| RIO BRANCO PARTICIPACOES E CONSULTORIA LTDA | ZONA RURAL | Holdings de instituições não-financeiras | 2022 |
| RITA PEREIRA DOS SANTOS LTDA | SETOR AEROPORTO | Restaurantes e similares | 2011 |
| ROBERLANIO BATISTA DE SOUSA LTDA | RESIDENCIAL FLAMBOYANT | Fornecimento de alimentos preparados preponderantemente para consumo domiciliar | 2023 |
| ROBERTA CAMPOS ODONTOLOGIA INTEGRADA LTDA | AEROPORTO II | Atividade odontológica | 2025 |
| ROCHA AUTO CENTER LTDA | SETOR OESTE | Serviços de manutenção e reparação elétrica de veículos automotores | 2008 |
| RODO VASCONCELLOS LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2023 |
| RODOARTE INDUSTRIA E CONSTRUCOES LTDA | ZONA RURAL | Criação de bovinos para corte | 1991 |
| RODRIGO ANDERSON VIANA DE SALES LTDA | SETOR OESTE | Representantes comerciais e agentes do comércio de matérias-primas agrícolas e animais vivos | 2016 |
| ROGERIO R. ALMEIDA & CIA LTDA | CENTRO | Atividades de apoio à pecuária não especificadas anteriormente | 2009 |
| ROSEMEIRY ALVES DA SILVA LTDA | SETOR OESTE | Restaurantes e similares | 2016 |
| ROZIMEIRE MARTINS DOS SANTOS LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2000 |
| RPX TRANSPORTES LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2026 |
| RS LOGISTICA LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2025 |
| RUAS & TORRES LTDA | CENTRO | Comércio varejista de carnes - açougues | 1995 |
| RUBIANNA DE GODOI SILVA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos de papelaria | 2009 |
| RURAL TELECOM SCM LTDA | VILA BELA | Serviços de comunicação multimídia - SCM | 2022 |
| RW AGROPECUARIA LTDA | SETOR OESTE | Comércio varejista de medicamentos veterinários | 2015 |
| S CIRQUEIRA CONSULTORIA E TREINAMENTOS LTDA | SETOR ELIZIARIO | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2026 |
| S.D DE MEDEIROS & CIA LTDA | CENTRO | Serviços de comunicação multimídia - SCM | 2004 |
| S. DE SOUSA PRADO LTDA | SETOR AEROPORTO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2025 |
| S.M MATERIAL DE CONSTRUCAO LTDA | AEROPORTO | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2025 |
| S R J BANDEIRA LTDA | CENTRO | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 2024 |
| S2Y ESTILO AGROPECUARIA LTDA | ZONA RURAL | Criação de bovinos para corte | 2024 |
| SA XAVIER LIMA COMERCIO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2025 |
| SABINO ENGENHARIA LTDA | VILA MARTINS | Fabricação de estruturas metálicas | 2008 |
| SABOR DO PEIXE LTDA | SETOR XAVANTE | Peixaria | 2014 |
| SAMARITANO DESENVOLVIMENTO DE SOFTWARES LTDA | SETOR SANTA LUCIA | Portais, provedores de conteúdo e outros serviços de informação na internet | 2025 |
| SAMPAIO E CARREIRO LTDA | SETOR AEROPORTO | Hotéis | 2019 |
| SAMTEC LTDA | VILA SAO JOSE | Comércio varejista de artigos médicos e ortopédicos | 2021 |
| SANDRO MOTO MECANICA LTDA | SETOR CENTRO | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para motocicletas e motonetas | 2021 |
| SANDRO XAVIER COMERCO LTDA | AEROPORTO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2025 |
| SANTA RITA PARTICIPACOES E CONSULTORIA LTDA | ZONA RURAL | Holdings de instituições não-financeiras | 2022 |
| SANTA VITORIA EMPREENDIMENTOS LTDA | ZONA RURAL | Cultivo de batata-inglesa | 2026 |
| SANTOS E LOURENCO LTDA | SETOR OESTE | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - supermercados | 2024 |
| SAO BENTO COMERCIAL LTDA | SETOR EXPANSAO DO SETOR OESTE | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2013 |
| SAO DIMAS EMPREENDIMENTOS LTDA | ZONA RURAL | Aluguel de imóveis próprios | 2017 |
| SAO MIGUEL DO ARAGUAIA VISTORIAS LTDA | SETOR ALTO ALEGRE | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 2021 |
| SAO MIGUEL ESPORTE CLUBE | CENTRO | Clubes sociais, esportivos e similares | 2006 |
| SAO MIGUEL UTILIDADES LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros artigos de uso pessoal e doméstico não especificados anteriormente | 2025 |
| SCP NOVA PIRATININGA | ZONA RURAL | Criação de bovinos para corte | 2011 |
| SECRETARIA MUNICIPAL DE EDUCACAO, CULTURA E ESPORTE | CENTRO | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 2021 |
| SECRETARIA MUNICIPAL DE HABITACAO | CENTRO | Administração pública em geral | 2025 |
| SELARIA ARAGUAIA LTDA | SETOR CENTRO | Reparação e manutenção de outros objetos e equipamentos pessoais e domésticos não especificados anteriormente | 2011 |
| SEMIRAMES B C DE CARVALHO LTDA | VILA SÃO JOSÉ | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2025 |
| SERGIO PEREIRA MACEDO LTDA | SETOR ELIZIARIO | Atividades de apoio à agricultura não especificadas anteriormente | 2025 |
| SERVICOS DE RADIOLOGIA VALE DOS REIS LTDA | RESIDENCIAL MARIA RITA | Serviços de diagnóstico por imagem com uso de radiação ionizante, exceto tomografia | 2024 |
| SETAPLAN-SERVICOS TECNICOS AGROPECUARIOS E PLANEJAMENTO LTDA | CENTRO | Representantes comerciais e agentes do comércio de matérias-primas agrícolas e animais vivos | 2003 |
| SHALONVITTA FARMA LTDA | SETOR OESTE | Comércio varejista de produtos farmacêuticos, sem manipulação de fórmulas | 2025 |
| SHIMA TRUCK LTDA | RESIDENCIAL CECILIA | Serviços de manutenção e reparação mecânica de veículos automotores | 2024 |
| SILMARA DA SILVA COSTA LTDA | SETOR CENTRO | Atividades de estética e outros serviços de cuidados com a beleza | 2015 |