| FUNDO MUNICIPAL DO IDOSO - FMI | CENTRO | Serviços de assistência social sem alojamento | 2017 |
| FUNDO MUNICIPAL DO MEIO AMBIENTE - FMMA | CENTRO | Administração pública em geral | 2015 |
| FUNDO MUNICIPAL DOS DIREITOS DA CRIANCA E DO ADOLESCENTE DE SAO TOME | CENTRO | Serviços de assistência social sem alojamento | 1994 |
| FUNDO MUNICIPAL DOS DIREITOS DA MULHER - FMDM | CENTRO | Administração pública em geral | 2025 |
| FUNDO MUNICIPAL DOS DIREITOS DA PESSOA COM DEFICIENCIA | CENTRO | Administração pública em geral | 2022 |
| G. L. DE AGUILAR TRANSPORTE LTDA | JARDIM POR DO SOL | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, sob regime de fretamento, intermunicipal, interestadual e internacional | 2017 |
| G23 GRAFICA RAPIDA LTDA | CENTRO | Impressão de material para uso publicitário | 2024 |
| GABRIEL A. FADONI MEDICO LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2023 |
| GABRIELA JANKE PSICOLOGIA LTDA | ZONA RURAL | Atividades de psicologia e psicanálise | 2024 |
| GIMENES & GONCALVES LTDA | JARDIM ALEXANDRE COLAUTO II | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2025 |
| GRUPO BOTAN ENCARTELADOS LTDA | JARDIM ALEXANDRE COLAUTO II | Comércio atacadista de outros equipamentos e artigos de uso pessoal e doméstico não especificados anteriormente | 2019 |
| H J C MOVEIS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de móveis | 2023 |
| H. W. TURISMO LTDA | JARDIM SAO JOSE | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, sob regime de fretamento, intermunicipal, interestadual e internacional | 2013 |
| HL BARBOSA TRANSPORTES LTDA | ZONA RURAL | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, municipal | 2026 |
| HMM UTILIDADES LTDA | JARDIM SÃO JOSÉ | Comercio varejista de artigos de cama, mesa e banho | 2026 |
| IGREJA COMUNIDADE EVANGELICA HA ESPERANCA | CENTRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2020 |
| IGREJA DOS TABERNACULOS DO SENHOR JESUS CRISTO | ZONA 01 | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1979 |
| IGREJA EVANGELICA ASSEMBLEIA DE DEUS REMANESCENTES DE ISRAEL | CENTRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2018 |
| IGREJA PENTECOSTAL JESUS E A NOSSA FORTALEZA | BAIRRO POR DO SOL | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2018 |
| IRMAOS LONBARDO PARTICIPACOES LTDA | CENTRO | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2025 |
| J L BORTOLATTO CONDIMENTOS LTDA | ZONA RURAL | Fabricação de especiarias, molhos, temperos e condimentos | 2018 |
| J.L.L.O GRAOS & INSUMOS LTDA | CENTRO | Comércio atacadista de cereais e leguminosas beneficiados | 2025 |
| J. L. RADDI LTDA | CENTRO | Comércio atacadista de cereais e leguminosas beneficiados | 1982 |
| J R CALCADOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de calçados | 2006 |
| J. R. DA SILVA MADEIRAS LTDA | GLEBA DOS SUTIS | Comércio atacadista de madeira e produtos derivados | 2005 |
| JOAO B D PEREIRA LTDA | RURAL | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2021 |
| JVS DEDETIZADORA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de produtos saneantes domissanitários | 2015 |
| KAIROS - MATERIAIS DE CONSTRUCAO LTDA | GLEBA SUTIS | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2014 |
| KI BURGAO LANCHES E SORVETES LTDA | CENTRO | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 2022 |
| L. ALVES MOREIRA FISIOTERAPIA LTDA | JARDIM PRIMAVERA | Atividades de fisioterapia | 2019 |
| L N COLAUTO SERVICOS MEDICOS LTDA | JD ALEXANDRE COLAUTO II | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2022 |
| L R A - INDUSTRIA E COMERCIO DE ALIMENTOS LTDA | GLEBA DOS SUTIS | Fabricação de especiarias, molhos, temperos e condimentos | 2023 |
| LABORATORIO SAO TOME LTDA | CENTRO | Laboratórios clínicos | 1988 |
| LAIS TRANSPORTES LTDA | CONJUNTO SAO MARCOS | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2025 |
| LAVANDERIA K LTDA | ZONA RURAL | Alvejamento, tingimento e torção em fios, tecidos, artefatos têxteis e peças do vestuário | 2015 |
| LECACAU CHOCOLATES LTDA | GLEBA DOS SUTIS | Fabricação de produtos derivados do cacau e de chocolates | 2019 |
| LEMILK CHOCOLATES LTDA | GLEBA DOS SUTIS | Fabricação de produtos derivados do cacau e de chocolates | 2022 |
| LJ COMERCIO DE PALHAS LTDA | ZONA RURAL | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 2023 |
| LOTEADORA ILHA BELA LTDA | GLEBA DOS SUTIS | Loteamento de imóveis próprios | 2011 |
| LOTERICA FACCIN LTDA | CENTRO | Casas lotéricas | 2014 |
| M. A. PIRES LTDA | JARDIM ALEXANDRE COLAUTO I | Preparação de documentos e serviços especializados de apoio administrativo não especificados anteriormente | 2016 |
| M D M GONCALVES COMERCIO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 1996 |
| M R DE LIMA SILVA E CIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de móveis | 2017 |
| MADEIREIRA DO CARLINHOS LTDA | GLEBA DOS SUTIS | Comércio varejista de madeira e artefatos | 2008 |
| MAIS SORVETES ARTESANAIS LTDA | CENTRO | Fabricação de sorvetes e outros gelados comestíveis | 2022 |
| MARMORARIA SAO TOME LTDA | CENTRO | Aparelhamento de placas e execução de trabalhos em mármore, granito, ardósia e outras pedras | 2026 |
| MAXXI TELECOMUNICACOES LTDA | CENTRO | Provedores de acesso às redes de comunicações | 2022 |
| MELUZ MATERIAS ELETRICOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de material elétrico | 2004 |
| MEREGE BIORREFINARIA LTDA | RURAL | Tratamento e disposição de resíduos não-perigosos | 2019 |
| MEREGEFERT AGRICULTURA REGENERATIVA LTDA | RURAL | Fabricação de adubos e fertilizantes organo-minerais | 2009 |