| EMIDIO RIBEIRO | ROD ASSIS PLATINA | Criação de bovinos para corte | 2025 |
| EMILIA MORTARI CARDOSO E OUTROS | AGUA DO FREIRE | Cultivo de cana-de-açúcar | 2006 |
| EMMAL ESTRUTURAS METALICAS MALAGOLI LTDA | TARUMA | Fabricação de estruturas metálicas | 1986 |
| EMMI MARTH | AGUA DA CORREDEIRA | Cultivo de soja | 2007 |
| EMN SOLUCOES EM MEDICINA DO TRABALHO LTDA | JARDIM EUROPA | Atividade médica ambulatorial com recursos para realização de exames complementares | 2023 |
| EMPENHO CONSULTORIA E MARKETING LTDA | CENTRO | Agências de publicidade | 2013 |
| EMPLAK JA - COMERCIO DE PLACAS LTDA | VILA SANTA ELISA | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 2025 |
| EMPORIO CABRAL LTDA | CDA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2023 |
| EMPORIO DA CARNE LTDA | VILA SANTA RITA | Comércio varejista de carnes - açougues | 2024 |
| EMPORIO E BOMBONIERI DE ASSIS LTDA | VL GLORIA | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 1980 |
| EMPORIO HOME LTDA | VILA OURO VERDE | Comércio varejista de outros artigos de uso pessoal e doméstico não especificados anteriormente | 2021 |
| EMPORIO PET E CIA LTDA | VILA ROSANGELA | Comércio varejista de animais vivos e de artigos e alimentos para animais de estimação | 2025 |
| EMPORIUM CHOCOLLATE LTDA | JARDIM PAULISTA | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 1990 |
| EMPREENDE ADMINISTRACOES LTDA | VILA TENIS CLUBE | Holdings de instituições não-financeiras | 2023 |
| EMPREENDIMENTO PANEMA SPE LTDA | VILA CENTRAL | Compra e venda de imóveis próprios | 2016 |
| EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS DAMHA - ASSIS I - SPE LTDA | JARDIM PAULISTA | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2011 |
| EMPRESA BRASILEIRA DE CORREIOS E TELEGRAFOS | VILA CLEMENTINA | Atividades do Correio Nacional | 1973 |
| EMPRESA BRASILEIRA DE CORREIOS E TELEGRAFOS | CENTRO | Atividades do Correio Nacional | 1995 |
| EMPRESA DE MINERACAO AQUALINDA LTDA | AGUA FORTUNINHA | Fabricação de águas envasadas | 1973 |
| EMPRESA DE ONIBUS CIRCULAR CIDADE DE ASSIS LTDA | VILA NOVA SANTANA | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, municipal | 1990 |
| EMPRESA DE ONIBUS LUCHINI LTDA | VILA PRUDENCIANA | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, intermunicipal, exceto em região metropolitana | 1992 |
| EMPRESA DE TRANSPORTE E TURISMO PALUSA LTDA | ZONA RURAL | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, intermunicipal, exceto em região metropolitana | 2007 |
| EMPRESA DE TRANSPORTES ANDORINHA SA | VILA AEROPORTO | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, intermunicipal em região metropolitana | 1970 |
| EMPRESA DE TRANSPORTES ANDORINHA SA | VILA NOVA SANTANA | Agências de viagens | 1966 |
| EMPRESA DE TRANSPORTES ANDORINHA SA | TERMINAL RODOVIARIO | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, intermunicipal em região metropolitana | 2002 |
| EMPRESA GONTIJO DE TRANSPORTES S/A | VILA NOVA SANTANA | Serviços de reservas e outros serviços de turismo não especificados anteriormente | 1990 |
| EMPRESA JORNALISTICA DIARIO DE ASSIS LTDA | JARDIM EUROPA | Portais, provedores de conteúdo e outros serviços de informação na internet | 2001 |
| EMPRESA JUNIOR DO CURSO DE CIENCIAS BIOLOGICAS | VILA TENIS CLUBE | Atividades de apoio à educação, exceto caixas escolares | 2011 |
| EMPRESA PRINCESA DO NORTE S.A | VILA BOA VISTA | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, interestadual | 1996 |
| EMS ODONTOLOGIA ESPECIALIZADA LTDA | CENTRO | Atividade odontológica | 2015 |
| EMZ - LABORATORIO NUTRICIONAL LTDA | VILA XAVIER | Fabricação de alimentos dietéticos e complementos alimentares | 2021 |
| EMZ SERVICOS LTDA | VILA FIUZA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2025 |
| ENCALSO CONSTRUCOES LTDA | CENTRO DE DESENVOLVIMENTO DE ASSIS | Fabricação de outros produtos de minerais não-metálicos não especificados anteriormente | 2023 |
| ENERGISA SUL-SUDESTE - DISTRIBUIDORA DE ENERGIA S.A | CENTRO | Distribuição de energia elétrica | 2005 |
| ENERGISA SUL-SUDESTE - DISTRIBUIDORA DE ENERGIA S.A | CHACARA DAS ROSAS | Distribuição de energia elétrica | 2017 |
| ENERGISA SUL-SUDESTE - DISTRIBUIDORA DE ENERGIA S.A | CENTRO | Distribuição de energia elétrica | 2020 |
| ENERGISA SUL-SUDESTE - DISTRIBUIDORA DE ENERGIA S.A | CENTRO | Distribuição de energia elétrica | 2025 |
| ENGEMAP ENGENHARIA E AEROLEVANTAMENTO LTDA | BOA VISTA | Serviços de cartografia, topografia e geodésia | 2010 |
| ENGETEC ELETRICA E AUTOMACAO LTDA | PORTAL DE SAO FRANCISCO | Manutenção e reparação de geradores, transformadores e motores elétricos | 2025 |
| ENGEX EDIFICACOES LTDA | POSTO MODELO | Construção de edifícios | 2011 |
| ENJ TRANSPORTES E SERVICOS DE REBOQUE LTDA | VILA PROGRESSO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2024 |
| ENLACES PSICANALISE E PSICOLOGIA LTDA | VILA CENTRAL | Atividades de psicologia e psicanálise | 2025 |
| ENSINAMAP CURSOS E TREINAMENTOS LTDA | VILA SANTA CECILIA | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2024 |
| ENTREAGRO NEGOCIOS E REPRESENTACOES LTDA | VILA RIBEIRO | Representantes comerciais e agentes do comércio de máquinas, equipamentos, embarcações e aeronaves | 2022 |
| ENTRINGER REPRESENTACOES COMERCIAIS E SERVICOS LTDA | PORTAL DE SAO FRANCISCO | Representantes comerciais e agentes do comércio de matérias-primas agrícolas e animais vivos | 2000 |
| ENTRISILOS INDUSTRIAL LTDA | QUINTA DOS FLAMBOYANTS | Fabricação de máquinas e equipamentos para a agricultura e pecuária, peças e acessórios, exceto para irrigação | 2021 |
| ENZO ROSSETO ASSEF SANTOS LTDA | PARQUE DAS FLORES | Atividades de fisioterapia | 2025 |
| EP ASSESSORIA EM GESTAO PUBLICA E TREINAMENTO LTDA | VILA EBENEZER | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2016 |
| EQUILIBRIO STUDIO DE PILATES LTDA | CENTRO | Atividades de condicionamento físico | 2025 |
| EQUIPAR ASSIS PECAS E ACESSORIOS PARA MOTOS LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de motocicletas e motonetas novas | 1976 |