| SINDICATO DOS HOTEIS RESTAURANTES BARES E SIMILARES DE ITAPERUNA | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1997 |
| SINDICATO DOS PROFESSORES DO NORTE-NOROESTE FLUMINENSE | CIDADE NOVA | Atividades de organizações sindicais | 2004 |
| SINDICATO DOS PROPAGANDISTAS, PROPAGANDISTAS VENDEDORES E VENDEDORES DE PRODUTOS FARMACEUTICOS DO MUNICIPIO DE ITAPERUNA - SINPROITA | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 2015 |
| SINDICATO DOS TRABALHADORES AUTONOMOS DE VEICULOS RODOVIARIOS DE ITAPERUNA | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1970 |
| SINDICATO DOS TRABALHADORES E TRABALHADORAS RURAIS DE ITAPERUNA SAO JOSE DE UBA NATIVIDADE VARRE SAI E LAJE DO MURIAE RJ | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 2008 |
| SINDICATO EMPREGADOS NO COMERCIO DE ITAPERUNA | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1977 |
| SINDICATO EST DOS PROFIS DA EDUCACAO DO RIO DE JANEIRO | CIDADE NOVA | Atividades de organizações sindicais | 2003 |
| SINDICATO RURAL DE ITAPERUNA | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1970 |
| SINERGIA PROJETOS E SUSTENTABILIDADE LTDA | AEROPORTO | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2014 |
| SIQUEIRA EMPREENDIMENTOS DE ITAPERUNA LTDA | CENTRO | Marketing direto | 2021 |
| SIQUEIRA & PEGORARO LTDA M E | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 1993 |
| SIS - SERVICOS INTEGRADOS EM SAUDE LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2011 |
| SISTEC SERVICOS DE MANUTENCAO ELETRICA LTDA | CENTRO | Comércio atacadista de outras máquinas e equipamentos não especificados anteriormente; partes e peças | 2014 |
| SISTEMA EDUCACIONAL UNICO LTDA | PRESIDENTE COSTA E SILVA | Ensino fundamental | 2001 |
| SJJM MOVEIS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de móveis | 2020 |
| SL ATACADISTA DE COSMETICOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de cosméticos, produtos de perfumaria e de higiene pessoal | 2022 |
| SLD PARTICIPACOES, EMPREENDIMENTOS E AGROPECUARIA LTDA | AEROPORTO | Compra e venda de imóveis próprios | 2024 |
| SLEEP HOMEWEAR E-COMMERCE LTDA | VINHOSA | Confecção de peças de vestuário, exceto roupas íntimas e as confeccionadas sob medida | 2026 |
| SLEEP INDUSTRIA DE CONFECCOES LTDA | VINHOSA | Confecção de peças de vestuário, exceto roupas íntimas e as confeccionadas sob medida | 2009 |
| SLEEP INDUSTRIA DE ROUPAS ITAPERUNA LTDA M E | CENTRO | Confecção de roupas íntimas | 1983 |
| SLEEPY CONFECCOES DE MURIAE LTDA | RAPOSO | Confecção de roupas íntimas | 2023 |
| SLIPPERS CHINELOS LTDA | SAO MATEUS | Fabricação de calçados de materiais não especificados anteriormente | 2012 |
| SLS SOUZA COMERCIO LTDA | NITEROI | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2011 |
| SM EQUIPAMENTOS MEDICOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos médicos e ortopédicos | 2024 |
| SM SOLAR LTDA | GOV ROBERTO SILVEIRA | Instalação e manutenção elétrica | 2022 |
| SM SOLUCAO EM SAUDE LTDA | CIDADE NOVA | Atividades de atendimento em pronto-socorro e unidades hospitalares para atendimento a urgências | 2025 |
| SMARCARO ENGENHARIA LTDA | CIDADE NOVA | Construção de edifícios | 2019 |
| SMART BEAUTY ITAPERUNA LTDA | CENTRO | Atividades de estética e outros serviços de cuidados com a beleza | 2025 |
| SMART ITAPERUNA ACADEMIA DE GINASTICA LTDA | CIDADE NOVA | Atividades de condicionamento físico | 2023 |
| SMM TORRES CURSOS E EVENTOS LTDA | CIDADE NOVA | Outras atividades de ensino não especificadas anteriormente | 2005 |
| SMR COMERCIO E RECUPERACAO DE SUCATAS LTDA | AEROPORTO | Comércio atacadista de produtos siderúrgicos e metalúrgicos, exceto para construção | 2019 |
| SN JOGOS E ACESSORIOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de brinquedos e artigos recreativos | 2024 |
| SNP CENTRO DE COGNICAO E LINGUAGEM LTDA | PRESIDENTE COSTA E SILVA | Atividades de fonoaudiologia | 2025 |
| SNS MOVEIS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de móveis | 2014 |
| SO PECAS COMERCIO DE ELETRODOMESTICOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 1995 |
| SOARES DIAS REPRESENTACOES LTDA | LIONS | Representantes comerciais e agentes do comércio de madeira, material de construção e ferragens | 2022 |
| SOARES E DIAS DISTRIBUIDORA LTDA | C. E SILVA | Comércio atacadista de embalagens | 2024 |
| SOARES E OLIVEIRA COMERCIO DE CARNES LTDA M E | NITEROI | Comércio varejista de carnes - açougues | 2007 |
| SOARES E PEREIRA MERCADO LTDA M E | SEGUNDO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2007 |
| SOARES E SOARES BOM JESUS COMERCIO DE MOTOS LTDA | AEROPORTO | Comércio a varejo de motocicletas e motonetas usadas | 2017 |
| SOBRADO ADMINISTRACAO E CORRETAGEM DE IMOVEIS LTDA | PRESIDENTE COSTA E SILVA | Corretagem na compra e venda e avaliação de imóveis | 1979 |
| SOCIEDADE EDUCACIONAL BEGNI & BOECHAT - SEBB | LIONS | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2019 |
| SOCIEDADE INDIVIDUAL DE ADVOCACIA RODRIGO JOSE DA ROCHA JORGE | CIDADE NOVA | Serviços advocatícios | 2009 |
| SOCIEDADE MUSICAL ITAPERUNENSE | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1981 |
| SOCIEDADE UNIPESSOAL INCORPORADORA HEITOR ANTONIO DA SILVA - SPE LTDA | MINISTRO SA TINOCO | Construção de edifícios | 2021 |
| SOCIEDADE UNIVERSITARIA REDENTOR S.A | CIDADE NOVA | Educação superior - graduação e pós-graduação | 2000 |
| SOCIEDADE UNIVERSITARIA REDENTOR S.A | CIDADE NOVA | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2019 |
| SOCIEDADE UNIVERSITARIA REDENTOR S.A | CENTRO | Atividade médica ambulatorial com recursos para realização de exames complementares | 2025 |
| SOCIL SOCIEDADE COML E EMPAC DE CONDIMENTOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - hipermercados | 1986 |
| SOCORRO ITAPERUNA LOCALIZACAO E REMOCAO DE AUTOS LTDA | CIDADE NOVA | Serviços de reboque de veículos | 2017 |