| SANTOS CAFFE TORREFACAO E COMERCIO DE CAFE LTDA | BEMPOSTA | Torrefação e moagem de café | 2020 |
| SANTOS CARVALHO TRANSPORTADORA LTDA | MOURA BRASIL | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2020 |
| SANTOS CONSTRUIR LTDA | HABITAT | Obras de alvenaria | 2022 |
| SANTUARIO NACIONAL DO BOM JESUS | CENTRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2019 |
| SAO BENTO PATRIMONIAL LTDA | CENTRO | Atividades de administração de fundos por contrato ou comissão | 2022 |
| SAO PATRICIO ASSESSORIA ADMINISTRACAO E PART LTDA | CENTRO | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 1982 |
| SAPATARIA DA AUTONOMIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2007 |
| SAPATARIA TRES RIOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de calçados | 1996 |
| SARA COMESTICOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de cosméticos, produtos de perfumaria e de higiene pessoal | 2023 |
| SARAH BABY & KIDS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2019 |
| SATH ADMINISTRACAO DE BENS E NEGOCIOS LTDA | CENTRO | Gestão e administração da propriedade imobiliária | 2009 |
| SATH SERVICOS CONTABEIS LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2006 |
| SATIRO E MATTOS SERVICOS FINANCEIROS LTDA | CENTRO | Correspondentes de instituições financeiras | 2010 |
| SATURNO SERVICOS DE COBRANCA LTDA | CENTRO | Atividades de cobranças e informações cadastrais | 2023 |
| SAUDAVEL AMBIENTE SERVICOS LTDA | CENTRO | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 2005 |
| SAUDE BEM ESTAR ATENDIMENTO MEDICO LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2025 |
| SAUDE.COM SERVICO DE ATENDIMENTO MEDICO LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2016 |
| SAUDE & EQUILIBRIO CENTRO DE FISIOTERAPIA LTDA | CENTRO | Atividades de fisioterapia | 2024 |
| SAUDE F5 MEDICINA ESPECIALIZADA LTDA | CENTRO | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 2026 |
| SCAN DIAGNOSTICO POR IMAGEM LTDA | CENTRO | Serviços de diagnóstico por imagem com uso de radiação ionizante, exceto tomografia | 1994 |
| SCANDALLO CONFECCOES LTDA | VILA ISABEL | Confecção de roupas íntimas | 2020 |
| SCARP TRANSPORTES LTDA | TRIANGULO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 1989 |
| SCHMITZ CIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 1966 |
| SCHNEIDER REPRESENTACOES COMERCIAIS LTDA | CENTRO | Representantes comerciais e agentes do comércio de madeira, material de construção e ferragens | 2021 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | CENTRO | Construção de edifícios | 1999 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | VILA ISABEL | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2010 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | TRIANGULO | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2010 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | TRIANGULO | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2011 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | VILA ISABEL | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2012 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | VILA ISABEL | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2012 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | CENTRO | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2013 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | VILA IZABEL | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2013 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | VILA ISABEL | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2013 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | VILA ISABEL | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2013 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | VILA ISABEL | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2020 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | VILA ISABEL | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2020 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | VILA ISABEL | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2021 |
| SCOPO EMPREENDIMENTOS LTDA | VILA ISABEL | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2022 |
| SCREEN SERVICOS DE INTERMEDIACAO FINANCEIRA LTDA | CENTRO | Outras atividades auxiliares dos serviços financeiros não especificadas anteriormente | 2024 |
| SCX GESTORA DE BENS E NEGOCIOS LTDA | CANTAGALO | Fabricação de outros produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2012 |
| SDJ TRES RIOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de calçados | 2022 |
| SECISA SOUTO ENGENHARIA COMERCIO E INDUSTRIA LTDA | TURF CLUB | Construção de edifícios | 1972 |
| SECRETARIA MUNICIPAL DE EDUCACAO, CIENCIA E TECNOLOGIA | CENTRO | Administração pública em geral | 2013 |
| SECULAR IMOBILIARIA, ADMINISTRACAO CONDOMINAL E CORRETAGEM LTDA | CENTRO | Corretagem no aluguel de imóveis | 2000 |
| SECURITY LINE CONSULTORIA, SERVICOS E EQUIPAMENTOS LTDA | CENTRO | Administração de obras | 2024 |
| SEDEUG COMERCIO DE MATERIAIS DE INSTALACOES LTDA | CANTAGALO | Comércio varejista especializado de peças e acessórios para aparelhos eletroeletrônicos para uso doméstico, exceto informática e comunicação | 2002 |
| SEDNA CORRETORA DE SEGUROS LTDA | CENTRO | Corretores e agentes de seguros, de planos de previdência complementar e de saúde | 2006 |
| SEGUNDA IGREJA BATISTA DE TRES RIOS | CENTRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1974 |
| SEI LASER LATIN AMERICA INDUSTRIA E COMERCIO DE EQUIPAMENTOS LTDA | MOURA BRASIL | Fabricação de outras máquinas e equipamentos de uso geral não especificados anteriormente, peças e acessórios | 2020 |
| SEIXAS E ESCOBAR EVENTOS LTDA | CENTRO | Serviços de organização de feiras, congressos, exposições e festas | 2023 |