| FREITAS EMPREENDIMENTOS LTDA | CENTRO | Aluguel de imóveis próprios | 2014 |
| FREITAS INALDO ASSISTENCIA TECNICA LTDA | CENTRO | Serviços de agronomia e de consultoria às atividades agrícolas e pecuárias | 2017 |
| FRJ COMERCIO VEREJISTA LTDA | CENTRO | Comércio varejista especializado de eletrodomésticos e equipamentos de áudio e vídeo | 2018 |
| FRUTOS DE GOIAS SAO JOAO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2016 |
| FUNDEB - FUNDO DE MANUTENCAO E DESENVOLVIMENTO DA EDUCACAO BASICA E DE VALORIZACAO DOS PROFISSIONAIS DA EDUCACAO | CENTRO | Administração pública em geral | 2000 |
| FUNDO MUNICIPAL DAS POLITICAS DE PROMOCAO DA IGUALDADE RACIAL | CENTRO | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 2020 |
| FUNDO MUNICIPAL DE ASSISTENCIA SOCIAL DE SAO JOAO DA ALIANCA | CENTRO | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 1996 |
| FUNDO MUNICIPAL DE CULTURA - FMC | CENTRO | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 2023 |
| FUNDO MUNICIPAL DE EDUCACAO - FME | CENTRO | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 2021 |
| FUNDO MUNICIPAL DE SAUDE | CENTRO | Administração pública em geral | 1993 |
| FUNDO MUNICIPAL DO IDOSO - SAO JOAO D'ALIANCA | CENTRO | Atividades de assistência social prestadas em residências coletivas e particulares não especificadas anteriormente | 2019 |
| FUNDO MUNICIPAL DO MEIO AMBIENTE | CENTRO | Administração pública em geral | 2005 |
| FUNDO MUNICIPAL DOS DIREITOS DA CRIANCA E DO ADOLESCENTE | SETOR CENTRAL | Administração pública em geral | 2005 |
| G & J EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS SPE LTDA | SETOR LABEL | Loteamento de imóveis próprios | 2024 |
| GALICIA COMERCIO DE DERIVADOS DE PETROLEO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de combustíveis para veículos automotores | 1987 |
| GALICIA RESTAURANTE E CONVENIENCIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em lojas de conveniência | 2024 |
| GARCEZ DESENVOLVIMENTO GERENCIAL LTDA | JARDIM NOVA ALIANCA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2020 |
| GARCIA GONCALVES PARTICIPACOES LTDA | ZONA RURAL | Criação de bovinos para corte | 2025 |
| GC COMBUSTIVEIS SAO JOAO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de combustíveis para veículos automotores | 2022 |
| GEOPLAN BRASIL LTDA | SETOR CENTRAL | Serviços de agronomia e de consultoria às atividades agrícolas e pecuárias | 2021 |
| GIRO ECOTURISMO S/C LTDA | PRACA DA MATRIZ | Agências de viagens | 2003 |
| GIRO ROLAMENTOS LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2020 |
| GL TURISMO E TRANSPORTES LTDA | CENTRO | Transporte escolar | 2021 |
| GLOBAL HATCH AVICULTURA LTDA | ZONA RURAL | Produção de ovos | 2025 |
| GLOBAL SERVICOS POSTUMOS LTDA | CENTRO | Serviços de funerárias | 2018 |
| GR AGRICOLA LTDA | CENTRO | Comércio atacadista de alimentos para animais | 2025 |
| GRANJA & CONSTRUTORA GOMES LTDA | ZONA RURAL | Criação de suínos | 2001 |
| GRANJA FARIA S.A | ZONA RURAL | Produção de pintos de um dia | 2022 |
| GRANZOTTO MATERIAIS DE CONSTRUCAO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2017 |
| GRUPO DE PRODUTORES RURAL DO ASSENTAMENTO PALMITAL DE SAO JOAO DA ALIANCA-GO | ZONA RURAL | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1999 |
| GS TRANSPORTES RODOVIARIOS LTDA | CENTRO | Serviço de preparação de terreno, cultivo e colheita | 2013 |
| GSA CONSULTORIA E ASSESSORIA AGROPECUARIA LTDA | MONTE DAS OLIVEIRA | Serviços de agronomia e de consultoria às atividades agrícolas e pecuárias | 2025 |
| GUARDIOES DA CHAPADA MOTOCLUBE | LABEL | Atividades de organizações associativas ligadas à cultura e à arte | 2026 |
| GUEDES AUDITORIA E CONSULTORIA TRIBUTARIA LTDA | CENTRO | Atividades de consultoria e auditoria contábil e tributária | 2026 |
| HB COMERCIAL DE ALIMENTOS LTDA | SETOR CENTRAL | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 2012 |
| HL PARTICIPACAO LTDA | ZONA RURAL | Holdings de instituições não-financeiras | 2024 |
| HOLDING DH LTDA | ZONA RURAL | Holdings de instituições não-financeiras | 2021 |
| HORTIBRAZ COMERCIO E TECNOLOGIA LTDA | BOSQUE | Comércio atacadista de sementes, flores, plantas e gramas | 2023 |
| HOSPITAL MUNICIPAL DE SAO JOAO D'ALIANCA | CENTRO | Administração pública em geral | 1994 |
| HOTEL MIGUELINA GONCALVES DOS SANTOS LTDA | SETOR CENTRAL | Hotéis | 2007 |
| IGREJA BATISTA BETEL DE FORMOSA | SETOR LABEL | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2017 |
| IGREJA BATISTA NACIONAL BETEL EM SAO JOAO DA ALIANCA | CENTRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2026 |
| IGREJA EVANGELICA ASSEMBLEIA DE DEUS MINISTERIO VIDEIRA - ADVIDEIRA | VILA BOA ESPERANCA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2026 |
| IGREJA FONTE DE VIDA | SETOR CENTRAL | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2007 |
| IGREJA UNIVERSAL DO REINO DE DEUS | PLANALTINA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1993 |
| IGREJA UNIVERSAL DO REINO DE DEUS | CENTRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2010 |
| IMPERIO CAR PARABRISAS LTDA | SETOR CENTRAL | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2026 |
| INFOCO LTDA | LABEL | Atividades de produção de fotografias, exceto aérea e submarina | 2022 |
| INOVA SAUDE SEGURANCA E HIGIENE NO TRABALHO LTDA | CENTRO | Outras atividades profissionais, científicas e técnicas não especificadas anteriormente | 2024 |
| INSTITUTO ZAP DIAS | LABEL | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2021 |
Malha municipal: IBGE