| SEBASTIAO MARCIANO SILVA E OUTRO | MONTALVAO | Horticultura, exceto morango | 2013 |
| SEBASTIAO MOREIRA PERES VARGAS E OUTRO | MONTALVAO | Horticultura, exceto morango | 2017 |
| SEBASTIAO ORBOLATO GONCALVES | METOLANDIA | Criação de bovinos para corte | 2006 |
| SEBASTIAO PEREIRA DUTRA | MONTALVAO | Criação de bovinos para corte | 2006 |
| SEBASTIAO ROBERTO DE ANDRADE | AMELIOPOLIS | Criação de bovinos para corte | 2012 |
| SEBASTIAO VIRGOLINO E OUTROS | DO PONTILHAO | Cultivo de manga | 2006 |
| SEBO ESTACAO CULTURAL PRUDENTE COMERCIO DE LIVROS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros artigos usados | 2002 |
| SECOND M S PRIME COMERCIO DE CALCADOS LTDA | JARDIM DAS ROSAS | Comércio varejista de calçados | 2013 |
| SECRETARIA DA FAZENDA E PLANEJAMENTO | CENTRO | Administração pública em geral | 1986 |
| SECRETARIA DA FAZENDA E PLANEJAMENTO | BOSQUE | Administração pública em geral | 1998 |
| SECRETARIA DE AGRICULTURA E ABASTECIMENTO | A | Administração pública em geral | 1980 |
| SECRETARIA DE AGRICULTURA E ABASTECIMENTO | VILA SAO JORGE | Administração pública em geral | 2005 |
| SECRETARIA DE AGRICULTURA E ABASTECIMENTO | CENTRO | Administração pública em geral | 1998 |
| SECRETARIA DE AGRICULTURA E ABASTECIMENTO | ZONA RURAL | Administração pública em geral | 2002 |
| SECRETARIA DE DESENVOLVIMENTO SOCIAL | BOSQUE | Administração pública em geral | 2005 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA SAUDE | CENTRO | Administração pública em geral | 1982 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA SAUDE | JARDIM BONGIOVANI | Atividades de práticas integrativas e complementares em saúde humana | 1992 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA SAUDE | CIDADE UNIVERSITARIA | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 2009 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA SAUDE | CIDADE UNIVERSITARIA | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 2009 |
| SECRETARIA DE ESTADO DA SAUDE | PARQUE RESIDENCIAL SERVANTES II | Atividades de fisioterapia | 2025 |
| SECRETARIA MUNICIPAL DA EDUCACAO DE PRESIDENTE PRUDENTE-SP | CENTRO | Regulação das atividades de saúde, educação, serviços culturais e outros serviços sociais | 2018 |
| SECURITY COMERCIO E LOCACAO DE EQUIPAMENTOS ELETRONICOS LTDA | BOSQUE | Comércio varejista especializado de eletrodomésticos e equipamentos de áudio e vídeo | 2016 |
| SECURITY SEGURANCA LTDA | DO BOSQUE | Atividades de vigilância e segurança privada | 2008 |
| SECURITY SEGURANCA LTDA | VILA MARISTELA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2014 |
| SECURITY SERVICOS DE MONITORAMENTO ELETRONICO LTDA | BOSQUE | Atividades de monitoramento de sistemas de segurança eletrônico | 2001 |
| SEDEX DO MORANGO LTDA | JARDIM JEQUITIBA | Comércio varejista de hortifrutigranjeiros | 2022 |
| SEEDS CLINICA MEDICA LTDA | JARDIM PAULISTANO | Atividade médica ambulatorial com recursos para realização de procedimentos cirúrgicos | 2010 |
| SEEDS SAUDE ESTETICA LTDA | JARDIM PAULISTANO | Atividades de estética e outros serviços de cuidados com a beleza | 2020 |
| SEG MED SEGURANCA E MEDICINA DO TRABALHO LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2015 |
| SEGATE GAS E AGUA LTDA | RESIDENCIAL PARQUE DOS BURITIS | Comércio varejista de gás liqüefeito de petróleo (GLP) | 2026 |
| SEGATI REPRESENTACAO COMERCIAL LTDA | PARQUE CASTELO BRANCO | Representantes comerciais e agentes do comércio de madeira, material de construção e ferragens | 2024 |
| SEGBLASI CORRETORA DE SEGUROS E CONSULTORIA LTDA | JARDIM PAULISTANO | Corretores e agentes de seguros, de planos de previdência complementar e de saúde | 2018 |
| SEGUNDA IGREJA AMOR E CUIDADO DE ARACATUBA | VILA JESUS | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2019 |
| SEGUNDA IGREJA BATISTA INDEPENDENTE DE PRESIDENTE PRUDENTE-SP - MINISTERIO JARDIM ITAPURA | JARDIM ITAPURA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2010 |
| SEGUNDA IGREJA NOVA JERUSALEM | JARDIM PAULISTA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2007 |
| SEGUNDA IGREJA PRESBITERIANA INDEPENDENTE DE PRES PRUDENTE | JD SAO GABRIEL | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1997 |
| SEGUROESTOU CORRETORA DE SEGUROS LTDA | VILA NOVA | Corretores e agentes de seguros, de planos de previdência complementar e de saúde | 2025 |
| SEGUROS &CO CORRETORA LTDA | JARDIM BONGIOVANI | Corretores e agentes de seguros, de planos de previdência complementar e de saúde | 2022 |
| SEGUROTOTAL CORRETORA E SERVICOS E TECNOLOGIA LTDA | PARQUE ALVORADA | Corretores e agentes de seguros, de planos de previdência complementar e de saúde | 2023 |
| SEICHO-NO-IE DO BRASIL | VILA TABAJARA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1972 |
| SEIGO INFORMATICA LTDA | VILA SANTA HELENA | Comércio varejista especializado de equipamentos e suprimentos de informática | 1996 |
| SEIKITI KOMESSO | ZONA RURAL | Criação de bovinos para leite | 2018 |
| SEISHIN ADMINISTRADORA DE BENS LTDA | RESIDENCIAL PORTINARI | Aluguel de imóveis próprios | 2026 |
| SEISSO TAKUSHI E OUTRO | CHACARA TAKUSHI | Criação de bovinos para corte | 2006 |
| SEL CLEANER LTDA | NUCLEO BARTHOLOMEU BUENO DE MIRANDA | Comércio varejista de produtos saneantes domissanitários | 2010 |
| SELARIA DIAMANTE LTDA | CIDADE JARDIM | Fabricação de artefatos de couro não especificados anteriormente | 2025 |
| SELARIA REGINA LTDA | VILA SAO JORGE | Fabricação de artefatos de couro não especificados anteriormente | 1989 |
| SELFE INTERMEDIACOES FINANCEIRAS E CADASTRAIS LTDA | JARDIM BONGIOVANI | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 2023 |
| SELL CENTER VEICULOS LTDA | VILA NOVA | Comércio a varejo de automóveis, camionetas e utilitários usados | 1992 |
| SELMA APARECIDA ACUIO PASTORE E OUTROS | ZONA RURAL | Criação de bovinos para corte | 2011 |
Malha municipal: IBGE