| SANTA ANA COMERCIO DE ESQUADRIAS LTDA | CENTRO | Fabricação de móveis com predominância de madeira | 1990 |
| SANTA BRANCA LTDA | BOA VISTA | Fabricação de artefatos de tanoaria e de embalagens de madeira | 1991 |
| SANVIT - VITIVINICOLA SAO JOAQUIM LTDA | INTERIOR | Cultivo de uva | 2001 |
| SAO JOAQUIM CARTORIO DO REGISTRO CIVIL | CENTRO | Serviços advocatícios | 1978 |
| SAO JOAQUIM CARTORIO REGISTRO DE IMOVEIS | CENTRO | Administração pública em geral | 1978 |
| SAO JOAQUIM COMERCIO DE FRUTAS LTDA | AREA INDUSTRIAL | Cultivo de maçã | 2020 |
| SAO JOAQUIM COMERCIO DE PNEUS E LUBRIFICANTES LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de pneumáticos e câmaras-de-ar | 2022 |
| SAO JOAQUIM EDUCACIONAL LTDA | CENTRO | Educação superior - graduação e pós-graduação | 2026 |
| SAO JOAQUIM GERACAO DE ENERGIA LTDA | JARDIM MINUANO | Geração de energia elétrica | 2021 |
| SAO JOAQUIM MATERIAIS DE CONSTRUCAO LTDA | MINUANO | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2006 |
| SAO JOAQUIM PARK HOTEL LTDA | CENTRO | Hotéis | 1997 |
| SAO JOAQUIM TABELIONATO DE NOTAS E PROTESTOS EM GERAL | JARDIM MINUANO | Administração pública em geral | 1978 |
| SAO JOAQUIM VISTORIA LTDA | MARTORANO | Outras atividades de serviços prestados principalmente às empresas não especificadas anteriormente | 2015 |
| SAO JOSE DO ALECRIM ADMINISTRADORA DE BENS PROPRIOS LTDA | CENTRO | Aluguel de imóveis próprios | 2010 |
| SAO LUIS FRUTICULTURA LTDA | CENTRO | Loteamento de imóveis próprios | 1984 |
| SARAH COELHO ALMEIDA FISIOTERAPIA E ESTETICA LTDA | MARTORANO | Atividades de fisioterapia | 2026 |
| SASSO COMERCIO DE PECAS E SERVICOS PARA VEICULOS LTDA | MARTORANO | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2008 |
| SAUDE ANIMAL CLINICA VETERINARIA LTDA | CENTRO | Atividades veterinárias | 2018 |
| SC GESTAO LTDA | CENTRO | Serviços combinados de escritório e apoio administrativo | 2026 |
| SCHIO CEREAIS IMPORTACAO E EXPORTACAO LTDA | MORRO AGUDO | Comércio atacadista de cereais e leguminosas beneficiados | 2012 |
| SCHLEMPER COMERCIO MACAS LTDA | INTERIOR | Comércio atacadista de frutas, verduras, raízes, tubérculos, hortaliças e legumes frescos | 2020 |
| SCHNEIDER SERVICOS DE COMPRESSOR LTDA | JARDIM MINUANO | Perfurações e sondagens | 2006 |
| SCHWALB COMERCIO DE GAS E TRANSPORTADORA LTDA | LOTEAMENTO MARTORANO | Comércio varejista de gás liqüefeito de petróleo (GLP) | 2014 |
| SEITEC - SERVICOS DE COBERTURA DE POMAR LTDA | NOSSA SENHORA APARECIDA | Serviço de preparação de terreno, cultivo e colheita | 2006 |
| SENE CONTABILIDADE LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2024 |
| SERESOLVE AUTOPECAS LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2023 |
| SERRA E SUL ADM DE BENS PROPRIOS LTDA | INTERIOR | Loteamento de imóveis próprios | 2022 |
| SERRA FORTE SERVICOS DE ENGENHARIA E AGRONEGOCIO LTDA | CENTRO | Serviços de engenharia | 2026 |
| SERRA SORRIA ODONTOLOGIA ESPECIALIZADA LTDA | CENTRO | Atividade odontológica | 2026 |
| SERRA SUL ENGENHARIA E CONSTRUCOES LTDA | JARDIM BANDEIRA | Construção de edifícios | 2012 |
| SERRAFRUTAS COMERCIO E LOGISTICA LTDA | AREA INDUSTRIAL | Atividades de pós-colheita | 2010 |
| SERRALHERIA ARTISMO LTDA | JARDIM MINUANO | Fabricação de artigos de serralheria, exceto esquadrias | 2020 |
| SERRANA PAES E CIA LTDA | CENTRO | Padaria e confeitaria com predominância de revenda | 2024 |
| SERRINHA LOCACOES LTDA | ZONA RURAL | Aluguel de outras máquinas e equipamentos comerciais e industriais não especificados anteriormente, sem operador | 2024 |
| SERVICO SOCIAL DO COMERCIO - SESC AR/SC | CENTRO | Serviços de assistência social sem alojamento | 2016 |
| SERVICOS AGRO SILVA LTDA | CENTRO | Serviço de preparação de terreno, cultivo e colheita | 2025 |
| SERVICOS DE FUNILARIA E PINTURA DE VEICULOS B1 B2 LTDA | CENTRO | Serviços de lanternagem ou funilaria e pintura de veículos automotores | 2021 |
| SG INDUSTRIA E COMERCIO DE FRUTAS LTDA | FAZENDA MORRO AGUDO | Atividades de pós-colheita | 2022 |
| SHOICHI YURI & OUTROS | INTERIOR | Atividades de apoio à agricultura não especificadas anteriormente | 2014 |
| SHU OTANI E OUTRO | INTERIOR | Atividades de apoio à agricultura não especificadas anteriormente | 2005 |
| SIDE FRANCISCO KOERICH. LTDA | INTERIOR | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2025 |
| SILVA E SILVA COMERCIO E SERVICO LTDA | BELA VISTA | Comércio varejista de madeira e artefatos | 2023 |
| SILVA SOUZA CONSULTORIA LTDA | CENTRO | Atividades de consultoria em gestão empresarial, exceto consultoria técnica específica | 2022 |
| SIMON GALILEU RAMOS LTDA | CENTRO | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 2025 |
| SIND DOS SERVIDORES PUBLICOS MUNICIPAIS DE SAO JOAQUIM | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1992 |
| SINDICATO DOS TRABALHADORES NA AGRICULTURA FAMILIAR DE SAO JOAQUIM - SC E REGIAO | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1976 |
| SINDICATO MUNICIPAL DOS PROFIS. EM EDUC. DE S.J. - SIMPROESJ | JARDIM MINUANO | Atividades de organizações sindicais | 2001 |
| SINDICATO RURAL DE SAO JOAQUIM | CENTRO | Atividades de organizações sindicais | 1988 |
| SJ DISTRIBUIDORA DE PECAS E LUBRIFICANTES LTDA | LOTEAMENTO CHARQUEADA | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 1993 |
| SJ SERVICOS E PRODUTOS AGRICOLAS LTDA | CENTRO | Serviço de preparação de terreno, cultivo e colheita | 2024 |
Malha municipal: IBGE