| ENCOPAV ENGENHARIA LTDA | AREA RURAL DE CRUZ ALTA | Fabricação de outros produtos de minerais não-metálicos não especificados anteriormente | 2022 |
| ENG+ SOLAR LTDA | JARDIM PETROPOLIS | Instalação e manutenção elétrica | 2025 |
| ENGMAX LTDA | TORIBIO VERISSIMO | Impermeabilização em obras de engenharia civil | 2025 |
| EON ENERGIA E ILUMINACAO LTDA | TAMOIO | Manutenção de redes de distribuição de energia elétrica | 2017 |
| EPOKA - TRANSPORTES RODOVIARIOS LTDA | SANTA HELENA | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2021 |
| EQUALIZAGRO CONSULTORIA E TECNOLOGIA LTDA | CENTRO | Atividades de apoio à agricultura não especificadas anteriormente | 2015 |
| EQUILIBRIUM CENTRO TERAPEUTICO DA OBESIDADE LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial com recursos para realização de procedimentos cirúrgicos | 2001 |
| ERICO FRANCISCO A ZANETTI | CENTRO | Atividade Econônica não informada | 1980 |
| ERICO VERISSIMO GESTAO DE AEROPORTO LTDA | BENJAMIN NOTT | Aluguel de imóveis próprios | 2020 |
| ERNESTO DORNELLES RIBEIRO & CIA LTDA | BRUM | Construção de edifícios | 2021 |
| ERR TRANSPORTES LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2011 |
| ERTHAL NEGOCIOS LTDA | DOS FUNCIONARIOS | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 1987 |
| ESATTA LABORATORIO DE ANALISES CLINICAS LTDA | CENTRO | Laboratórios clínicos | 2010 |
| ESCAPAMENTOS CRUZ ALTA LTDA | BONINI II | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2001 |
| ESCOLA CRISTA DE EDUCACAO INFANTIL PEQUENO DISCIPULO LTDA | PEDRO BONINI | Educação infantil - creche | 2025 |
| ESCOLA DAS NRS CURSOS E TREINAMENTOS LTDA | SAO MIGUEL | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2024 |
| ESCOLA DE APERFEICOAMENTO DE SARGENTOS | CENTRO | Defesa | 2008 |
| ESCOLA DE APERFEICOAMENTO DE SARGENTOS | CENTRO | Defesa | 2008 |
| ESCOLA DE EDUCACAO INFANTIL AQUARELA CRUZ ALTA LTDA | CENTRO | Educação infantil - creche | 2024 |
| ESCOLA INFANTIL ESTACAO CRIANCA LTDA | CENTRO | Educação infantil - creche | 1997 |
| ESCOLINHA DE FUTEBOL GREMINHO CRUZ ALTA LTDA | CENTRO | Ensino de esportes | 2008 |
| ESCOLINHA DENTINHO DE LEITE LTDA | BONINI 1 | Educação infantil - pré-escola | 1989 |
| ESCOLINHA DESPORTIVA VERDES MARES | CENTRO | Atividades de condicionamento físico | 2011 |
| ESCRITORIO CONTABIL CONTAGRICOLA LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 1994 |
| ESCRITORIO CONTABIL ELY MARQUES LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2012 |
| ESCRITORIO CONTABIL LEI LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2005 |
| ESCRITORIO GIALI LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2009 |
| ESCRITORIO MODELO LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 1990 |
| ESPACO DA BELEZA GREICE SANTOS LTDA | SAO MIGUEL | Cabeleireiros, manicure e pedicure | 2021 |
| ESPACO DA CASA RS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros artigos de uso pessoal e doméstico não especificados anteriormente | 2010 |
| ESPACO INCLUIR SERVICOS TRANSDISCIPLINAR DA INFANCIA E DO ADOLESCENTE LTDA | CENTRO | Outras atividades de atenção à saúde humana não especificadas anteriormente | 2020 |
| ESPACO SAUDE E CONDICIONAMENTO LTDA | PERPETUO SOCORRO | Atividades de condicionamento físico | 2026 |
| ESPACO VM MODAS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2022 |
| ESPORTE CLUBE NACIONAL | VILA NOVA | Clubes sociais, esportivos e similares | 1979 |
| ESSENCE DECOR LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros artigos de uso pessoal e doméstico não especificados anteriormente | 2019 |
| ESSENCE DECOR LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros artigos de uso pessoal e doméstico não especificados anteriormente | 2021 |
| ESSENCE DECOR LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros artigos de uso pessoal e doméstico não especificados anteriormente | 2023 |
| ESSENCIAL ODONTOLOGIA ESPECIALIZADA | CENTRO | Atividade odontológica | 2023 |
| ESTACIONAMENTO DESCA LTDA | SAO MIGUEL | Estacionamento de veículos | 2014 |
| ESTANCIA DO ESPINILHO AGRICULTURA E PECUARIA LTDA | 1 DISTRITO | Criação de bufalinos | 1974 |
| ESTELA DA SILVA MACHADO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de suvenires, bijuterias e artesanatos | 2026 |
| ESTETICA DEPILACAO BULLE LTDA | CENTRO | Atividades de estética e outros serviços de cuidados com a beleza | 2022 |
| ESTETICA GISA LTDA | CENTRO | Atividades de estética e outros serviços de cuidados com a beleza | 2006 |
| ESTHER LOURDES INACIO LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2025 |
| ESTIMULARE EMS CENTRO DE TREINAMENTO FISICO LTDA | CENTRO | Atividades de condicionamento físico | 2022 |
| ESTRELAR AUTO ELETRICA LTDA | BONINI II | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 1985 |
| ESTRELAR AUTOPECAS LTDA | PEDRO BONINI | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2025 |
| ESTRUACO ESTRUTURAS METALICAS LTDA | ALIANCA | Fabricação de artigos de serralheria, exceto esquadrias | 2016 |
| ETELVINO KNEBEL VIANA LTDA | VILA BRENNER | Transporte escolar | 1993 |
| EVANDRO CARLOS MANJABOSCO LTDA | SAO MIGUEL | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2022 |