| SDNET INTERNET TELECOM LTDA | JARDIM SAO CRISTOVAO II | Comércio varejista especializado de equipamentos e suprimentos de informática | 2020 |
| SDO SERVICOS DE DIAGNOSTICOS MEDICOS LTDA | SAO FRANCISCO | Outras atividades de atenção à saúde humana não especificadas anteriormente | 1994 |
| SDOURADO EMPREENDIMENTOS LTDA | CALHAU | Horticultura, exceto morango | 2025 |
| SDR HOLDING COMPANY LTDA | RENASCENÇA | Holdings de instituições não-financeiras | 2025 |
| SDTECNHOS LTDA | RECANTO DOS VINHAIS | Desenvolvimento de programas de computador sob encomenda | 2022 |
| SE COSMETICOS LTDA | JARDIM ELDORADO | Comércio varejista de cosméticos, produtos de perfumaria e de higiene pessoal | 2020 |
| SE SERVICOS COMERCIO E INDUSTRIA LTDA | BEQUIMAO | Serviços de pré-impressão | 1995 |
| SE SERVICOS HOSPITALARES LTDA | AREINHA | Comércio atacadista de instrumentos e materiais para uso médico, cirúrgico, hospitalar e de laboratórios | 2013 |
| SEA AND AIR TRANSPORTES E TURISMO LTDA | SAO FRANCISCO | Agências de viagens | 2007 |
| SEA-DOG GERENCIAMENTOS E SERVICOS LTDA | RENASCENÇA | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2026 |
| SEA-PILOTS LTDA | PONTA D AREIA | Serviços de praticagem | 2026 |
| SEA RUNNER EMPREENDIMENTOS E PARTICIPACOES LTDA | DISTRITO INDUSTRIAL | Holdings de instituições não-financeiras | 2024 |
| SEABRA AUTOMACAO E SOLUCOES INDUSTRIAIS LTDA | PONTA D AREIA | Desenvolvimento de programas de computador sob encomenda | 2025 |
| SEABRA E DANTAS LTDA | COHAJAP | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2019 |
| SEABRA FORCA CLINICA APLICADA LTDA | PONTA DO FAROL | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 2023 |
| SEACHIOS CRANE NAVAL E SERVICOS MARITIMOS LTDA | PARQUE SHALON | Atividades de agenciamento marítimo | 2025 |
| SEALG-SERVICOS DE ALIMENTOS EM GERAL LIMITADA | PEDRINHAS | Restaurantes e similares | 1983 |
| SEALINE STUDIO LTDA | COHAB ANIL IV | Serviços de acabamentos gráficos, exceto encadernação e plastificação | 2024 |
| SEAME - SERVICO DE ARRITIMIA, MARCAPASSO E ELETROFISIOLOGIA LTDA | RENASCENCA | Atividade médica ambulatorial com recursos para realização de exames complementares | 2009 |
| SEARA ESPIRITA DEUS CRISTO E CARIDADE | CENTRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1972 |
| SEATTLE TECNOLOGIA LTDA | PONTA D'AREIA | Suporte técnico, manutenção e outros serviços em tecnologia da informação | 2020 |
| SEAWISE CREW SERVICES LTDA | RENASCENCA | Atividades de agenciamento marítimo | 2022 |
| SEBA BARROSO LTDA | CONJUNTO HABITACIONAL VINHAIS | Restaurantes e similares | 2024 |
| SEBASTIAO CARVALHO RIBEIRO E CIA LTDA | CONJUNTO HABITACIONAL TURU | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 2014 |
| SEBASTIAO CASTELO BRANCO LIMA JUNIOR LTDA | VINHAIS | Portais, provedores de conteúdo e outros serviços de informação na internet | 2016 |
| SEBASTIAO FIGUEIREDO MENDES JUNIOR SOCIEDADE INDIVIDUAL DE ADVOCACIA | COHAMA | Serviços advocatícios | 2025 |
| SEBASTIAO IMOVEIS LTDA | ANIL | Gestão e administração da propriedade imobiliária | 2008 |
| SEBRAE-MA SERV. DE APOIO AS MICRO E PEQUENAS EMP DO MA | JARACATY | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 1973 |
| SEBRAE-MA SERV. DE APOIO AS MICRO E PEQUENAS EMP DO MA | CALHAU | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 1999 |
| SEBRAE-MA SERV. DE APOIO AS MICRO E PEQUENAS EMP DO MA | CALHAU | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 2005 |
| SEBRAE-MA SERV. DE APOIO AS MICRO E PEQUENAS EMP DO MA | CALHAU | Ensino médio | 2013 |
| SEBRAE-MA SERV. DE APOIO AS MICRO E PEQUENAS EMP DO MA | COHAB ANIL IV | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 2014 |
| SEC PARTICIPACOES LTDA | RENASCENÇA | Holdings de instituições não-financeiras | 2026 |
| SEC-SERVICO DE EDUCACAO CONTINUADA LTDA | CALHAU | Educação superior - pós-graduação e extensão | 2017 |
| SECIMA-SERVICO DE CIRURGIA DO MARANHAO LTDA | JARDIM RENASCENCA | Atividades de atendimento em pronto-socorro e unidades hospitalares para atendimento a urgências | 1990 |
| SECOP SERVICOS ESPECIALIZADOS DE CONSERVACAO PREDIAL LTDA | CIDADE OPERARIA | Limpeza em prédios e em domicílios | 2016 |
| SECOUR CONSULTORIA EM MEIO AMBIENTE, SEGURANCA E SAUDE OCUPACIONAL LTDA | TURU | Serviços de engenharia | 2025 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA ADMINISTRACAO | CALHAU | Administração pública em geral | 2012 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA AGRICULTURA E PECUARIA - SAGRIMA | RENASCENCA | Atividades de apoio à pecuária não especificadas anteriormente | 2002 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA AGRICULTURA FAMILIAR - SAF | CALHAU | Administração pública em geral | 2015 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA CIENCIA, TECNOLOGIA E INOVACAO - SECTI | CALHAU | Administração pública em geral | 2003 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA COMUNICACAO SOCIAL - SECOM | CENTRO | Administração pública em geral | 1979 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA CULTURA - SECMA | PRAIA GRANDE | Administração pública em geral | 2003 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA PESCA E AQUICULTURA - SEPA | CALHAU | Atividades de apoio à pesca em água doce | 2022 |
| SECRETARIA DE ESTADO DE ADMINISTRACAO PENITENCIARIA - SEAP | VILA PALMEIRA | Administração pública em geral | 2010 |
| SECRETARIA DE ESTADO DE ARTICULACAO POLITICA - SECAP | CENTRO | Administração pública em geral | 2003 |
| SECRETARIA DE ESTADO DE DESENVOLVIMENTO ECONOMICO E PROGRAMAS ESTRATEGICOS - SEDEPE | CALHAU | Administração pública em geral | 2019 |
| SECRETARIA DE ESTADO DE DIREITOS HUMANOS E PARTICIPACAO POPULAR-SEDIHPOP | CALHAU | Administração pública em geral | 2008 |
| SECRETARIA DE ESTADO DE IGUALDADE RACIAL SEIR | CALHAU | Administração pública em geral | 2026 |
| SECRETARIA DE ESTADO DE INDUSTRIA E COMERCIO | CALHAU | Administração pública em geral | 2002 |