| EMPRESA GONTIJO DE TRANSPORTES S/A | CENTRO | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, interestadual | 1996 |
| EMPRESA MELHORAMENTOS DE FRUTAL LTDA | CENTRO | Atividades de exibição cinematográfica | 1966 |
| EMPROS SOLUCOES CONTABEIS LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2023 |
| ENDO MAQUINAS AGRICOLAS LTDA | RENASCENCA | Comércio varejista de artigos de óptica | 1981 |
| ENG MINAS MATERIAIS ELETRICOS & HIDRAULICOS LTDA | ALTO BOA VISTA | Comércio varejista de material elétrico | 2008 |
| ENGAP CONCRETO PROJETADO LTDA | DISTRITO INDUSTRIAL | Preparação de massa de concreto e argamassa para construção | 2019 |
| ENGED PRODUCOES LTDA | VILA ESPERANCA | Ensino de música | 2015 |
| ENGEMON MONTAGENS E MATERIAIS ELETRICOS LTDA | NOSSA SENHORA APARECIDA | Comércio varejista de material elétrico | 2002 |
| ENGEMON MONTAGENS E MATERIAIS ELETRICOS LTDA | NOSSA SENHORA APARECIDA | Comércio varejista de material elétrico | 2012 |
| ENTIDADE DE ACOLHIMENTO INSTITUCIONAL GABRIEL LUIZ RIBEIRO | NOSSA SENHORA APARECIDA | Albergues assistenciais | 2018 |
| ENVIO COMERCIO E SOLUCOES INTEGRADAS LTDA | ALTO BOA VISTA | Atividades de intermediação e agenciamento de serviços e negócios em geral, exceto imobiliários | 2026 |
| EPA BELICA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de armas e munições | 2025 |
| EQUIPE DE VOLUNTARIAS FREI GABRIEL | CENTRO | Instituições de longa permanência para idosos | 1987 |
| ERG TRANSPORTES FRUTAL LTDA | NOVA FRUTAL | Transporte escolar | 2025 |
| ERICK GIBSON BELELA LTDA | JARDIM DO BOSQUE II | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2024 |
| ERITA FRANCIANE DA SILVA LOPES MARTINS LTDA | NOSSA SENHORA APARECIDA | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2017 |
| ERM TRANSPORTES E SERVICOS AGRICOLAS LTDA | RESIDENCIAL GAMMA | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2020 |
| ERMA CONSTRUTORA E COBRANCA LTDA | CENTRO | Atividades de cobranças e informações cadastrais | 2006 |
| ERMES NOGUEIRA DE MENEZES & CIA LTDA | ALTO BOA VISTA | Reparação e manutenção de equipamentos eletroeletrônicos de uso pessoal e doméstico | 2010 |
| ESCAPAMENTOS TRIANGULO ACESSORIOS E SERVICOS LTDA | ESTUDANTIL | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 1991 |
| ESCOLA DE EDUCACAO INFANTIL BEM-ME-QUER DE FRUTAL LTDA | NOSSA SENHORA DO CARMO | Educação infantil - pré-escola | 1997 |
| ESCOLA PARTICULAR CASTELO BRANCO DE FRUTAL LTDA | CENTRO | Ensino fundamental | 2000 |
| ESCOLA PARTICULAR GALILEU LTDA | CIDADE DAS AGUAS | Ensino médio | 2023 |
| ESCOLA PARTICULAR PRESIDENTE VARGAS LTDA | CENTRO | Ensino fundamental | 1995 |
| ESCOLA PARTICULAR VENCER FRUTAL LTDA | CENTRO | Ensino fundamental | 2018 |
| ESCRITORIO CONTABIL FRUTAL LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 1993 |
| ESCRITORIO CONTABIL TRIANGULO DE FRUTAL LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2024 |
| ESCRITORIO CONTABIL UNIAO LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 1974 |
| ESCRITORIO GERACAO CONTABIL LTDA | XV DE NOVEMBRO | Atividades de contabilidade | 2018 |
| ESCRITORIO HAWAII LTDA | CENTRO | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 1979 |
| ESKALADA HOLDING E PARTICIPACOES LTDA | ALTO BOA VISTA | Holdings de instituições não-financeiras | 2018 |
| ESM PRESTACAO DE SERVICOS ADMINISTRATIVOS E LOGISTICOS LTDA | ZONA RURAL | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2022 |
| ESPACO AGRICOLA COMERCIO E REPRESENTACAO LTDA | NOSSA SENHORA APARECIDA | Comércio atacadista de defensivos agrícolas, adubos, fertilizantes e corretivos do solo | 2005 |
| ESPACO AQUATICO SPLASH LIFE LTDA | JARDIM DAS LARANJEIRAS | Outras atividades de ensino não especificadas anteriormente | 2023 |
| ESPACO ARCO IRIS SAUDE INFANTIL LTDA | CENTRO | Atividade odontológica | 2025 |
| ESPACO BELLA BELEZA E ESTETICA LTDA | SANTOS DUMONT | Atividades de estética e outros serviços de cuidados com a beleza | 2024 |
| ESPACO TRIADE LTDA | NOSSA SENHORA APARECIDA | Casas de festas e eventos | 2014 |
| ESPETARIA E ASSADOS DO FABINHO LTDA | NOSSA SENHORA APARECIDA | Restaurantes e similares | 2024 |
| ESPETARIA FERREIRA SILVA LTDA | NOSSA SENHORA DO CARMO | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 2025 |
| ESPETERIA POP II LTDA | NOSSA SENHORA APARECIDA | Restaurantes e similares | 2024 |
| ESPETERIA POP LTDA | NOSSA SENHORA APARECIDA | Restaurantes e similares | 2018 |
| ESPETINHO DO MATHEUS FRUTAL LTDA | MORADA DOS IPES | Bares e outros estabelecimentos especializados em servir bebidas, sem entretenimento | 2023 |
| ESPETO NA PRACA DE FRUTAL LTDA | CENTRO | Restaurantes e similares | 2025 |
| ESPORTES E CALCADOS FRUTALENSE LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 1998 |
| ESQUINA 03 BAR E MERCEARIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2025 |
| ESQUINA DO PAO DE FRUTAL LTDA | NOSSA SENHORA APARECIDA | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 1998 |
| ESSENCIAL SERVICOS CONTABEIS LTDA | XV DE NOVEMBRO | Atividades de contabilidade | 2014 |
| ESTACIONAMENTO 3M LTDA | CENTRO | Estacionamento de veículos | 2004 |
| ESTAMPADORA DE PLACAS FRUTAL LTDA | CENTRO | Fabricação de letras, letreiros e placas de qualquer material, exceto luminosos | 2022 |
| ESTELA CONFECCOES LTDA | APARECIDA DE MINAS | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 1987 |