| ESCRITORIO CONTABIL GENESIS LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2013 |
| ESCRITORIO CONTABIL MERCURIO FERNANDOPOLIS LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 1971 |
| ESCRITORIO CRUZEIRO FERNANDOPOLIS S/S LTDA | CENTRO | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2016 |
| ESCRITORIO DE CONTABILIDADE DAS MICRO E PEQUENAS EMPRESAS S/S LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2011 |
| ESCRITORIO DELTA DE CONTABILIDADE LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 1988 |
| ESCRITORIO FENIX DE CONTABILIDADE LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 1999 |
| ESCRITORIO PRISMA CONTABIL - SOCIEDADE SIMPLES LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2009 |
| ESCRITORIO RIO'S CONTABIL FERNANDOPOLIS LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2011 |
| ESCRITORIO SAO PAULO S/S LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 1996 |
| ESDRAS FINANCE & ADMINISTRADORA LTDA | CENTRO | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2021 |
| ESGOTI & TOMAS LTDA | BRASILANDIA | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 1996 |
| ESLEI RODRIGO CASEMIRO CASALE E OUTROS | ZONA RURAL | Cultivo de banana | 2023 |
| ESMALTERIA LECH LECHA LTDA | CENTRO | Cabeleireiros, manicure e pedicure | 2022 |
| ESMERALDA BOER STORTI E OUTROS | COR DA LONTRA | Criação de bovinos para corte | 2006 |
| ESMERALDO DE JESUS SANTOS | CORREGO DAS PEDRAS | Cultivo de seringueira | 2026 |
| ESMEVA CONSTRUTORA LTDA | JARDIM IGUATEMY | Fabricação de estruturas metálicas | 2012 |
| ESPACO FERNANDOPOLENSE DE ESTUDOS PSICANALITICOS | COESTER | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2007 |
| ESPELHUZ-INDUSTRIA E COMERCIO DE ARTEF.ESPELHOS LTDA | MINI DISTRITO IND I | Fabricação de artigos de vidro | 1990 |
| ESPETARIA E LANCHONETE SKINAO DO ESPETO LTDA | JARDIM SANTA CATARINA | Restaurantes e similares | 2021 |
| ESPORTE CLUBE BANESPA DE FERNANDOPOLIS | TERRA DAS PAINEIRAS | Clubes sociais, esportivos e similares | 1974 |
| ESPUMACO COMERCIO DE ESPUMAS E PLASTICOS LTDA | COESTER | Lojas de variedades, exceto lojas de departamentos ou magazines | 1981 |
| ESQUADRIA DE ALUMINIO CRISTAIS LTDA | CORINTO | Comércio varejista de vidros | 2022 |
| ESQUADRIAS FERNANDOPOLIS LTDA | PARQUE UNIVERSITARIO | Fabricação de esquadrias de metal | 2025 |
| ESSENCIA MODA PLUS SIZE LTDA | PARQUE UNIVERSITARIO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2023 |
| ESSENZA COMERCIO E DISTRIBUICAO DE PERFUMES E COSMETICOS LTDA | JARDIM SANTA RITA | Comércio atacadista de cosméticos e produtos de perfumaria | 2024 |
| ESSENZA STUDIO DI BELLEZZA LTDA | JARDIM SANTA HELENA | Cabeleireiros, manicure e pedicure | 2025 |
| ESTACAO DO AR FERNANDOPOLIS LTDA | COESTER | Comércio varejista especializado de eletrodomésticos e equipamentos de áudio e vídeo | 2011 |
| ESTANCIA GRANDE LAGO EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS LTDA | CENTRO | Compra e venda de imóveis próprios | 2013 |
| ESTANCIA SANTA TEREZINHA | AREA RURAL DE FERNANDOPOLIS | Criação de bovinos para corte | 2019 |
| ESTETICA FABIANA CHIARELLI LTDA | JARDIM AMERICA | Atividades de estética e outros serviços de cuidados com a beleza | 2021 |
| ESTEVES CORRETORA DE SEGUROS LTDA | JARDIM AMERICA | Corretores e agentes de seguros, de planos de previdência complementar e de saúde | 2019 |
| ESTRADEIRO TRANSPORTES LTDA | RESIDENCIAL ANTONIA FRANCO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2025 |
| ESTRUTURAS PRE-MOLDADAS DE CONCRETO SGOTTI LTDA | JARDIM IGUATEMY | Fabricação de estruturas pré-moldadas de concreto armado, em série e sob encomenda | 2004 |
| ESTUDIO DE PILATES DAIANE ROCHA LTDA | JARDIM RIO GRANDE | Atividades de condicionamento físico | 2023 |
| ET PRODUCOES CRIATIVAS LTDA | COESTER | Produção teatral | 2025 |
| ETELVINO BELONI | COR. DO GATAO | Criação de bovinos para corte | 2008 |
| ETTO & AMARAL CURSOS PREPARATORIOS LTDA | CENTRO | Cursos preparatórios para concursos | 2013 |
| EU AMO OCULOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos de óptica | 2015 |
| EUCLEIA MARIA AROUCA POCO ROSA & CIA LTDA | JARDIM SANTA HELENA | Serviços de alimentação para eventos e recepções - bufê | 2009 |
| EUCLIDES ADAMI | CORREGO DAS PEDRAS | Cultivo de café | 2006 |
| EUCLIDES ADAMI | COR DA ALDEIA | Criação de bovinos para corte | 2009 |
| EUCLIDES LOURENCO | CORREGO DAS PEDRAS | Cultivo de seringueira | 2006 |
| EUCLIDES LOURENCO E OUTROS | CORREGO DAS PEDRAS | Coleta de látex em florestas nativas | 2007 |
| EUCLYDES FRANCO | CORREGO DA ALDEIA | Criação de bovinos para leite | 2006 |
| EUDITE LAZARA DE MELO CASTILHO | AREA RURAL DE FERNANDOPOLIS | Criação de bovinos para corte | 2020 |
| EUDITE LAZARA DE MELO CASTILHO E OUTRO | AREA RURAL DE FERNANDOPOLIS | Cultivo de cana-de-açúcar | 2021 |
| EUGENIO SANTO BELINI E OUTRA | CORREGO SAO PEDRO | Criação de bovinos para corte | 2006 |
| EURICO BRAGA | COR. DA PEDRA | Cultivo de café | 2006 |
| EURICO CAMARGO BARBOSA | CORREGO CAPIVARA | Criação de bovinos para corte | 2006 |
| EURICO CAMARGO BARBOSA | AGUA VERMELHA | Criação de bovinos para corte | 2006 |