| SECRETARIA DE ESTADO DA AGRICULTURA DO DESENVOLVIMENTO AGRARIO E DA PESCA | TREZE DE JULHO | Administração pública em geral | 2019 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA ASSISTENCIA SOCIAL, INCLUSAO E CIDADANIA - SEASIC | LUZIA | Administração pública em geral | 2019 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA CASA CIVIL | INACIO BARBOSA | Administração pública em geral | 2019 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA COMUNICACAO SOCIAL - SECOM | INACIO BARBOSA | Administração pública em geral | 2023 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA EDUCACAO - SEED | INACIO BARBOSA | Administração pública em geral | 2019 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA FAZENDA | JARDINS | Administração pública em geral | 2019 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA JUSTICA E DE DEFESA DO CONSUMIDOR - SEJUC | COROA DO MEIO | Segurança e ordem pública | 2019 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA SAUDE | PONTO NOVO | Administração pública em geral | 2019 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA SEGURANCA PUBLICA | SAO JOSE | Administração pública em geral | 2019 |
| SECRETARIA DE ESTADO DE POLITICAS PARA AS MULHERES - SPM | SAO JOSE | Administração pública em geral | 2023 |
| SECRETARIA DE ESTADO DO DESENVOLVIMENTO ECONOMICO E DA CIENCIA E TECNOLOGIA | INACIO BARBOSA | Administração pública em geral | 2019 |
| SECRETARIA DE ESTADO DO DESENVOLVIMENTO URBANO E INFRAESTRUTURA - SEDURBI | TREZE DE JULHO | Administração pública em geral | 2019 |
| SECRETARIA DE ESTADO DO ESPORTE E LAZER - SEEL | TREZE DE JULHO | Administração pública em geral | 2023 |
| SECRETARIA DE ESTADO DO MEIO AMBIENTE, SUSTENTABILIDADE E ACOES CLIMATICAS - SEMAC | INACIO BARBOSA | Administração pública em geral | 2023 |
| SECRETARIA DE ESTADO DO TRABALHO, EMPREGO E EMPREENDEDORISMO - SETEEM | SAO JOSE | Administração pública em geral | 2023 |
| SECRETARIA DE ESTADO DO TURISMO | FAROLANDIA | Administração pública em geral | 2019 |
| SECRETARIA MUNICIPAL DA CULTURA DE ARACAJU - SEMCULT | CENTRO | Administração pública em geral | 2025 |
| SECRETARIA MUNICIPAL DO RESPEITO AS POLITICAS PARA AS MULHERES - SERMULHER | CENTRO | Administração pública em geral | 2025 |
| SECRETARIA MUNICIPAL DOS DIREITOS DA PESSOA COM DEFICIENCIA - SEMDEF | GRAGERU | Administração pública em geral | 2025 |
| SECURITY SERVICOS CONTABEIS E GESTAO EMPRESARIAL LTDA | DEZOITO DO FORTE | Atividades de contabilidade | 2026 |
| SEDAE - SERVICO DE DESENVOLVIMENTO E ADMINISTRACAO EMPRESARIAL LTDA | SAO JOSE | Promoção de vendas | 2019 |
| SEDARE - SERVICOS MEDICOS E HOSPITALARES DE ANESTESIA LTDA | JARDINS | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 2017 |
| SEDARI PARTICIPACOES LTDA | FAROLANDIA | Holdings de instituições não-financeiras | 2026 |
| SEDIESEL SERGIPE DIESEL SERVICE LTDA | CENTRO | Serviços de manutenção e reparação mecânica de veículos automotores | 2001 |
| SEDNA COMERCIO LTDA | JARDINS | Comércio varejista de calçados | 2004 |
| SEDREZ REPRESENTACOES LTDA | SUICA | Representantes comerciais e agentes do comércio de mercadorias em geral não especializado | 1999 |
| SEEI - SERVICO EDUCACIONAL ESPECIALIZADO EM INCLUSAO LTDA | SAO JOSE | Outras atividades de ensino não especificadas anteriormente | 2011 |
| SEEO ENGENHARIA E CONSULTORIA LTDA | SAO JOSE | Serviços de engenharia | 2026 |
| SEG RISCO SEGURANCA EM TRANSPORTES LTDA | TREZE DE JULHO | Atividades de monitoramento de sistemas de segurança eletrônico | 2019 |
| SEGAL DO FORRO SHOWS E EVENTOS LTDA | JABOTIANA | Produção musical | 2019 |
| SEGEL MULTI SOLUCOES LTDA | PONTO NOVO | Instalação e manutenção elétrica | 2025 |
| SEGINFO - SERVICOS DE INFORMATICA E ELETRONICA LTDA | JARDINS | Instalação e manutenção elétrica | 2010 |
| SEGQUALI SEGURANCA E QUALIDADE LTDA | PEREIRA LOBO | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2024 |
| SEGSOM LTDA | NOVO PARAISO | Instalação e manutenção elétrica | 2016 |
| SEGTECH LTDA | INACIO BARBOSA | Instalação e manutenção elétrica | 2023 |
| SEGUNDA IGREJA BATISTA EBENEZER RENOVADA | SIQUEIRA CAMPOS | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1996 |
| SEGUNDA IGREJA BATISTA EM ARACAJU | CENTRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1974 |
| SEGUNDA IGREJA EVANGELICA CONGREGACIONAL DE ARACAJU | SANTA MARIA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2007 |
| SEGURAJU CORRETAGEM DE SEGUROS ADMINISTRACAO E SERVICOS LTDA | SALGADO FILHO | Corretores e agentes de seguros, de planos de previdência complementar e de saúde | 2025 |
| SEGURAMA SEGUROS LTDA | SALGADO FILHO | Corretores e agentes de seguros, de planos de previdência complementar e de saúde | 2017 |
| SEGURANCA E MEDICINA OCUPACIONAL LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 1998 |
| SEGURANCA INTELIGENTE LTDA | GRAGERU | Instalação e manutenção elétrica | 2022 |
| SEGURO SEGURANCA LTDA | PEREIRA LOBO | Atividades de vigilância e segurança privada | 2025 |
| SEGURPRO TECNOLOGIA EM SISTEMAS DE SEGURANCA ELETRONICA E INCENDIOS LTDA | INACIO BARBOSA | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 2021 |
| SEGURPRO VIGILANCIA PATRIMONIAL S.A | CENTRO | Atividades de vigilância e segurança privada | 2017 |
| SEGV COMERCIO E SERVICOS LTDA | PONTO NOVO | Comércio varejista de outros artigos de uso pessoal e doméstico não especificados anteriormente | 2008 |
| SEHANEST - SERVICOS HOSPITALARES EM ANESTESIOLOGIA LTDA | CENTRO | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 2017 |
| SEICHO-NO-IE DO BRASIL | BAIRRO SUICA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1984 |
| SEIKO SERVICOS DE INTERNET LTDA | SALGADO FILHO | Desenvolvimento e licenciamento de programas de computador não-customizáveis | 2014 |
| SEIPPEL DISTRIBUIDORA DE BEBIDAS LTDA | 13 DE JULHO | Comércio varejista de bebidas | 1994 |
Malha municipal: IBGE