| 3J HORTIFRUTI LTDA | CONJUNTO HABITA SÃO TOMÉ | Comércio atacadista de frutas, verduras, raízes, tubérculos, hortaliças e legumes frescos | 2025 |
| A GASPAR SERVICOS AGRICOLAS LTDA | JARDIM SAO JOSE | Atividades de apoio à agricultura não especificadas anteriormente | 2018 |
| A.P.M.I - ASSOCIACAO DE PROTECAO A MATERNIDADE E INFANCIA DE SAO TOME | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1990 |
| AC PAVAN SERVICOS RADIOLOGICOS LTDA | JARDIM HABITA SÃO TOMÉ | Serviços de diagnóstico por imagem com uso de radiação ionizante, exceto tomografia | 2025 |
| ADP AGROPECUARIA LTDA | ZONA RURAL | Cultivo de soja | 2025 |
| AGENCIA DE NOTICIAS E JORNAL PARANA LTDA | CENTRO | Edição de jornais diários | 2021 |
| AGRICOLA S J LTDA | GLEBA DOS SUTIS | Cultivo de mandioca | 2006 |
| AGROPECUARIA 5M LTDA | GLEBA DOS SUTIS | Cultivo de cana-de-açúcar | 2023 |
| AGROPONCE LTDA | ZONA RUAL | Comércio varejista de produtos alimentícios em geral ou especializado em produtos alimentícios não especificados anteriormente | 2026 |
| AGROSOLUCOES CONSULTORIA E ASSESSORIA PARA O AGRONEGOCIO LTDA | JARDIM ALEXANDRE COLAUTO II | Serviços de agronomia e de consultoria às atividades agrícolas e pecuárias | 2026 |
| ALBINO ALIMENTOS LTDA | GLEBA DOS SUTIS | Fabricação de especiarias, molhos, temperos e condimentos | 2026 |
| ALICIAN ALIMENTOS LTDA | CENTRO | Fabricação de especiarias, molhos, temperos e condimentos | 2018 |
| ALIMENTICIOS POLPETA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - supermercados | 2008 |
| ALIMENTOS ALBINO LTDA | GLEBA SUTIS - ZONA RURAL | Fabricação de especiarias, molhos, temperos e condimentos | 2024 |
| ALIMENTOS N BONN LTDA | CENTRO | Fabricação de conservas de frutas | 1999 |
| ALIMENTOS SAO TOME LTDA | ZONA RURAL | Fabricação de conservas de legumes e outros vegetais, exceto palmito | 1996 |
| ALMEIDA & SILVA S/S LTDA | CENTRO | Atividades de profissionais da área de saúde não especificadas anteriormente | 2004 |
| ANA C. C. PALHANO VETERINARIA LTDA | CENTRO | Atividades veterinárias | 2026 |
| ANTONIO GASPAR TRANSPORTES LTDA | JARDIM SAO JOSE | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2009 |
| APMF - ASSOCIACAO DE PAIS, MESTRES E FUNCIONARIOS DO CENTRO MUNICIPAL DE EDUCACAO INFANTIL - CMEI CASA DE DAVI | CENTRO | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2009 |
| APMF - ASSOCIACAO DE PAIS, MESTRES E FUNCIONARIOS DO CENTRO MUNICIPAL DE EDUCACAO INFANTIL SONHO MAGICO | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2017 |
| APRORURAIS - ASSOCIACAO DOS PRODUTORES RURAIS DE SAO TOME | PARQUE INDUSTRIAL | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2009 |
| AREIA BERGAMO LTDA | ZONA RURAL | Extração de areia, cascalho ou pedregulho e beneficiamento associado | 2022 |
| ASSOCIACAO COMERCIAL, INDUSTRIAL E DE PRESTACAO DE SERVICOS DE SAO TOME - ACIST | CENTRO | Atividades de organizações associativas patronais e empresariais | 1998 |
| ASSOCIACAO COMUNITARIA DE COMUNICACAO E CULTURA DE SAO TOME | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2005 |
| ASSOCIACAO DE CATADORES DE RECICLAVEIS DE SAO TOME E REGIAO - ACREST | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2025 |
