| RONI PETERSON GUTERRES CAETANO LTDA | SUBURBIOS | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2023 |
| ROSALES CLINICA VETERINARIA LTDA | CENTRO | Atividades veterinárias | 2018 |
| ROTA SUL RESTAURANTE LTDA | INTERIOR | Restaurantes e similares | 2026 |
| ROTARY CLUB DE ENCRUZILHADA DO SUL | CENTRO | Outras atividades de serviços pessoais não especificadas anteriormente | 2003 |
| RP MELANCIAS TRANSPORTE E LOGISTICA LTDA | SUBURBIOS | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2024 |
| RQ SERVICOS TEXTEIS LTDA | DESIDERIO FINAMOR | Confecção de roupas profissionais, exceto sob medida | 2024 |
| RT INNCORP LTDA | CENTRO | Construção de edifícios | 2023 |
| RT MAIS FORTE SEGURANCA ELETRONICA LTDA | CENTRO | Atividades de monitoramento de sistemas de segurança eletrônico | 2026 |
| S. C. SOARES & CIA LTDA | CENTRO | Aluguel de imóveis próprios | 2024 |
| S. DE ALEXANDRE ALIMENTOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2017 |
| SABORES DA FABI EXPRESS LTDA | CENTRO | Padaria e confeitaria com predominância de revenda | 2022 |
| SAINT PUB LTDA | CENTRO | Bares e outros estabelecimentos especializados em servir bebidas, com entretenimento | 2026 |
| SALUS INVESTIMENTOS E ADMINISTRACAO S/A | CENTRO | Holdings de instituições não-financeiras | 2024 |
| SANEST SERVICOS MEDICOS LTDA | ALDEIA NOVA | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 2012 |
| SANTOS SERVICOS MEDICOS LTDA | CENTRO | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 2014 |
| SAO JOAQUIM PECAS E REPRESENTACAO LTDA | CENTRO | Representantes comerciais e agentes do comércio de peças e acessórios novos e usados para veículos automotores | 2012 |
| SECRETARIA DA AGRICULTURA, PECUARIA, PRODUCAO SUSTENTAVEL E IRRIGACAO | ZONA RURAL | Pesquisa e desenvolvimento experimental em ciências físicas e naturais | 2017 |
| SECRETARIA MUNICIPAL DE EDUCACAO | CENTRO | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 2015 |
| SERRA DO SUDESTE AGROPECUARIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 1984 |
| SERRARIA RAMPANELLI LTDA | POLO MADEIREIRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, municipal | 2000 |
| SETA SA EXTRATIVA TANINO DE ACACIA | ZONA RURAL | Cultivo de acácia-negra | 2015 |
| SIGESC SISTEMAS DE GESTAO DE CONVENIOS LTDA | CENTRO | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 2018 |
| SILVANA DA SILVA GULARTE LTDA | PARAISO II | Atividades de intermediação e agenciamento de serviços e negócios em geral, exceto imobiliários | 2025 |
| SILVESTRIN FRUTAS LTDA | PRIMEIRO DISTRITO SANTA BARBARA | Cultivo de frutas de lavoura permanente não especificadas anteriormente | 2025 |
| SINDICATO DOS MUNICIPARIOS DE ENCRUZILHADA DO SUL | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1993 |
| SINDICATO DOS PROFISSIONAIS DA EDUCACAO DE ENCRUZILHADA DO SUL | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 2004 |
| SINDICATO DOS TRAB NAS IND DA CONST E MOB DE ENCRUZ SUL | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1990 |
| SINDICATO DOS TRABALHADORES RURAIS | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1970 |
| SINDICATO RURAL DE ENCRUZILHADA DO SUL | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1968 |
| SISTEMA DE INTELIGENCIA AVANCADA ANDRADE LTDA | CENTRO | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2021 |
| SKOPINSKI TURISMO LTDA | DERVIACAO A EST ESTEFANIA | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, sob regime de fretamento, intermunicipal, interestadual e internacional | 2024 |
| SL AUTO PECAS LTDA | ALTO ALEGRE | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2011 |
| SMJK ARTEFATOS DE CONCRETO LTDA | INTERIOR/ 1 SUBDISTRITO | Fabricação de outros artefatos e produtos de concreto, cimento, fibrocimento, gesso e materiais semelhantes | 2024 |
| SNK MERCADO E CONVENIENCIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2025 |
| SOCIEDADE CULTURAL E BENEFICIENTE MOCIDADE INDEPENDENTE | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1986 |
| SOCIEDADE ENCRUZILHADENSE DE AMPARO AO IDOSO | CENTRO | Instituições de longa permanência para idosos | 1985 |
| SOL DAS OLIVAS AZEITES LTDA | SERRA DOS ROSAS | Cultivo de frutas de lavoura permanente não especificadas anteriormente | 2022 |
| SORVETERIA KASQUITA LTDA | CENTRO | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 2026 |
| SP COMERCIO DE MATERIAIS DE CONSTRUCAO LTDA | CENTRO | Construção de edifícios | 2025 |
| STRASSBURGER PARTICIPACOES EMPRESARIAIS LTDA | VILA MANOELA COM VILA XAVIER | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2025 |
| SUL AGRICOLA BENEFICIADORA LTDA | CENTRO | Atividades de pós-colheita | 2024 |
| T A EXTRACAO FLORESTAL E TRANSPORTE LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2018 |
| TAINAN FREITAS SPERB LTDA | COHAB | Atividades de fisioterapia | 2026 |
| TAMO LAH SERVICOS DE APOIO ADMINISTRATIVO LTDA | CENTRO | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2024 |
| TANAC SA EM RECUPERACAO JUDICIAL | 3 SUBDISTRITO | Extração de madeira em florestas plantadas | 2022 |
| TANAC SA EM RECUPERACAO JUDICIAL | ZONA RURAL | Extração de madeira em florestas plantadas | 2022 |
| TANAGRO SA EM RECUPERACAO JUDICIAL | CENTRO | Extração de madeira em florestas plantadas | 1987 |
| TANAGRO SA EM RECUPERACAO JUDICIAL | ZONA RURAL | Extração de madeira em florestas plantadas | 2013 |
| TANAGRO SA EM RECUPERACAO JUDICIAL | ZONA RURAL | Extração de madeira em florestas plantadas | 2016 |
| TATIANE MAINARDI DOIMEADIOS SOCIEDADE INDIVIDUAL DE ADVOCACIA | CENTRO | Serviços advocatícios | 2026 |