| AGUAS DE SAO JOSE S.A | CENTRO | Captação, tratamento e distribuição de água | 2008 |
| AGUIA SERVICOS DE CONSTRUCAO LTDA | ZONA RURAL | Fabricação de estruturas pré-moldadas de concreto armado, em série e sob encomenda | 2015 |
| AGV PROMOCAO DE VENDAS LTDA | PLANALTO | Promoção de vendas | 2026 |
| ALCANTERA TERRAPLANAGEM E TRANSPORTES LTDA | ZONA RURAL | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, municipal | 2025 |
| ALFA GESTAO DE POLOS LTDA | CENTRO | Educação profissional de nível técnico | 2023 |
| ALGO A MAIS PRESENTES LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2019 |
| ALINE YARA MASCHIO ENFERMAGEM LTDA | MORADA DOS IPES | Atividades de enfermagem | 2022 |
| ALLREDE TELECOM LTDA | CENTRO | Promoção de vendas | 2023 |
| ALMEIDA EDVANI GESTAO JURIDICA E EMPRESARIAL LTDA | PLANALTO | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2020 |
| ALMEIDA F ODONTOLOGIA LTDA | CENTRO | Atividade odontológica | 2026 |
| ALPHA FITNESS ACADEMIA LTDA | NOVO HORIZONTE | Atividades de condicionamento físico | 2025 |
| AMA INVESTIMENTOS IMOBILIARIOS LTDA | CENTRO | Holdings de instituições não-financeiras | 2015 |
| AMARELINHA COMUNICACAO VISUAL E PRESTADORA DE SERVICOS LTDA | CENTRO | Impressão de material para uso publicitário | 2013 |
| AMG ALUGUEIS E SERVICOS LTDA | CENTRO | Aluguel de máquinas e equipamentos para escritórios | 2012 |
| AMORIM CENTRO DE TREINAMENTO LTDA | CENTRO | Atividades de condicionamento físico | 2021 |
| ANGELA MARCIA SILVA NEVES LTDA | CENTRO | Serviços de assistência social sem alojamento | 2025 |
| ANGELICA BEATRIZ FERNANDES PINTO DA SILVA LTDA | MORADA DOS IPES | Atividades de psicologia e psicanálise | 2023 |
| ANIBALE COMERCIO DE MAQUINAS E EQUIPAMENTOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista especializado de equipamentos e suprimentos de informática | 2005 |
| ANIMAL HEALTH SERVICOS VETERINARIOS LTDA | CENTRO | Atividades veterinárias | 2021 |
| APASA INDUSTRIAL E AGROFLORESTAL LTDA | CENTRO | Serrarias com desdobramento de madeira em bruto | 1968 |
| APASA INDUSTRIAL E AGROFLORESTAL LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, municipal | 2013 |
| APL SERVICOS AGRICOLAS LTDA | CENTRO | Serviço de pulverização e controle de pragas agrícolas | 2025 |
| APROCLARO ASSOCIACAO DOS PEQUENOS PRODUTORES RURAIS DE SAO JOSE DO RIO CLARO | ZONA RURAL | Comércio varejista de hortifrutigranjeiros | 2021 |
| ARAUJO COMERCIO DE CALCADOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de calçados | 2024 |
| ARAUJO COMERCIO E CONFECCOES LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2016 |
| ARINOS COMUNICACAO LTDA | JARDIM DO RIO CLARO 2 | Marketing direto | 2025 |
| ARMAZEM ALTO DA MATA LTDA | ZONA RURAL | Depósitos de mercadorias para terceiros, exceto armazéns gerais e guarda-móveis | 2019 |
| ARTE METALICA SERRALHERIA LTDA | JARDIM RIO CLARO | Fabricação de esquadrias de metal | 2018 |
| ASSOC DE PAIS E AMIGOS DOS EXCEPCIONAIS DE S J R CLARO MANTENEDORA DA ESCOLA ESPECIAL JAIME VERISSIMO CAMPOS JUNIOR | PROGRESSO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1991 |
| ASSOC DESP E CULT DOS EMP DA DEST A LIBRA E FORNECEDORE | ZONA RURAL | Outras atividades esportivas não especificadas anteriormente | 1992 |
| ASSOCIACAO AGROPECUARIA E INDUSTRIAL DE S JOSE RIO CLAR | AREA DE EXPANSAO URBANA | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1991 |
| ASSOCIACAO ARINOS MATA VIVA | CENTRO | Atividades de organizações associativas patronais e empresariais | 2010 |
| ASSOCIACAO BATISTA DA CIDADE - ABC | CENTRO | Educação infantil - creche | 2022 |
| ASSOCIACAO BENEFICIENTE EVANGELICA SALVANDO VIDAS | ASSENTAMENTO POUSO ALEGRE | Atividades de fornecimento de infra-estrutura de apoio e assistência a paciente no domicílio | 2017 |
| ASSOCIACAO COMERCIAL E EMPRESARIAL DE SAO JOSE DO RIO CLARO | CENTRO | Atividades de organizações associativas patronais e empresariais | 1997 |
| ASSOCIACAO COMUNITARIA BENEFICIENTE RIOCLARENSE | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1998 |
| ASSOCIACAO COMUNITARIA DO BAIRRO JARDIM RIO CLARO | JARDIM RIO CLARO | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2007 |
| ASSOCIACAO CULTURAL,EDUCACAO, MEIO AMBIENTE E DESENVOLVIMENTO SUSTENTAVEL DE SAO JOSE DO RIO CLARO-MT | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2014 |
| ASSOCIACAO DE PEQUENOS PRODUTORES RURAIS FRANCISCO CASTANHA | ZONA RURAL | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2017 |
| ASSOCIACAO DE PEQUENOS PRODUTORES RURAIS JACAMIM | SEDE | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2001 |
| ASSOCIACAO DE PEQUENOS PRODUTORES RURAIS POUSO ALEGRE | KM 30 ZONA RURAL | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1998 |
| ASSOCIACAO DE PRODUTORES RUAIS P A CAMPINAS | ZONA RURAL | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2010 |
| ASSOCIACAO DE PRODUTORES RURAIS SANT'ANA DA AGUA LIMPA | ZONA RURAL | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2003 |
| ASSOCIACAO DOS ACADEMICOS DE SAO JOSE DO RIO CLARO - AAS | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2006 |
| ASSOCIACAO DOS BENEFICIARIOS DA RODOVIA SERAFIM ADALBERTO TICIANELI | ZONA RURAL | Atividades de organizações associativas patronais e empresariais | 2003 |
| ASSOCIACAO DOS PEQUENOS PRODUTORES UNIAO SANTA MARIA | ZONA RURAL | Atividades de organizações sindicais | 1988 |
| ASSOCIACAO DOS PRODUTORES VALE DO RIO ALEGRE - APROVALE | CENTRO | Outras atividades associativas profissionais | 2008 |
| ASSOCIACAO DOS ROTARYANOS DE SAO JOSE DO RIO CLARO | CENTRO | Outras atividades associativas profissionais | 1992 |
| ASSOCIACAO ONG AUMIAU UMA CHANCE PARA O AMOR | CENTRO | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2022 |
| ASSOCIACAO SANTA CLARA DOS PRODUTORES RURAIS DO P A SANTANA DA AGUA LIMPA S J R CLARO | Z RURAL | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2008 |