| R N S RIBEIRO LTDA | APARECIDA | Comércio atacadista de embalagens | 2013 |
| R O DA CUNHA MOURA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2023 |
| R. R. TOGA LTDA | BIRIBIRI | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2002 |
| R. S. B. INDUSTRIA E COMERCIO DE MOVEIS E ELETRODOMESTICOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de móveis | 2019 |
| R S COMERCIO ATACADISTA DE PESCADOS LTDA | AREA RURAL DE MANACAPURU | Comércio atacadista de pescados e frutos do mar | 2025 |
| R S DO NASCIMENTO LTDA | SAO JOSE | Construção de edifícios | 2026 |
| R. SILVA MARTINS LTDA | NOVO HORIZONTE | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2025 |
| R T BRITO EMPORIO DO BAIRRO LTDA | CORRENTEZA | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2025 |
| R T BRITO LANCHONETES E RESTAURANTES LTDA | CORRENTEZA | Lanchonetes, casas de chá, de sucos e similares | 2023 |
| R. T. COELHO LTDA | TERRA PRETA | Comércio varejista de produtos farmacêuticos, sem manipulação de fórmulas | 2012 |
| R T COMERCIO DE COMBUSTIVEIS LTDA | AREA RURAL DE MANACAPURU | Comércio varejista de combustíveis para veículos automotores | 2020 |
| R T DE ALMEIDA SOUZA LTDA | SAO JOSE | Depósitos de mercadorias para terceiros, exceto armazéns gerais e guarda-móveis | 2023 |
| R T FERREIRA COMERCIO DE FERRAGENS E FERRAMENTAS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de ferragens e ferramentas | 2017 |
| R2 CONSTRUTORA LTDA | CENTRO | Construção de edifícios | 2008 |
| RAAFA LTDA | MORADA DO SOL | Locação de automóveis sem condutor | 2023 |
| RADIO JUTANOPOLIS DE MANACAPURU LTDA | SAO JOSE | Atividades de rádio | 1987 |
| RADIO TV DO AMAZONAS LTDA | CENTRO | Atividades de televisão aberta | 1976 |
| RAIA DROGASIL S/A | CENTRO | Comércio varejista de produtos farmacêuticos, sem manipulação de fórmulas | 2024 |
| RAILSON DOS SANTOS OLIVEIRA LTDA | LIBERDADE | Reparação e manutenção de equipamentos de comunicação | 2024 |
| RAIMUNDO BARBOSA DOS SANTOS FILHO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2025 |
| RAIMUNDO BEZERRA DE ALBUQUERQUE LTDA | AREA RURAL DE MANACAPURU | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2003 |
| RAIMUNDO EDSON TORRES LIMA SOCIEDADE INDIVIDUAL DE ADVOCACIA | MORADA DO SOL | Serviços advocatícios | 2024 |
| RAMON TORRES DE LIMA LTDA | AREA RURAL DE MANACAPURU | Criação de peixes em água doce | 2018 |
| RAMOS COMERCIO VAREJISTA DE PETROLEO LTDA | APARECIDA | Comércio varejista de combustíveis para veículos automotores | 2021 |
| RANCHO ING FERRADURINHA AGRO INDUSTRIAL LTDA | AREA RURAL DE MANACAPURU | Fabricação de laticínios | 2009 |
| RASILVA LTDA | TERRA PRETA | Fornecimento de alimentos preparados preponderantemente para empresas | 2014 |
| RBS PESCADOS LTDA | SAO JOSE | Peixaria | 2025 |
| RD TRANSPORTE E DISTRIBUICAO DE PRODUTOS ALIMENTICIOS LTDA | SAO FRANCISCO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - supermercados | 2013 |
| REAL GOMAS LTDA | SAO JOSE | Fabricação de amidos e féculas de vegetais | 2026 |
| REAL SERVICOS ODONTOLOGICO LTDA | CORRENTEZA | Atividade odontológica | 2022 |
| RECANTO DO GUERREIRO BAR E PARRILLA LTDA | TERRA PRETA | Restaurantes e similares | 2023 |
| REDE SUSTENTABILIDADE - COMISSAO PROVISORIA | CENTRO | Atividades de organizações políticas | 2016 |
| REDENTOR LOCACAO DE AUTOMOVEIS SEM CONDUTOR LTDA | CENTRO | Locação de automóveis sem condutor | 2011 |
| REGAL EMPREENDIMENTOS ADMINISTRACAO DE OBRAS E ENGENHARIA LTDA | CENTRO | Construção de edifícios | 2019 |
| REGILMAR S DA SILVA MINIMERCADOS E AQUICULTURA LTDA | LIBERDADE | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2010 |
| REGINALDO ARAUJO DE LIMA LTDA | AREA RURAL DE MANACAPURU | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2020 |
| REGO EMPREENDIMENTOS COMERCIAIS E LOCACAO DE VEICULOS LTDA | RAMAL BELA VISTA | Comércio a varejo de peças e acessórios novos para veículos automotores | 2010 |
| REI DO CELULAR COMERCIO DE TELEFONES LTDA | LIBERDADE | Reparação e manutenção de equipamentos de comunicação | 2020 |
| REIS FUNERARIA E FLORICULTURA LTDA | SAO JOSE | Serviços de funerárias | 2009 |
| REJAL GESTAO EMPRESARIAL E APOIO ADMINISTRATIVO LTDA | LIBERDADE | Consultoria em tecnologia da informação | 2018 |
| REPIRUA FOODTECH INOVA SIMPLES (I.S.) | AREA RURAL DE MANACAPURU | Pesquisa e desenvolvimento experimental em ciências físicas e naturais | 2024 |
| REPUBLICANOS - COMISSAO PROVISORIA DO MUNICIPIO DE MANACAPURU | ESTRADA | Atividades de organizações políticas | 2011 |
| RESIDENCIAL DONA ALZIRA LTDA | AREA RURAL | Compra e venda de imóveis próprios | 2019 |
| RESIDENCIAL PARQUE MIRITI SPE LTDA | MORADA DO SOL | Loteamento de imóveis próprios | 2023 |
| RESTAURANTE CANTINHO DO MIRITI LTDA | AREA RURAL | Restaurantes e similares | 2025 |
| RESTAURANTE CANTINHO DO MIRITI LTDA | AREA RURAL DE MANACAPURU | Restaurantes e similares | 2026 |
| RESTAURANTE TOP MANACAPURU LTDA | TERRA PRETA | Restaurantes e similares | 2024 |
| REVEMAR COMERCIO DE MOTOS LTDA | SAO JOSE | Comércio a varejo de motocicletas e motonetas novas | 2021 |
| RGM COMERCIO DE MATERIAIS DE CONSTRUCAO LTDA | APARECIDA | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2016 |
| RGM COMERCIO DE MATERIAIS DE CONSTRUCAO LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de motocicletas e motonetas novas | 2024 |
Malha municipal: IBGE