| SELLO MAX ARTEFATOS ESTAMPADOS LTDA | JARDIM MORADA DO SOL | Instalação de máquinas e equipamentos industriais | 2012 |
| SELMA SANTOS DE ALMEIDA & CIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos de joalheria | 2000 |
| SEM FRONTEIRAS TRADUCOES LTDA | AQUI SE VIVE | Serviços de tradução, interpretação e similares | 2023 |
| SEM PARAR INSTITUICAO DE PAGAMENTO LTDA | JARDIM TROPICAL | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 2018 |
| SEMEAR CURSOS E TREINAMENTOS LTDA | VILA GEORGINA | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2025 |
| SEMEAR REPRESENTACOES DE PRODUTOS ALIMENTICIOS LTDA | CHACARA ALVORADA | Representantes comerciais e agentes do comércio de produtos alimentícios, bebidas e fumo | 2018 |
| SEMENSATTI & DUARTE RESTAURANTE BAR E LANCHONETE LTDA | CIDADE NOVA | Restaurantes e similares | 2019 |
| SEMENTE & WODEWOTZKY LTDA | VILA CASTELO BRANCO | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2008 |
| SEMEVISA SERVICOS DE APOIO ADMINISTRATIVO LTDA | LAGOS DE SHANADU | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2014 |
| SEMI - SERVICOS ESPECIALIZADOS NA AREA DA SAUDE LTDA | CIDADE NOVA I | Atividade médica ambulatorial com recursos para realização de exames complementares | 2001 |
| SEMPRAG CONTROLE DE PRAGAS LTDA | JARDIM TROPICAL | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2024 |
| SEMPRE - PARTICIPACOES DE CAPITAL LTDA | COLINAS DO MOSTEIRO DE ITAICI | Holdings de instituições não-financeiras | 2010 |
| SEMPRE PERTO SUPERMERCADO LTDA | VILA BRIZZOLA | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - supermercados | 2024 |
| SEMPRO SERVICOS DE ENGENHARIA E ACOMPANHAMENTO DE OBRAS LTDA | JARDIM BELO HORIZONTE | Serviços de engenharia | 2022 |
| SENA & CASTRO NEGOCIOS IMOBILIARIOS LTDA | CIDADE NOVA | Corretagem na compra e venda e avaliação de imóveis | 2026 |
| SENA COMERCIO E SERVICOS INDAIATUBA LTDA | JARDIM RECANTO DO VALLE | Comércio atacadista de produtos de higiene, limpeza e conservação domiciliar | 2019 |
| SENCIATTI BARBOSA SERRALHERIA LTDA | RECREIO CAMPESTRE JOIA | Fabricação de esquadrias de metal | 2020 |
| SENDAS DISTRIBUIDORA S/A | NUCLEO HABITACIONAL BRIGADEIRO FARIA LIMA | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - hipermercados | 2019 |
| SENDAS DISTRIBUIDORA S/A | NUCLEO HABITACIONAL BRIGADEIRO FARIA LIMA | Comércio varejista de produtos farmacêuticos, sem manipulação de fórmulas | 2026 |
| SENDAY SOLUTIONS LTDA | JARDIM PAU PRETO | Suporte técnico, manutenção e outros serviços em tecnologia da informação | 2016 |
| SENEX CONSULTORIA EM GESTAO ADMINISTRATIVA LTDA | LOTEAMENTO GREEN VIEW VILLAGE | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2023 |
| SENHOR MOEDA CAMBIO & OURO INDAIATUBA LTDA | CIDADE NOVA | Correspondentes de instituições financeiras | 2025 |
| SENHOR WATCHES LTDA | VILA SFEIR | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 2025 |
| SENHORITTA ROUPAS E ACESSORIOS LTDA | VILA VITORIA II | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2019 |
