| ECOTERRA ASSESSORIAS E PROJETOS LTDA | MORADA DOS IPES | Serviços de agronomia e de consultoria às atividades agrícolas e pecuárias | 2011 |
| EDSON CABOCLO CONTABILIDADE LTDA | MORADA DOS YPES | Atividades de contabilidade | 2018 |
| ELAN COIMBRA LIMA LTDA | JARDIM PLANALTO | Atividades de apoio à pecuária não especificadas anteriormente | 2025 |
| ELDORADO HOTEL LTDA | CENTRO | Hotéis | 1982 |
| ELETROAR AUTO ELETRICA E AUTOCLIMA LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2017 |
| ELETROLUZ RIO CLARO COMERCIO VAREJISTA DE MATERIAIS ELETRICOS E ELETRONICOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de material elétrico | 1989 |
| ELETROMAR MOVEIS E ELETRODOMESTICOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista especializado de eletrodomésticos e equipamentos de áudio e vídeo | 1992 |
| ELIZABETH NUNES DE SOUSA LTDA | JARDIM PLANALTO | Comércio varejista de brinquedos e artigos recreativos | 2022 |
| ELZA M DA CONCEICAO LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de automóveis, camionetas e utilitários usados | 2012 |
| EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS COSTA PAIXAO LTDA | CENTRO | Loteamento de imóveis próprios | 2020 |
| EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS VILLA LTDA | CENTRO | Aluguel de imóveis próprios | 2024 |
| EMPRESA BRASILEIRA DE CORREIOS E TELEGRAFOS | CENTRO | Atividades do Correio Nacional | 1983 |
| ESTELA KAROLINE DIAS CABOCLO LTDA | JARDIM RIO CLARO | Atividades de profissionais da área de saúde não especificadas anteriormente | 2025 |
| EVAK SOLUCOES INOVA SIMPLES (I.S.) | CENTRO | Consultoria em tecnologia da informação | 2025 |
| F.L. TRANSPORTES E POSTO DE MOLAS LTDA | EXPANSAO URBANA | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2025 |
| F R PECAS ELETRICAS LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2021 |
| F. UEMURA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2025 |
| FABRICACAO DE PRE MOLDADO E CONCRETO LACHOVICZ LTDA | ZONA RURAL | Preparação de massa de concreto e argamassa para construção | 2024 |
| FALL COMUNICACOES INTEGRADAS LTDA | PLANALTO | Agências de publicidade | 2009 |
| FARMACIA RIO CLARO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de produtos farmacêuticos, sem manipulação de fórmulas | 1986 |
| FASHION CLICK LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2024 |
| FATURE INDUSTRIA E COMERCIO DE CEREAIS IMPORTACAO E EXPORTACAO LTDA | CENTRO | Comércio atacadista de soja | 2016 |
| FAZENDA MADEIRA ADMINISTRACAO PARTICIPACOES E AGROPECUARIA LTDA | ZONA RURAL | Cultivo de soja | 2025 |
| FENAN AGROPECUARIA LTDA | CENTRO | Atividades de apoio à pecuária não especificadas anteriormente | 1989 |
| FENAN AGROPECUARIA LTDA | ZONA RURAL | Atividades de apoio à pecuária não especificadas anteriormente | 1989 |
| FF GESTAO DE POLOS LTDA | CENTRO | Educação profissional de nível técnico | 2026 |
| FISIOCLIN CLINICA DE FISIOTERAPIA LTDA | CENTRO | Atividades de fisioterapia | 1999 |
| FISIOCLIN CLINICA DE FISIOTERAPIA LTDA | CENTRO | Atividades de fisioterapia | 2026 |
| FN COMERCIO DE PECAS E IMPLEMENTOS AGRICOLAS LTDA | JARDIM RIO CLARO | Comércio atacadista de máquinas, aparelhos e equipamentos para uso agropecuário; partes e peças | 2019 |
| FORTE FERRGENS E MATERIAL PRA CONSTRUCAO LTDA | BELA VISTA | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2026 |
| FRANCIANO MAYER DO CAMPO LTDA | ZONA RURAL | Serviço de preparação de terreno, cultivo e colheita | 2026 |
| FS FLORESTAL S.A | ZONA RURAL | Cultivo de eucalipto | 2025 |
| FUNDO MUNICIPAL DE ASSISTENCIA SOCIAL | CENTRO | Administração pública em geral | 1996 |
| FUNDO MUNICIPAL DE CULTURA DE SAO JOSE DO RIO CLARO | CENTRO | Administração pública em geral | 2020 |
| FUNDO MUNICIPAL DE DIREITOS DA CRIANCA E DO ADOLESCENTE FMDCA | CENTRO | Administração pública em geral | 2007 |
| FUNDO MUNICIPAL DE EDUCACAO DO MUNICIPIO DE SAO JOSE DO RIO CLARO | CENTRO | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 2018 |
| FUNDO MUNICIPAL DE ESPORTE E LAZER - FMEL | JARDIM PLANALTO | Administração pública em geral | 2026 |
| FUNDO MUNICIPAL DE MEIO AMBIENTE - FMMA | CENTRO | Administração pública em geral | 2025 |
| FUNDO MUNICIPAL DE SAUDE | CENTRO | Administração pública em geral | 2010 |
| FUNDO MUNICIPAL DE TRANSPORTES | CENTRO | Administração pública em geral | 2024 |
| FUNDO MUNICIPAL DOS DIREITOS DA PESSOA IDOSA DO MUNICIPIO DE SAO JOSE DO RIO CLARO | CENTRO | Administração pública em geral | 2020 |
| FUNERARIA SANTA CLARA LTDA | CENTRO | Serviços de funerárias | 2000 |
| G ALCANTARA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de produtos farmacêuticos, sem manipulação de fórmulas | 2016 |
| G.S. COMERCIAL DE GENEROS ALIMENTICIOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2004 |
| GABRIEL ZILKI SERVICOS MEDICOS LTDA | CENTRO | Atividades de atendimento em pronto-socorro e unidades hospitalares para atendimento a urgências | 2021 |
| GABRIELA ANTUNES DE MENDONCA SILVA LTDA | MORADA DOS IPES | Atividades de psicologia e psicanálise | 2026 |
| GALVAO ENGENHARIA LTDA | PROGRESSO | Serviços de engenharia | 2018 |
| GASPAR RADIODIFUSAO LTDA | JARDIM RIO CLARO | Atividades de rádio | 1989 |
| GAZIN INDUSTRIA E COMERCIO DE MOVEIS E ELETRODOMESTICOS S.A | CENTRO | Comércio varejista especializado de eletrodomésticos e equipamentos de áudio e vídeo | 1996 |
| GB SEGURANCA DO TRABALHO E TREINAMENTOS LTDA | PLANALTO | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2023 |