| SAFE & GO LTDA | PEREQUE | Corretores e agentes de seguros, de planos de previdência complementar e de saúde | 2025 |
| SALACIA LTDA | FEITICEIRA | Comércio varejista de outros artigos de uso pessoal e doméstico não especificados anteriormente | 2025 |
| SALAZARS COMERCIO DE ARTIGOS ESPORTIVOS LTDA | PEREQUE | Comércio varejista de artigos esportivos | 2022 |
| SALGA FILMES LTDA | COCAIA | Atividades de produção cinematográfica, de vídeos e de programas de televisão não especificadas anteriormente | 2014 |
| SALIM E GARCIA SOLUCOES INTEGRADAS E HOSPEDAGEM LTDA | BARRA VELHA | Hotéis | 2026 |
| SALLES HOLDING LTDA | VILA | Holdings de instituições não-financeiras | 2025 |
| SAM EMPREENDIMENTOS LTDA | VELOSO | Compra e venda de imóveis próprios | 2023 |
| SAMARITANO SAO FRANCISCO DE ASSIS | PEREQUE | Orfanatos | 2021 |
| SAMPAIO & RODRIGUES ZELADORIA PATRIMONIAL LTDA | COCAIA | Atividades de monitoramento de sistemas de segurança eletrônico | 2006 |
| SAMUEL DE SOUZA | ZONA RURAL | Pesca de peixes em água salgada | 2019 |
| SANDARA COMIDA LIBANESA ARTESANAL LTDA | ITAQUANDUBA | Bares e outros estabelecimentos especializados em servir bebidas, com entretenimento | 2020 |
| SANDRO MARCOS RIBEIRO SOARES LTDA | CENTRO | Restaurantes e similares | 2019 |
| SANEB ENGENHARIA LTDA | VELOSO | Construção de redes de abastecimento de água, coleta de esgoto e construções correlatas, exceto obras de irrigação | 2016 |
| SANORTE INFRAESTRUTURA E SANEAMENTO LTDA | PEREQUE | Construção de redes de abastecimento de água, coleta de esgoto e construções correlatas, exceto obras de irrigação | 2023 |
| SANTA BARBARA RADIODIFUSAO LTDA | PEREQUE | Atividades de rádio | 2010 |
| SANTA CASA DE MISERICORDIA DE ILHABELA | VILA | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 1982 |
| SANTA CASA DE MISERICORDIA DE ILHABELA | BARRA VELHA | Atividades de apoio à gestão de saúde | 2016 |
| SANTA CASA DE MISERICORDIA DE ILHABELA | BARRA VELHA | Laboratórios clínicos | 2017 |
| SANTA MONICA EMPREENDIMENTOS E PARTICIPACOES LTDA | COCAIA | Compra e venda de imóveis próprios | 1979 |
| SANTA ROSALIA ADMINISTRADORA E PARTICIPACOES LTDA | ITAQUANDUBA | Aluguel de imóveis próprios | 2017 |
| SANTIAGO MATERIAIS ELETRICOS LTDA | AGUA BRANCA | Instalação e manutenção elétrica | 2026 |
| SANTO LANCHE ILHABELA BAR E HAMBURGUERIA LTDA | AGUA BRANCA | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 2021 |
| SANTOMAR APOIO PUBLICITARIO LTDA | PRAIA GRANDE | Outras atividades de publicidade não especificadas anteriormente | 2018 |
| SAO JOAO ILHABELA LOCACOES LTDA | PEREQUE | Aluguel de imóveis próprios | 2004 |
| SAPEKA ILHABELA LOJA DO BEBE LTDA | PEREQUE | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2000 |
| SAPEKA ILHABELA LOJA INFANTIL LTDA | PEREQUE | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2025 |
| SARA CAROLINA KANG HYUN LTDA | PEREQUE | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 2024 |
| SARUE CORP LTDA | COSTA BELA | Consultoria em tecnologia da informação | 2020 |
| SAUNA LAB COMUNICACAO E PRODUCOES CRIATIVAS LTDA | BARRA VELHA | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2025 |
| SAVANAH GESTAO PATRIMONIAL LTDA | COCAIA | Holdings de instituições não-financeiras | 2026 |
| SB JUNDU AMBIENTAL LTDA | CURRAL | Usinas de compostagem | 2025 |
| SBR LAVANDERIA ILHABELA LTDA | BARRA VELHA | Lavanderias | 2024 |
| SCALEA LANCHAS LTDA | PEREQUE | Agências de viagens | 2020 |
| SCALEA TURISMO LTDA | PEREQUE | Agências de viagens | 2026 |
| SCHARFF REVESTIMENTOS LTDA | VILA | Comércio varejista de tintas e materiais para pintura | 2024 |
| SCI BAR E RESTAURANTE LTDA | SACO DA CAPELA | Restaurantes e similares | 2009 |
| SCP CASA COSTA | SANTA TEREZA | Hotéis | 2026 |
| SEA TOY PASSEIOS ILHABELA LTDA | VILA | Transporte aquaviário para passeios turísticos | 2019 |
| SEARA ALIMENTOS LTDA | PEREQUE | Comércio varejista de carnes - açougues | 2022 |
| SEBASTIAO MARCOS SALOMAO FILHO | PACOIBA | Pesca de crustáceos e moluscos em água salgada | 2026 |
| SECRETARIA MUNICIPAL DE EDUCACAO - ILHABELA | PEREQUE | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 2018 |
| SELLERS CLUB LTDA | REINO | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2023 |
| SENA & SANTOS COMERCIO E SERVICOS DE ALIMENTOS LTDA | BARRA VELHA | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 2007 |
| SEREIA APOIO ADMINISTRATIVO LTDA | VILA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2021 |
| SERGIO ALVES GARCEZ | SACO DA CAPELA | Pesca de crustáceos e moluscos em água salgada | 2019 |
| SERGIO BENEDITO BRAGHINI JUNIOR | ITAQUANDUBA | Pesca de peixes em água salgada | 2025 |
| SERGIO DOS SANTOS | CENTRO | Pesca de crustáceos e moluscos em água salgada | 2013 |
| SEU SUSHI NA ILHA LTDA | ZABUMBA | Fornecimento de alimentos preparados preponderantemente para consumo domiciliar | 2024 |
| SHELL BRASIL PETROLEO LTDA | BARRA VELHA | Extração de petróleo e gás natural | 2017 |
| SHELL BRASIL PETROLEO LTDA | BARRA VELHA | Extração de petróleo e gás natural | 2017 |