| SEBASTIAO DA SILVA OLIVEIRA | AREA RURAL DE RIO CLARO | Cultivo de cana-de-açúcar | 2018 |
| SEBASTIAO DE BARROS | AREA RURAL DE RIO CLARO | Cultivo de cana-de-açúcar | 2022 |
| SEBASTIAO DE BARROS E OUTROS | ZONA RURAL | Cultivo de cana-de-açúcar | 2008 |
| SEBASTIAO DE BARROS E OUTROS | ZONA RURAL | Cultivo de cana-de-açúcar | 2011 |
| SEBASTIAO DE BARROS E OUTROS | DO SOBRADO | Cultivo de cana-de-açúcar | 2013 |
| SEBASTIAO DE BARROS E OUTROS | ZONA RURAL | Cultivo de cana-de-açúcar | 2013 |
| SEBASTIAO DE BARROS E OUTROS | BAIRRO SOBRADO | Cultivo de cana-de-açúcar | 2017 |
| SEBASTIAO DE BARROS E OUTROS | AREA RURAL DE RIO CLARO | Cultivo de cana-de-açúcar | 2022 |
| SEBASTIAO DE LIBERALI | GOIABA | Cultivo de cana-de-açúcar | 2006 |
| SEBASTIAO KANTOWITZ | RURAL | Cultivo de cana-de-açúcar | 2007 |
| SEBASTIAO MAURO ZANI | CAMPO DO COCHO | Cultivo de cana-de-açúcar | 2006 |
| SEBASTIAO MAURO ZANI | CAMPO DO COCHO | Cultivo de cana-de-açúcar | 2006 |
| SEBASTIAO NALIN | AJAPI | Criação de frangos para corte | 2007 |
| SEBASTIAO NEVES | ZONA RURAL | Cultivo de cana-de-açúcar | 2006 |
| SEBASTIAO SERGIO PIOVEZAN | ZONA RURAL | Cultivo de cana-de-açúcar | 2006 |
| SECCO REPRESENTACAO COMERCIAL DE PISOS E REVESTIMENTOS LTDA | CIDADE JARDIM | Representantes comerciais e agentes do comércio de madeira, material de construção e ferragens | 2015 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA SAUDE | CENTRO | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 2008 |
| SECRETARIA MUNICIPAL DE EDUCACAO - RIO CLARO - SP | SANTANA | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 2017 |
| SECURITY POLICES QUALIFIED RANGERS TECNOLOGIA DA INFORMACAO LTDA | PARQUE RESIDENCIAL BRASILIA | Comércio varejista especializado de equipamentos e suprimentos de informática | 2016 |
| SEG- SERVICOS DE EFICIENCIA ENERGETICA LTDA | VILA OPERARIA | Preparação de documentos e serviços especializados de apoio administrativo não especificados anteriormente | 2017 |
| SEGLEAL RIO CLARO CORRETORA DE SEGUROS S/S LTDA | JARDIM ITAPUA | Corretores e agentes de seguros, de planos de previdência complementar e de saúde | 2012 |
| SEGTEC SAUDE OCUPACIONAL LTDA | SAUDE | Outras atividades profissionais, científicas e técnicas não especificadas anteriormente | 2008 |
| SEGUNDA IGREJA PRESBITERIANA DE RIO CLARO | VILA APARECIDA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1973 |
| SEGURA DEDETIZADORA, DESENTUPIDORA E CONTROLE DE PRAGAS LTDA | CENTRO | Imunização e controle de pragas urbanas | 2012 |
| SEI - PLANEJAMENTO INDUSTRIAL LTDA | VILA BELA VISTA | Desenvolvimento de programas de computador sob encomenda | 2013 |
| SELECT MAIA COMERCIAL LTDA | ALTO DO SANTANA | Promoção de vendas | 2018 |
| SELETA IMOVEIS RIO CLARO LTDA | VILA OPERARIA | Corretagem no aluguel de imóveis | 2022 |
