equipamentos de áudio e vídeo | 2013 |
| MUNICIPIO DE BONITO | CENTRO | Administração pública em geral | 1974 |
| MX TECNOLOGIA AGRICOLA LTDA | CENTRO | Serviço de pulverização e controle de pragas agrícolas | 2022 |
| MX3 PROVEDOR DE INTERNET E SERVICOS LTDA | CENTRO | Serviços de comunicação multimídia - SCM | 2024 |
| MY SOLAR LTDA | CENTRO | Instalação e manutenção elétrica | 2025 |
| MYLENE BRAND AIVI DA CRUZ LTDA | VILA MACHADO | Serviços de organização de feiras, congressos, exposições e festas | 2026 |
| NADIA AMARILHA LTDA | JARDIM BOM VIVER | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 2023 |
| NAKAMITI & ARASHIRO LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial com recursos para realização de exames complementares | 2025 |
| NANTES FABRICACAO DE GELO MINERAL LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2024 |
| NANTES SERVICOS ADMINISTRATIVOS LTDA | VILA MARAMBAIA | Preparação de documentos e serviços especializados de apoio administrativo não especificados anteriormente | 2021 |
| NASCENTE AZUL EMPREENDIMENTOS TURISTICOS LTDA | ZONA RURAL | Outras atividades de recreação e lazer não especificadas anteriormente | 2013 |
| NASCENTES DA PALMEIRINHA EMPREENDIMENTOS TURISTICOS LTDA | ZONA RURAL | Parques de diversão e parques temáticos | 2022 |
| NASCIMENTO ASSESSORIA VETERINARIA LTDA | VILA DONARIA | Atividades de apoio à pecuária não especificadas anteriormente | 2021 |
| NATIVA AGRICULTURA SUSTENTAVEL LTDA | VILA MACHADO | Comércio atacadista de sementes, flores, plantas e gramas | 2020 |
| NATIVA COSMETICOS E PERFUMARIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2025 |
| NATURAL EXPERIENCES VIAGENS LTDA | VILA RICA | Agências de viagens | 2020 |
| NATURE BONITO HOTEL LTDA | JARDIM ANDREA | Hotéis | 2025 |
| NATUREZA TOUR AGENCIA LTDA | CENTRO | Agências de viagens | 2017 |
| NEI RODRIGUES DA SILVA LTDA | CENTRO | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2026 |
| NELORE XARAES LTDA | ZONA RURAL | Criação de bovinos para corte | 2025 |
| NELORE XARAES LTDA | ZONA RURAL | Criação de bovinos para corte | 2026 |
| NICK AGROPECUARIA LTDA | ZONA RURAL | Cultivo de soja | 2026 |
| NICOLAU ALVAREZ QUEIROZ SERVICOS AGROPECUARIOS LTDA | VILA AMERICA | Serviço de preparação de terreno, cultivo e colheita | 2026 |
| NIPPON-MAGAZINE E CONFECCOES LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 1994 |