| MADGAR MADEIRAS LTDA | AREA DE ESPANSAO URBANA | Serrarias com desdobramento de madeira em bruto | 2015 |
| MAIZ SOJA AGRICULTURA DE PRECISAO LTDA | MORADA DOS IPES | Atividades de apoio à agricultura não especificadas anteriormente | 2017 |
| MANUTENCAO DE MAQUINAS AGRICOLA SANTANA LTDA | ZONA RURAL | Serviços de manutenção e reparação elétrica de veículos automotores | 2025 |
| MARAVILHA ARMAZENS GERAIS LTDA - EM RECUPERACAO JUDICIAL | ZONA RURAL | Comércio atacadista de matérias-primas agrícolas não especificadas anteriormente | 1993 |
| MARAVILHA TRANSPORTES LTDA - EM RECUPERACAO JUDICIAL | ZONA RURAL | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2014 |
| MARCIO ENGENHARIA E INSTALACAO LTDA | VILA CANARIO | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2019 |
| MARCONDES AGROPECUARIA LTDA | ZONA RURAL | Cultivo de soja | 1989 |
| MARCONDES AGROPECUARIA LTDA | ZONA RURAL | Cultivo de soja | 2024 |
| MARCOS HORACIO DE SOUZA LTDA | JARDIRM RIO CLARO | Serviços de manutenção e reparação mecânica de veículos automotores | 2025 |
| MARIA EDUARDA SERVICOS DE ENFERMAGEM LTDA | CENTRO | Atividades de enfermagem | 2024 |
| MARTINS AUTOMACAO INDUSTRIAL LTDA | ZONA RURAL | Instalação de máquinas e equipamentos industriais | 2019 |
| MARTINS & HAACK LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2003 |
| MASSAPE MARKETING E COMUNICACAO LTDA | PLANALTO | Atividades de produção cinematográfica, de vídeos e de programas de televisão não especificadas anteriormente | 2023 |
| MATEI & CIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de gás liqüefeito de petróleo (GLP) | 2025 |
| MATEI & CIA LTDA | JARDIM OLINDA | Comércio varejista de gás liqüefeito de petróleo (GLP) | 2025 |
| MATEI E MATEI LTDA | JARDIM RIO CLARO | Comércio varejista de mercadorias em lojas de conveniência | 2020 |
| MATEI E MATEI LTDA | CENTRO | Serviços de entrega rápida | 2020 |
| MATEI E MATEI LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em lojas de conveniência | 2020 |
| MATEI E MATEI LTDA | JARDIM RIO CLARO | Restaurantes e similares | 2023 |
| MATEI E MATEI LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em lojas de conveniência | 2025 |
| MC CONFECCOES E VARIEDADES LIMITADA | CENTRO | Comércio atacadista de artigos do vestuário e acessórios, exceto profissionais e de segurança | 2021 |
| MD COMERCIO DE MATERIAIS P/ CONSTRUCAO E TRANSPORTADORA LTDA | JARDIM RIO CLARO | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2020 |
| MD COMERCIO DE MATERIAIS P/ CONSTRUCAO E TRANSPORTADORA LTDA | JARDIM RIO CLARO | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2024 |
| MD TRANSPORTADORA LTDA | MORADA DOS IPES | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2019 |
| MDA EMPORIO E PLANEJADOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de móveis | 2025 |
| MECANICA CALADAO LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 1993 |
| MECANICA VENANCIO BRITO LTDA | NOVO HORIZONTE | Manutenção e reparação de tratores agrícolas | 2021 |
| MEDALHA MILAGROSA TRANSPORTES E LOCACAO LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2024 |
| MEKK DO BRASIL METALURGICA E MONTAGEM INDUSTRIAL LTDA | ZONA RURAL | Montagem de estruturas metálicas | 2022 |
| MERCADO R R LTDA | CENTRO | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2009 |
| MERCADO WR LTDA | JARDIM OLINDA | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2011 |
| MERCEARIA E DISTRIBUIDORA MEGA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2022 |
| MERCEARIA PEROBAS LTDA | RESIDENCIAL SANTA TEREZINHA | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2022 |
| METALURGICA LACHOVICZ LTDA | ZONA RURAL | Fabricação de esquadrias de metal | 1997 |
| MGM CONSULTORIA LTDA | MORADA DOS IPES | Promoção de vendas | 2023 |
| MIBR SOLUCOES LTDA | CENTRO | Serviços de engenharia | 2024 |
| MILANI TRANSPORTES LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2024 |
| MILHORANCA EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS LTDA | CENTRO | Corretagem na compra e venda e avaliação de imóveis | 2018 |
| MISSISSIPI AGRONEGOCIOS E PARTICIPACOES S/A | CENTRO | Holdings de instituições não-financeiras | 2019 |
| MISSISSIPI EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS LTDA | CENTRO | Loteamento de imóveis próprios | 2009 |
| MKP AGRONEGOCIOS LTDA | CENTRO | Comércio atacadista de defensivos agrícolas, adubos, fertilizantes e corretivos do solo | 2024 |
| MOOV SERVICOS DE CONSTRUCAO INTELIGENTE LTDA | CENTRO | Obras de alvenaria | 2025 |
| MORAES CONSULTORIA E PROJETOS LTDA | ZONA RURAL | Instalação de máquinas e equipamentos industriais | 2020 |
| MORETTO & CIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de cosméticos, produtos de perfumaria e de higiene pessoal | 2008 |
| MPB LOPES SERVICOS MEDICOS LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2026 |
| MR TRANSPORTES LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2014 |
| MS AGRIMENSURA LTDA | MORADA DOS IPES | Serviços de cartografia, topografia e geodésia | 2026 |
| MUNICIPIO DE SAO JOSE DO RIO CLARO | CENTRO | Administração pública em geral | 1981 |
| MUNICIPIO DE SAO JOSE DO RIO CLARO | CENTRO | Outras atividades de atenção à saúde humana não especificadas anteriormente | 2009 |
| MUNICIPIO DE SAO JOSE DO RIO CLARO | CENTRO | Defesa Civil | 2007 |