| ADELAR ANTUNES DE ALMEIDA & CIA LTDA | CENTRO | Holdings de instituições não-financeiras | 2026 |
| ADILSON R. D. DE OLIVEIRA & ROBERTA D. DE OLIVEIRA LTDA | INTERIOR | Obras de terraplenagem | 2024 |
| AG TECH LTDA | JARDIM DAS AMERICAS | Suporte técnico, manutenção e outros serviços em tecnologia da informação | 2025 |
| AGENCIA DE VIAGENS E TURISMO SAO MIGUEL DAS MISSOES LTDA | CENTRO | Agências de viagens | 2000 |
| AGRICOLA ENTRE-RIOS LTDA | SEDE | Comércio varejista de artigos de óptica | 1986 |
| AGRICOLA SETE POVOS LTDA EM RECUPERACAO JUDICIAL | CENTRO | Comércio atacadista de cereais e leguminosas beneficiados | 2022 |
| AGRO PRODUTOS COMERCIO DE INSUMOS AGRICOLAS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 1989 |
| AGRO PRODUTOS COMERCIO DE INSUMOS AGRICOLAS LTDA | CENTRO | Comércio atacadista de alimentos para animais | 1992 |
| AGRO PRODUTOS COMERCIO DE INSUMOS AGRICOLAS LTDA | RESTINGA SECA | Comércio varejista de produtos farmacêuticos, sem manipulação de fórmulas | 1992 |
| AGROFEL AGRO COMERCIAL S.A | INTERIOR | Comércio atacadista de matérias-primas agrícolas não especificadas anteriormente | 2015 |
| AGROPECUARIA AMAURY & FILHOS LTDA | INTERIOR | Cultivo de soja | 2023 |
| AGROPECUARIA CATI LTDA | CENTRO | Comércio varejista de animais vivos e de artigos e alimentos para animais de estimação | 1993 |
| AGROPECUARIA CEHDROS LTDA | DISTRITO DE COIMBRA | Cultivo de soja | 2017 |
| AJ DAMIAO AGROPECUARIA LTDA | CENTRO | Cultivo de soja | 2025 |
| ALBIERO SERVICOS DE POCOS ARTESIANOS LTDA | CENTRO | Perfuração e construção de poços de água | 2001 |
| ALOIZIO PORTELA CAMERA & CIA LTDA | CENTRO | Aluguel de móveis, utensílios e aparelhos de uso doméstico e pessoal; instrumentos musicais | 2017 |
| ANA KAREN DA ROZA BRANCO & CIA LTDA | CENTRO | Restaurantes e similares | 2002 |
| ANA KAREN DA ROZA BRANCO & CIA LTDA | INTERIOR | Restaurantes e similares | 2015 |
| ANA LUCIA BUZANELO & CIA LTDA | CENTRO | Atividades de fisioterapia | 2006 |
| ANALIA ANA PAWLOWSKI HOSSA & CIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2004 |
| APAE ASSOCIACAO DE PAIS E AMIGOS DOS EXCEPCIONAIS | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1994 |
| AROMA DAS MISSOES IND. E COM. DE OLEOS ESSENCIAIS LTDA | INTERIOR | Fabricação de cosméticos, produtos de perfumaria e de higiene pessoal | 2025 |
| AS MARAGATAS PRODUCOES ARTISTICAS LTDA | INTERIOR | Produção musical | 2026 |
| AS PECAS E SERVICOS LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 1998 |
| ASSOCIACAO AMIGOS DAS MISSOES | CENTRO | Atividades de assistência social prestadas em residências coletivas e particulares não especificadas anteriormente | 1991 |
| ASSOCIACAO COMERCIAL, CULTURAL, INDUSTRIAL E DE EMPREENDEDORISMO DE SAO MIGUEL DAS MISSOES - ACI | CENTRO | Atividades de organizações associativas patronais e empresariais | 1991 |
| ASSOCIACAO CONSCIENCIA GUARANI | INTERIOR | Outras atividades de ensino não especificadas anteriormente | 2005 |
| ASSOCIACAO DA EXPOFEIRA DE SAO MIGUEL DAS MISSOES | CENTRO | Atividades de organizações associativas ligadas à cultura e à arte | 2010 |
| ASSOCIACAO DE 2 E 3 TERCEIRA IDADE JUVENTUDE ACUMULADA DE SAO MIGUEL DAS MISSOES/RS | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2004 |
| ASSOCIACAO DE AGRICULTORES GRITO DE SEPE | INTERIOR | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1989 |
| ASSOCIACAO DE APICULTORES PURO MEL | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1997 |
| ASSOCIACAO DE ARTESAOS TUPAMBA ' E DE SAO MIGUEL DAS MISSOES | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1998 |
| ASSOCIACAO DE PRODUTORES DE ALIMENTOS FAMILIAS DA TERRA | INTERIOR | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2015 |
| ASSOCIACAO DE RECICLADORES A ARTE DE RECICLAR | ALEGRIA | Coleta de resíduos não-perigosos | 2008 |
| ASSOCIACAO DE VEICULOS ANTIGOS AUTO CLUB SAO MIGUEL | CENTRO | Atividades de organizações associativas ligadas à cultura e à arte | 2024 |
| ASSOCIACAO DOS AGRICULTORES | INTERIOR | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1996 |
| ASSOCIACAO DOS AGRICULTORES FAMILIARES UNIAO PESSEGUEIRO | INTERIOR | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2014 |
| ASSOCIACAO DOS AGRICULTORES JUNTOS VENCEREMOS | DISTRITO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1995 |
| ASSOCIACAO DOS ESTUDANTES UNIVERSITARIOS DE SAO MIGUEL DAS MISSOES - AEUSMI | CENTRO | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2013 |
| ASSOCIACAO DOS MORADORES DO BAIRRO ALEGRIA | ALEGRIA | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2019 |
| ASSOCIACAO DOS PRODUTORES DE ALIMENTOS MUNDIAL DA ESQUINA SAO MIGUEL | INTERIOR | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2014 |
| ASSOCIACAO DOS PRODUTORES RURAIS DE SAO JOAO DAS MISSOES | INTERIOR | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2020 |
| ASSOCIACAO FESTNIAS SAO MIGUEL DAS MISSOES - ASSOFEST | CENTRO | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2025 |
| ASSOCIACAO FUNCIONARIOS PUBLICOS MUNICIPAIS SAO MIGUEL | CENTRO | Clubes sociais, esportivos e similares | 1990 |
| ASSOCIACAO HOSPITALAR DE CARIDADE BENEFICENTE SAO MIGUEL | CENTRO | Atividades de atendimento hospitalar, exceto pronto-socorro e unidades para atendimento a urgências | 1981 |
| ASSOCIACAO MIGUELINA DE PROTECAO AOS ANIMAIS AMIPA | INTERIOR | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2011 |
| ASSOCIACAO MIGUELINA DE RADIODIFUSAO COMUNITARIA | CENTRO | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2005 |
| ASSOCIACAO NOVA CONQUISTA | INTERIOR | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2019 |
| ASSOCIACAO PRESERVA INHACAPETUM - API | CENTRO | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2021 |
| ASSOCIACAO REGIONAL DE ARBITROS | CENTRO | Outras atividades esportivas não especificadas anteriormente | 2020 |