| RENIER DESSIMONI FISIOTERAPIA E ASSOCIADOS LTDA | MARCIOLANDIA | Atividades de fisioterapia | 2021 |
| REPRESENTACOES SILVESTRINI LTDA | MARCIOLANDIA | Representantes comerciais e agentes do comércio de mercadorias em geral não especializado | 2004 |
| REPRESENTACOES THALES PIMENTA BICHACO LTDA | VILA RIO GRANDE | Representantes comerciais e agentes do comércio de mercadorias em geral não especializado | 2022 |
| RESTAURANTE & BAR DO DIDI LTDA | LAGOINHA | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 2024 |
| RESTAURANTE MENEZES E MASSON LTDA | CENTRO | Restaurantes e similares | 2011 |
| RESTRITO CONFECCOES LTDA | VILA LEOLITA | Comércio atacadista de artigos do vestuário e acessórios, exceto profissionais e de segurança | 2025 |
| RG CONTABILIDADE LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2010 |
| RG VIDROS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de vidros | 2020 |
| RIBEIRO AGRO CONSULTORIA LTDA | ENSEADA | Serviços de agronomia e de consultoria às atividades agrícolas e pecuárias | 2023 |
| ROBERTO BAR LTDA | VILA ESTER | Bares e outros estabelecimentos especializados em servir bebidas, com entretenimento | 2024 |
| RODO 100 TRANSPORTES LTDA | PROCON | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2024 |
| RODRIGO HOLDING DE PARTICIPACOES LTDA | VILA JAPONESA | Holdings de instituições não-financeiras | 2024 |
| RODRIGUES & CARVALHO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de produtos farmacêuticos, sem manipulação de fórmulas | 1999 |
| RODRIGUES LTDA | CENTRO | Promoção de vendas | 2025 |
| ROGERIO COELHO VIVAS ANDRADE & CIA LTDA | CENTRO | Laboratórios clínicos | 2002 |
| ROMA SERVICOS LTDA | CENTRO | Administração de obras | 2026 |
| RONALDO AGRONEGOCIOS LTDA | ENSEADA | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 2000 |
| RONALDO LUIZ LTDA | MARCIOLANDIA | Comercio varejista de artigos de cama, mesa e banho | 2008 |
| RS MATERIAIS DE CONSTRUCAO E PRODUTOS AGRICOLAS LTDA | MARCIOLANDIA | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 1984 |
| RUBI METAIS INDUSTRIA E COMERCIO LTDA | VILA LEOLITA | Fabricação de equipamentos hidráulicos e pneumáticos, peças e acessórios, exceto válvulas | 2021 |
| RVS AGRO PARTICIPACOES LTDA | VILA RITA | Outras sociedades de participação, exceto holdings | 2023 |
| RW E-COMMERCE LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2026 |
| RW PNEUS LTDA | CENTRO | Comércio por atacado de pneumáticos e câmaras-de-ar | 2019 |
| RWY CONFECCOES LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2013 |
| RWY CONFECCOES LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2017 |
| S A A E - SERVICO AUTONOMO DE AGUA E ESGOTO | CENTRO | Administração pública em geral | 1997 |
| SALES BARBOSA E CASTELARI SOCIEDADE DE ADVOGADOS | CENTRO | Serviços advocatícios | 2025 |
| SALESIO AUTOMECANICA LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2010 |
| SANEAR AMBIENTAL CONSULTORIAS LTDA | CENTRO | Serviços de engenharia | 2020 |
| SANTA CASA DE MISERICORDIA DE NEPOMUCENO | CENTRO | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 1968 |
| SANTA LIDIA ARMAZENS GERAIS LTDA | ZONA RURAL | Armazéns gerais - emissão de warrant | 2020 |
| SAO JOAO NEPOMUCENO INDUSTRIA COMERCIO E TRANSPORTE DE CEREAIS LTDA | MARCIOLANDIA | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2007 |
| SECRETARIA MUNICIPAL DE EDUCACAO | CENTRO | Administração pública em geral | 2009 |
| SEGLIMA SERVICOS LTDA | MARCIOLANDIA | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2025 |
| SELARIA RIBEIRO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2026 |
| SEMPRE TELECOMUNICACOES LTDA | CENTRO | Serviços de comunicação multimídia - SCM | 2022 |
| SENSUALY MODA INTIMA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 2023 |
| SENZZIO LTDA | CENTRO | Reparação e manutenção de computadores e de equipamentos periféricos | 2023 |
| SERGIO KEN VIANA KUBO LTDA | NOVA ESPERANCA | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2025 |
| SERQUIP - TRATAMENTO DE RESIDUOS MG LTDA | ZONA RURAL | Tratamento e disposição de resíduos perigosos | 2021 |
| SERRALHERIA FREI GALVAO & CASA DAS TELAS LTDA | SANTO ANTONIO | Fabricação de artigos de serralheria, exceto esquadrias | 2018 |
| SERRARIA SAO JOAO LTDA | SEDE | Fabricação de móveis com predominância de madeira | 1976 |
| SEVEN COSMETICOS NEPOMUCENO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de cosméticos, produtos de perfumaria e de higiene pessoal | 2026 |
| SILVA & SOMAGGIO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em lojas de conveniência | 2014 |
| SINDICATO DOS FUNCIONARIOS PUBLICOS MUNICIPAIS DE NEPOMUCENO | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 2007 |
| SINDICATO DOS PRODUTORES RURAIS DE NEPOMUCENO | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1971 |
| SINDICATO DOS TRABALHADORES RURAIS, ASSALARIADOS E AGRICULTORES FAMILIARES DO MUNICIPIO DE NEPOMUCENO-MG | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1992 |
| SIRIUS ENERGIA LTDA | SERRA NEGRA | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2022 |
| SITIO TEIXEIRA VILLELA LTDA | ZONA RURAL | Cultivo de café | 2026 |
| SMARTTEC LTDA | CENTRO | Comércio varejista especializado de equipamentos de telefonia e comunicação | 2023 |
Malha municipal: IBGE