| SENIOR EXPERTS COMERCIO VAREJISTA DE ARTIGOS PARA CUIDADO AO IDOSO, CONSULTORIA E TREINAMENTO EM SAUDE LTDA | CIDADE NOVA I | Lojas de variedades, exceto lojas de departamentos ou magazines | 2016 |
| SENIORCHECK BRASIL COMERCIO E SERVICOS DE TECNOLOGIA EM SAUDE LTDA | VILA CASTELO BRANCO | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2019 |
| SENNA AGENCIA DE VIAGEM E TURISMO LTDA | JARDIM AMERICA | Agências de viagens | 2013 |
| SENNO INDUSTRIA METALURGICA LTDA | JARDIM NOVA INDAIA | Fabricação de outros produtos de metal não especificados anteriormente | 2005 |
| SENO COMERCIO E SERVICO LTDA | JARDIM RESIDENCIAL DONA LUCILLA | Comércio varejista especializado de equipamentos e suprimentos de informática | 2026 |
| SENSA BEAUTY LAB LTDA | VILA VITORIA II | Cabeleireiros, manicure e pedicure | 2020 |
| SENSORIALE DESENVOLVIMENTO E APRENDIZADO LTDA | CIDADE NOVA II | Atividades de terapia ocupacional | 2026 |
| SENSORY SAFARI LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos de papelaria | 2026 |
| SENTINELA AGRO TECNOLOGIA LTDA | PARQUE SAO LOURENCO | Instalação e manutenção elétrica | 2025 |
| SENTIRE - TERAPIA OCUPACIONAL LTDA | JARDIM POMPEIA | Atividades de terapia ocupacional | 2024 |
| SENZALA DOCES FINOS LTDA | RECANTO DOS PASSAROS | Fabricação de produtos de padaria e confeitaria com predominância de produção própria | 2025 |
| SEO MARCENEIRO FERRAGEM LTDA | CENTRO | Comércio varejista de madeira e artefatos | 2025 |
| SEO ROSA PAISAGISMO E COMERCIO DE PLANTAS LTDA | JARDIM QUINTAS DA TERRACOTA | Atividades paisagísticas | 2020 |
| SEPARI EQUIPAMENTOS INDUSTRIAIS LTDA | PARK COMERCIAL DE INDAIATUBA | Fabricação de outras máquinas e equipamentos de uso geral não especificados anteriormente, peças e acessórios | 2018 |
| SEPREV - SERVICO DE PREVIDENCIA E ASSISTENCIA A SAUDE DOS SERVIDORES MUNICIPAIS DE INDAIATUBA | JD POMPEIA | Seguridade social obrigatória | 1993 |
| SER.COM RECURSOS HUMANOS LTDA | CENTRO | Locação de mão-de-obra temporária | 2017 |
| SER & MA COMERCIO DE ARTIGOS DO VESTUARIO LTDA | JARDIM CALIFORNIA | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 1990 |
| SER OTICA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos de óptica | 2017 |
| SERAFINA PAES LTDA | JARDIM JULIANA | Fabricação de produtos de padaria e confeitaria com predominância de produção própria | 2020 |
| SERANA HOLDING LTDA | PARQUE VILLA DOS PINHEIROS | Holdings de instituições não-financeiras | 2025 |
| SERCOM GESSO LTDA | JARDIM PARK REAL | Obras de acabamento em gesso e estuque | 2014 |
| SERENA - CASA DE REPOUSO E HOTELARIA PARA PESSOAS DA TERCEIRA IDADE LTDA | VILA BRIZZOLA | Clínicas e residências geriátricas | 2024 |
| SERENA - CENTRO INTEGRADO DE EQUILIBRIO E BEM-ESTAR LTDA | VILA CASTELO BRANCO | Atividades de fisioterapia | 2025 |
| SERENATA SERVICOS LTDA | CENTRO | Reparação de calçados, bolsas e artigos de viagem | 2022 |
| SERGEL INDAIATUBA COMERCIO DE SORVETES LTDA | JARDIM MORADA DO SOL | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2023 |
| SERGIO ANTONIO GIATTI | SALTINHO | Cultivo de uva | 2006 |
Malha municipal: IBGE