| ELISEU ROLDAO DA SILVA | ZONA RURAL | Criação de bovinos para corte | 2020 |
| ELITE INDUSTRIA E COMERCIO DE MOVEIS E DECORACOES LTDA | VILA SANTA ROSA | Fabricação de artefatos de material plástico para uso pessoal e doméstico | 2007 |
| ELIVELTON LISBOA SILVA | AREA RURAL DE FERNANDOPOLIS | Cultivo de seringueira | 2026 |
| ELIVELTON LUIZ BATISTA | BRASITANIA | Criação de bovinos para corte | 2014 |
| ELIZABETH FONTANA | CORREGO DAS PEDRAS | Criação de bovinos para leite | 2012 |
| ELIZABETH GUIMARAES ASSAD | NOZA RURAL | Criação de bovinos, exceto para corte e leite | 2013 |
| ELIZETE SANTOS DE JESUS | AREA RURAL DE FERNANDOPOLIS | Cultivo de seringueira | 2024 |
| ELIZEU CHAVES DA SILVA | AREA RURAL DE FERNANDOPOLIS | Cultivo de seringueira | 2024 |
| ELMARA DE CASSIA GONINI PACO LTDA | BOA VISTA | Serviços de perícia técnica relacionados à segurança do trabalho | 2026 |
| ELOY & MARCO REPRESENTACOES COMERCIAIS LTDA | JARDIM RIO GRANDE | Representantes comerciais e agentes do comércio de produtos alimentícios, bebidas e fumo | 2011 |
| ELSON DA SILVA | AREA RURAL DE FERNANDOPOLIS | Cultivo de seringueira | 2024 |
| ELSON FERNANDES DIAS E OUTRA | CORREGO DA CAPIVARA | Criação de bovinos para corte | 2006 |
| ELTON FERREIRA SOCIEDADE INDIVIDUAL DE ADVOCACIA | CENTRO | Serviços advocatícios | 2026 |
| ELVINO ZAURIZIO DOS SANTOS | AREA RURAL DE FERNANDOPOLIS | Criação de bovinos para corte | 2023 |
| ELVIS CHAVES SANTANA LTDA | PARQUE VILA NOVA | Comércio atacadista de soja | 2024 |
| ELVIS MANOEL SOARES FARINELI | BRASITANIA | Criação de bovinos para corte | 2021 |
| ELVIS RODRIGUES DOS REIS SOCIEDADE INDIVIDUAL DE ADVOCACIA | RESIDENCIAL PALMA MININEL | Serviços advocatícios | 2023 |
| ELYANE MACHADO MAURI | CORREGO SANTA RITA | Criação de bovinos para corte | 2006 |
| EMANA CURSOS, TREINAMENTOS E ASSESSORIA LTDA | CENTRO | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2008 |
| EMERSON CABRERA SERVICOS MEDICOS LTDA | PARQUE UNIVERSITARIO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2024 |
| EMERSON FERREIRA PRETEL | FAZENDA SANTA RITA | Criação de bovinos para corte | 2025 |
| EMERSON RODRIGUES BALIEIRO | JARDIM ARAGUAIA | Horticultura, exceto morango | 2011 |
| EMG PULVERIZACAO AGRICOLA LTDA | PARQUE UNIVERSITARIO | Serviço de pulverização e controle de pragas agrícolas | 2024 |
| EMIDIO PAULA ANTUNES & CIA LTDA | COESTER | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 1986 |
| EMILIA CAVASSANA DE OLIVEIRA | ZONA RURAL | Criação de bovinos para corte | 2006 |
| EMILIANA VIEIRA LIMA SANTANNA | CORREGO DO CAXI | Criação de bovinos para corte | 2012 |
| EMILLE KAROLINE DO CARMO SPERETTA LTDA | ZONA RURAL | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2025 |
| EMMANUEL FLORES DE ANDRADE | CORREGO STA RITA | Criação de bovinos para corte | 2020 |
| EMPORIO 272 LTDA | JARDIM IGUATEMY | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - supermercados | 2023 |
| EMPORIO BEER DE FERNANDOPOLIS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2010 |
| EMPORIO BRASITANIA LTDA | CENTRO (DISTRITO DE BRASITANIA) | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2015 |
| EMPORIO SANTA MARIA DE FERNANDOPOLIS LTDA | COESTER | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 1983 |
| EMPORIUM PRESENTES DE FERNANDOPOLIS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 1990 |
| EMPREEENDIMENTOS IMOBILIARIOS SOL NASCENTE FERNANDOPOLIS LTDA | JARDIM AMERICA | Compra e venda de imóveis próprios | 2009 |
| EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS BENEZ LTDA | CENTRO | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 1989 |
| EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS BIM DE FERNANDOPOLIS LTDA | BRASILANDIA | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2013 |
| EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS CARENO SOARES LTDA | RESIDENCIAL JARDIM BRASITALIA | Aluguel de imóveis próprios | 2018 |
| EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS MATHIAS E FILHOS LTDA | CENTRO | Incorporação de empreendimentos imobiliários | 2012 |
| EMPREENDIMENTOS IMOBILIARIOS SANTA FELICIDADE DE FERNANDOPOLIS LTDA | RESIDENCIAL JARDIM BRASITALIA | Loteamento de imóveis próprios | 2016 |
| EMPREENDIMENTOS MANGILI LTDA | LOTEAMENTO RESIDENCIAL MARIA NAZARET | Comércio varejista de móveis | 2021 |
| EMPRESA BRASILEIRA DE CORREIOS E TELEGRAFOS | CENTRO | Atividades do Correio Nacional | 1976 |
| EMPRESA BRASILEIRA DE CORREIOS E TELEGRAFOS | VILA SAO FERNANDO | Atividades do Correio Nacional | 1998 |
| EMPRESA CINEMATOGRAFICA BOMBOCINE LTDA | VILA SAO FERNANDO | Atividades de exibição cinematográfica | 2015 |
| EMPRESA CINEMATOGRAFICA ITAPETININGA LTDA | JARDIM SAO FERNANDO | Atividades de exibição cinematográfica | 2013 |
| EMPRESA DE AUTO ONIBUS SANTA RITA LTDA | JARDIM SANTA RITA | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, interestadual | 1966 |
| ENAYARA SIQUEIRA HASS | ZONA RURAL | Criação de bovinos para corte | 2020 |
| ENDOCARDIO RIO PRETO SERVICOS MEDICOS S/S | JARDIM SANTISTA | Atividade médica ambulatorial com recursos para realização de exames complementares | 2016 |
| ENDOLI CLINICA MEDICA S/S LTDA | JARDIM SAGLIONI | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2012 |
| ENDRICE ENGENHARIA E CONSTRUCOES LTDA | COESTER | Construção de edifícios | 2023 |
| ENEDINA DA SILVA | FAZ.MARINHEIRO | Criação de bovinos para leite | 2012 |