| SCORPION SERVICOS COMBINADOS PARA EDIFICIOS LTDA | BARRA DO SAHY | Serviços combinados para apoio a edifícios, exceto condomínios prediais | 2022 |
| SCS - COMERCIAL E SERVICOS QUIMICOS LTDA | INDUSTRIAL | Comércio atacadista de outros produtos químicos e petroquímicos não especificados anteriormente | 1997 |
| SCS SERVICOS LTDA | CENTRO | Atividades de intermediação e agenciamento de serviços e negócios em geral, exceto imobiliários | 2005 |
| SCUBADODIVE ADVENTURE TURISMO LTDA | VARADOURO | Comércio varejista de artigos esportivos | 2011 |
| SCX EMPREENDIMENTOS LTDA | VARADOURO | Aluguel de imóveis próprios | 2020 |
| SCX EMPREENDIMENTOS LTDA SCP | VARADOURO | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2025 |
| SEA LOUNGE LTDA | PITANGUEIRAS | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2024 |
| SEA PRIME YACHTS LTDA | VILA AMELIA | Comércio varejista de embarcações e outros veículos recreativos; peças e acessórios | 2020 |
| SEA SIDE AGENCIAMENTOS MARITIMOS LTDA | CENTRO | Atividades de agenciamento marítimo | 2020 |
| SEA - SUPERACAO E APERFEICOAMENTO EDUCACIONAL LTDA | CENTRO | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2023 |
| SEAFORTE OPERACOES PORTUARIAS LTDA | INDUSTRIAL | Atividades do Operador Portuário | 2017 |
| SEAOR COMPANY LTDA | CANTO DO MAR | Tratamento de dados, provedores de serviços de aplicação e serviços de hospedagem na internet | 2026 |
| SEAPECAS LTDA | PORTO GRANDE | Comércio varejista de embarcações e outros veículos recreativos; peças e acessórios | 2016 |
| SEAPORT IMOVEIS LTDA | BARRA DO SAHI | Corretagem no aluguel de imóveis | 1992 |
| SEAPORT IMOVEIS LTDA | PRAIA PRETA | Corretagem na compra e venda e avaliação de imóveis | 2002 |
| SEARA ALIMENTOS LTDA | JUQUEHY | Comércio varejista de carnes - açougues | 2023 |
| SEBASTHIANA BEACH BAR E BURGER BOICUCANGA LTDA | BOICUCANGA | Bares e outros estabelecimentos especializados em servir bebidas, sem entretenimento | 2020 |
| SEBASTIAN PRAG - CONTROLE DE PRAGAS LTDA | SAO FRANCISCO DA PRAIA | Imunização e controle de pragas urbanas | 2002 |
| SEBASTIANA FILMES LTDA | PORTAL DA OLARIA | Atividades de produção cinematográfica, de vídeos e de programas de televisão não especificadas anteriormente | 2024 |
| SEBASTIANI CONSULTORIA TECNICA LTDA | PORTO GRANDE | Serviços de engenharia | 2023 |
| SECOND POUSADA LTDA | JUQUEY | Outros alojamentos não especificados anteriormente | 2012 |
| SECRETARIA DA EDUCACAO DA PREFEITURA DE SAO SEBASTIAO | CENTRO | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 2018 |
| SECRETARIA DE POLITICAS PARA A MULHER | CENTRO | Administração pública em geral | 1986 |
| SEGTRAB GESTAO EMPRESARIAL LTDA | OLARIA | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2024 |
| SEGUNDA IGREJA BATISTA EM SAO SEBASTIAO | TOPOLANDIA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1988 |
| SEIBU COMERCIAL LTDA | CENTRO | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 1987 |
| SEIBU LOTERIAS LTDA | CENTRO | Casas lotéricas | 2001 |
| SEIVA BEACH BAR LTDA | CAMBURI | Bares e outros estabelecimentos especializados em servir bebidas, sem entretenimento | 2018 |
| SELMA APARECIDA SANTOS MORIMOTO LTDA | PORTO GRANDE | Consultoria em publicidade | 2019 |
| SEMIRAMIS ALBUQUERQUE BIASOLI LTDA | SERTAO DO CAMBURI | Atividades de apoio à educação, exceto caixas escolares | 2022 |
| SEMPRE BELLA CONCEPT LTDA | PONTAL DA CRUZ | Atividades de estética e outros serviços de cuidados com a beleza | 2025 |
| SEMPRE VIVA PRESENTES E DECORACOES LTDA | BOICUCANGA | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 2020 |
| SENTINELA CAPITAL EMPREENDIMENTOS LTDA | JUQUEY | Preparação de documentos e serviços especializados de apoio administrativo não especificados anteriormente | 2026 |
| SERENA SAUDE CONSULTORIAS DE SEGUROS LTDA | MARESIAS | Atividades auxiliares dos seguros, da previdência complementar e dos planos de saúde não especificadas anteriormente | 2024 |
| SERGIO PAULO LIBANO DA SILVA | TOQUE TOQUE PEQUENO | Pesca de peixes em água salgada | 2013 |
| SERGIO WAINBERG | CAMBURI | Cultivo de banana | 2013 |
| SERPRO - SERVICOS PROFISSIONAIS MEDICOS LTDA | PONTAL DA CRUZ | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2009 |
| SERRA DO MAR PEIXARIA LTDA | BOICUCANGA | Peixaria | 2001 |
| SERRA DO MAR PEIXARIA LTDA | MARESIAS | Peixaria | 2019 |
| SERRAT LOGISTICA E LOCACAO LTDA | VARADOURO | Atividades relacionadas a esgoto, exceto a gestão de redes | 1987 |
| SERRAT SERVICOS LTDA | VARADOURO | Atividades relacionadas a esgoto, exceto a gestão de redes | 2024 |
| SERV REGISTRO CIVIL PESSOAS NATURAIS DE SAO SEBASTIAO | CENTRO | Administração pública em geral | 1996 |
| SERVESTIVA EQUIPAMENTOS E TRANSPORTES LTDA | PORTAL DA OLARIA | Outras atividades auxiliares dos transportes terrestres não especificadas anteriormente | 1984 |
| SERVICOS URBANOS ENGENHARIA LTDA | CANTO DO MAR | Serviços de engenharia | 2025 |
| SESSAO DE ARTE PRODUCOES LTDA | BOICUCANGA | Estúdios cinematográficos | 2023 |
| SEU SEBASTIAO RESTAURANTE E LANCHONETE LTDA | CENTRO | Restaurantes e similares | 2025 |
| SEU ZE CONVENIENCIA LTDA | CANTO DO MAR | Comércio varejista de mercadorias em lojas de conveniência | 2024 |
| SEV SERVICOS DIGITAIS LTDA | BOICUCANGA | Marketing direto | 2017 |
| SEVA JUQUEHY LTDA | JUQUEY | Fabricação de cervejas e chopes | 2026 |
| SEVA LOJA LTDA | CAMBURI | Bares e outros estabelecimentos especializados em servir bebidas, com entretenimento | 2023 |