| ASSOCIACAO DE CONVIVENCIA DO IDOSO - HARMONIA | CONJUNTO SAO MARCOS | Serviços de assistência social sem alojamento | 2010 |
| ASSOCIACAO DE PAIS E AMIGOS DOS EXCEPCIONAIS DE SAO TOME | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1990 |
| ASSOCIACAO DE PAIS, MESTRES E FUNCIONARIOS DA ESCOLA MUNICIPAL 25 DE JULHO - EDUCACAO INFANTIL E ENSINO FUNDAMENTAL | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1997 |
| ASSOCIACAO DE PAIS, MESTRES E FUNCIONARIOS DO COLEGIO ESTADUAL PEDRO FECCHIO - ENSINO FUNDAMENTAL E MEDIO | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1988 |
| ASSOCIACAO DE PAIS, MESTRES E FUNCIONARIOS DO COLEGIO ESTADUAL SANTOS DUMONT - ENSINO MEDIO | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1980 |
| ASSOCIACAO DOS FUNCIONARIOS DA USINA DE ACUCAR SANTA TEREZINHA SAO TOME - AFUST | CENTRO | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2008 |
| ASSOCIACAO DOS FUNCIONARIOS USACUCAR MARINGA - AFUS | JARDIM POR DO SOL | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2014 |
| ASSOCIACAO MUNICIPAL DOS SERVIDORES PUBLICOS DO MUNICIPIO DE SAO TOME - AMUSEP | CENTRO | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2007 |
| AUTO POSTO DE SAO TOME LTDA | CENTRO | Comércio varejista de combustíveis para veículos automotores | 2001 |
| BAR DO BAIXINHO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de bebidas | 2001 |
| BARRA VELHA INDUSTRIAL LTDA | ZONA RURAL | Fabricação de farinha de mandioca e derivados | 2026 |
| BELLETTO ODONTOLOGIA E SAUDE LTDA | CENTRO | Atividade odontológica | 2026 |
| BIG PAO LTDA | CENTRO | Padaria e confeitaria com predominância de revenda | 2022 |
| BS CONSULTORIA DE COMUNICACAO LTDA | CENTRO | Consultoria em publicidade | 2019 |
| BUTALAS LANCHONETE E PIZZARIA LTDA | CENTRO | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 2022 |
| C CARBONI LTDA | PARQUE INDUSTRIAL - VIVEIRO | Preparação de documentos e serviços especializados de apoio administrativo não especificados anteriormente | 2022 |
| C H CARBONI LTDA | PARQUE INDUSTRIAL | Fabricação de massas alimentícias | 1996 |
| CANTARELI CAMPANERUTTE LTDA | RESIDENCIAL CINCO ESTRELAS | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2004 |
| CARBONI TRANSPORTES LTDA | PARQUE INDUSTRIAL - VIVEIRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2026 |
| CARLOS R. B. PIRES LTDA | CENTRO | Preparação de documentos e serviços especializados de apoio administrativo não especificados anteriormente | 2022 |
| CARVAO TIO JOAO LTDA | PARQUE INDUSTRIAL VIVEIRO | Comércio atacadista de combustíveis de origem vegetal, exceto álcool carburante | 2026 |
| CENTRO TERAPEUTICO MOREIRA LTDA | ZONA RURAL | Atividades de assistência psicossocial e à saúde a portadores de distúrbios psíquicos, deficiência mental e dependência química e grupos similares não | 2025 |
| CG SOLUCOES E LOCACOES LTDA | CENTRO | Aluguel de máquinas e equipamentos para construção sem operador, exceto andaimes | 2023 |
| CLEBER ANDREASSI MARMORARIA LTDA | CENTRO | Aparelhamento de placas e execução de trabalhos em mármore, granito, ardósia e outras pedras | 2018 |
Malha municipal: IBGE