| SELF IT ACADEMIAS HOLDING S.A | VILA HORTO FLORESTAL | Atividades de condicionamento físico | 2018 |
| SELFCON SYSTEMS LTDA | JARDIM BELA VISTA | Pesquisa e desenvolvimento experimental em ciências físicas e naturais | 2024 |
| SELIAL INDUSTRIA E COMERCIO, IMPORTACAO E EXPORTACAO DE ALIMENTOS LTDA | DISTRITO INDUSTRIAL | Fabricação de sucos concentrados de frutas, hortaliças e legumes | 1985 |
| SELIAL INDUSTRIA E COMERCIO, IMPORTACAO E EXPORTACAO DE ALIMENTOS LTDA | VL MARTINS | Comércio atacadista de água mineral | 1986 |
| SEM FOLEGO COMERCIO E CONFECCOES LTDA | CONJUNTO HABITACIONAL ARCO - IRIS CECAP | Confecção de peças de vestuário, exceto roupas íntimas e as confeccionadas sob medida | 2007 |
| SEM LIMITES LTDA | SANTA CRUZ | Atividades de psicologia e psicanálise | 2018 |
| SEM LIMITES LTDA | CIDADE CLARET | Atividades de psicologia e psicanálise | 2023 |
| SEMANARIO DE OFERTAS SERVICOS RIO CLARO LTDA | VL ALEMA | Agências de publicidade | 1998 |
| SEMEAR GRACA IGREJA EM CELULAS | CENTRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2014 |
| SEMEARTE ARQUITETURA, PAISAGISMO E COMERCIO DE PLANTAS ORNAMENTAIS LTDA | JARDIM DONANGELA | Comércio varejista de plantas e flores naturais | 1991 |
| SEMENTINHAS DO REINO RECREACAO INFANTIL LTDA | JARDIM RIO CLARO | Outras atividades de recreação e lazer não especificadas anteriormente | 2026 |
| SEMPREL LOCADORA DE VEICULOS LTDA | BAIRRO OLIMPICO | Locação de automóveis sem condutor | 2025 |
| SEMPREL - SEGURANCA EMPRESARIAL LTDA | JARDIM FLORIDIANA | Atividades de vigilância e segurança privada | 2004 |
| SEMPREL - SERVICOS PARA APOIO E MONITORAMENTO LTDA | BAIRRO OLIMPICO | Serviços combinados para apoio a edifícios, exceto condomínios prediais | 2017 |
| SENAT SERVICO NACIONAL DE APRENDIZAGEM DO TRANSPORTE | JARDIM RIO CLARO | Outras atividades de ensino não especificadas anteriormente | 2007 |
| SENDAS DISTRIBUIDORA S/A | JARDIM CLARET | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - hipermercados | 2016 |
| SENDT - SERVICO DE ENDOSCOPIA E COLONOSCOPIA LTDA | SAUDE | Serviços de diagnóstico por métodos ópticos - endoscopia e outros exames análogos | 2008 |
| SENEDA USINAGEM LTDA | JARDIM HIPODROMO | Serviços de usinagem, tornearia e solda | 2018 |
| SENEME & SENEME COMERCIO DE SALGADOS LTDA | ESTADIO | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2025 |
| SENSAZIONALI PIZZARIA LTDA | ZONA CENTRAL | Restaurantes e similares | 2025 |
| SENSES UNIC AROMAS E PERFUMARIA LTDA | JARDIM BELA VISTA | Comércio varejista de cosméticos, produtos de perfumaria e de higiene pessoal | 2022 |
| SENTINELA SERVICOS ESPECIALIZADOS S/S LTDA | CENTRO | Locação de mão-de-obra temporária | 2001 |
| SENUS ADMINISTRACAO DE BENS E PARTICIPACAO LTDA | CENTRO | Compra e venda de imóveis próprios | 2017 |