| ESCOLA MUNICIPAL PLURI DOCENTE DE ENSINO FUNDAMENTAL BOM DESTINO | ZONA RURAL | Ensino fundamental | 2010 |
| EVEREX ENGENHARIA E CONSTRUCAO LTDA | BOA ESPERANÇA | Construção de edifícios | 2024 |
| EXPRESSA CONSTRUCOES LTDA | ENTRE MORROS | Obras de alvenaria | 2000 |
| F V TRANSPORTE LTDA | SAN DOMINGO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2016 |
| FARMACIA DO BATISTA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de produtos farmacêuticos, sem manipulação de fórmulas | 2016 |
| FARMACIA PRECO BAIXO DE MUQUI LTDA | CENTRO | Comércio varejista de produtos farmacêuticos, sem manipulação de fórmulas | 2008 |
| FERREIRA E FREITAS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2015 |
| FRAGA CERTISIGN LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2023 |
| FUNDO MUNICIPAL DE EDUCACAO INFANTIL E ENSINO FUNDAMENTAL - FMEIEF | CENTRO | Educação infantil - pré-escola | 2021 |
| FVC MUQUI COMERCIO DE MEDICAMENTOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de produtos farmacêuticos, sem manipulação de fórmulas | 2022 |
| GIESTAS ENGENHARIA LTDA | CENTRO | Serviços de engenharia | 2021 |
| GRUPO ESPIRITA DE MUQUI | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1968 |
| GRUPO ESPIRITA DE MUQUI | NÃO INFORMADO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1968 |
| H2N ABREU COMERCIO DE PRODUTOS AGRICOLAS LTDA | SAO FRANCISCO | Comércio atacadista de defensivos agrícolas, adubos, fertilizantes e corretivos do solo | 2021 |
| HELENO SALUCI BRAZIL SOCIEDADE INDIVIDUAL DE ADVOCACIA | CENTRO | Serviços advocatícios | 2006 |
| HOSPITAL APOSTOLO PEDRO | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2023 |
| IGREJA BATISTA DO CALVARIO EM MUQUI | SAO PEDRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2018 |
| IGREJA BATISTA EM MUQUI | BOA ESPERANCA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1978 |
| IGREJA EM MUQUI EM OBRA DE RESTAURACAO | ENTRE MORROS | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2025 |
| IGREJA EM VILA CATARINA | LOT. VILA CATARINA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2002 |
| IGREJA EVANGELICA ASSEMBLEIA DE DEUS | SEDE | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1993 |
| IGREJA EVANGELICA ASSEMBLEIA DE DEUS APOSTOLICA DE JESUS | SAO PEDRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2017 |
| IGREJA EVANGELICA ASSEMBLEIA DE DEUS DE MUQUI | BNH | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1989 |
| IGREJA EVANGELICA ASSEMBLEIA DE DEUS MINISTERIO TEMPLO KADOSH | BOA ESPERANCA | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2008 |
| IGREJA EVANGELICA ASSEMBLEIA DE DEUS MISSAO EVANGELIZAR | SEDE | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2007 |
| IGREJA EVANGELICA LEAO DE JUDA | SAO PEDRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2025 |
| IGREJA MISSIONARIA CRISTA | CENTRO | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 2004 |
| IGREJA PRESBITERIANA DE MUQUI | SEDE | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1991 |
| IGREJA UNIVERSAL DO REINO DE DEUS | ENTRE MORROS | Atividades de organizações religiosas ou filosóficas | 1992 |
| IN CORPORE ACESSORIOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 1992 |
| INOVECLINICA LTDA | CENTRO | Atividade odontológica | 2022 |
| INSTITUTO BELEZA POPULAR | CENTRO | Atividades de estética e outros serviços de cuidados com a beleza | 2022 |
| INSTITUTO NACIONAL DE GESTAO EM EDUCACAO E SAUDE - INGES | BOA ESPERANCA | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2021 |
| J VICTOR E DE SOUZA LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2016 |
| JOAO PETINI ESTETICA & MUNDO LASER LTDA | PALMEIRAS | Atividades de estética e outros serviços de cuidados com a beleza | 2019 |
| JP PERES LTDA | CENTRO | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2002 |
| LABORTEST LABORATORIO E TESTES CLINICOS LTDA | PRIMEIRO | Laboratórios clínicos | 1987 |
| LEAL BARBER SHOP LTDA | CENTRO | Cabeleireiros, manicure e pedicure | 2025 |
| LETICIA M PESSINI LTDA | SANTO AGOSTINHO | Atividade médica ambulatorial com recursos para realização de procedimentos cirúrgicos | 2020 |
| LF + ENGENHARIA LTDA | CENTRO | Serviços de engenharia | 2023 |
| LIGA DESPORTIVA MUQUIENSE (L.D.M) | SAO PEDRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2011 |
| LIMAS CONTABILIDADE & ASSESSORIA EMPRESARIAL LTDA | ENTRE MORROS | Atividades de contabilidade | 2021 |
| LOJA ELEGANCE LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2008 |
| LOJA MACONICA AVIDES FRAGA | SEDE | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1992 |
| LP LOUVEM SERVICOS MEDICOS LTDA | BOA ESPERANCA | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2023 |
| LR DRONES E PULVERIZACAO AGRICOLA LTDA | RODOVIA MUQUI X CACHOEIRO DE ITAPEMIRIM | Serviço de pulverização e controle de pragas agrícolas | 2026 |
| M A R SERVICOS CONTABEIS LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2020 |
| M E G SERVICOS MEDICOS LTDA | SAO PEDRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2019 |
| MAGALI MOTTA MENDONCA LTDA | ZONA RURAL | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2023 |
| MANAH PRODUTOS ARTESANIAS E CASEIROS LTDA | BOA ESPERANCA | Padaria e confeitaria com predominância de revenda | 2023 |