| EMPRESA DE COMUNICACOES JORNAL DAS MISSOES LTDA | CENTRO | Atividades de rádio | 1991 |
| EMPRESA JORNALISTICA J. O. M. LTDA | CENTRO | Edição de jornais não diários | 2018 |
| EMPRESA MERCANTIL DO PRATA LTDA | CENTRO | Comércio atacadista de ferragens e ferramentas | 2015 |
| EMPRESA RAINHA DAS MISSOES DE TRANSPORTES LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, intermunicipal, exceto em região metropolitana | 1985 |
| ENALMI COMERCIO E REPRESENTACOES LTDA | CENTRO | Representantes comerciais e agentes do comércio de têxteis, vestuário, calçados e artigos de viagem | 1988 |
| ENCANTOS DO LAR PRESENTES LTDA | PIPPI | Comercio varejista de artigos de cama, mesa e banho | 2026 |
| ENEL CIEN S.A | SANTO ANGELO | Transmissão de energia elétrica | 1999 |
| ENEL ENERGIA CONSTRUCOES LTDA | CENTRO | Construção de estações e redes de distribuição de energia elétrica | 2011 |
| ENERGENS ENGENHARIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de material elétrico | 2017 |
| ENERGIA PRO LTDA | SOSSEGO | Serviços de engenharia | 2021 |
| ENGENHARIA ONIPOTENTE LTDA | CENTRO | Serviços de engenharia | 2024 |
| ENGEOPLAN-ENGENHARIA E GEOPROCESSAMENTO LTDA | UNIVERSITARIO | Serviços de cartografia, topografia e geodésia | 2010 |
| ENGERS & ROTTA COMERCIO DE ALIMENTOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - minimercados, mercearias e armazéns | 2025 |
| ENGESERV SERVICOS DE ENGENHARIA LTDA | CENTRO | Instalação e manutenção elétrica | 1991 |
| ENGESUL MISSOES PROJETOS E SOLUCOES EM ENGENHARIA LTDA | CENTRO | Serviços de engenharia | 2009 |
| ENGROFF COMERCIO DE PNEUS LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de pneumáticos e câmaras-de-ar | 2008 |
| ENGROFF COMERCIO DE VEICULOS LTDA | CENTRO | Comércio a varejo de automóveis, camionetas e utilitários usados | 2020 |
| ENGSEST ENGENHARIA DE SEGURANCA E SAUDE DO TRABALHO LTDA | CENTRO | Outras atividades profissionais, científicas e técnicas não especificadas anteriormente | 2016 |
| ENIO CADORE LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2013 |
| ENTIDADE SOCIAL CPF - CHAMADOS PARA FORA | CASTELARIM | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 2019 |
| ENTRETERRA ESCAVACOES E TERRAPLANAGEM LTDA | CENTRO | Locação de outros meios de transporte não especificados anteriormente, sem condutor | 2021 |
| EQS ENGENHARIA S.A | HORTENCIA | Serviços de engenharia | 2021 |
| EQUIPAR GASTRO ACESSORIOS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 2002 |
| ER ASSESSORIA E CONSULTORIA EDUCACIONAL LTDA | CENTRO | Treinamento em desenvolvimento profissional e gerencial | 2022 |
| ERCI DE OLIVEIRA SOUZA E MAURI NETO BONETO LTDA | JOSE ALCEBIADES OLIVEIRA | Obras de alvenaria | 2019 |
| ERICA RAFAELA ARENHART LTDA | CENTRO | Atividades de fisioterapia | 2026 |
| ERICK MACIEL MARKETING LTDA | CENTRO | Agências de publicidade | 2025 |
| ERNESTO DIEL ADVOGADOS ASSOCIADOS | CENTRO | Serviços advocatícios | 2023 |
| ERNESTO ENGENHARIA E CONSULTORIA INDUSTRIAL LTDA | CENTRO | Serviços de engenharia | 2022 |
| ESCAVASUL LTDA | CENTRO | Serviços de operação e fornecimento de equipamentos para transporte e elevação de cargas e pessoas para uso em obras | 2025 |
| ESCOLA DE EDUCACAO INFANTIL PARAISO DAS CRIANCAS LTDA | SOSSEGO | Educação infantil - creche | 2016 |
| ESCOLA DE EDUCACAO INFANTIL PINGUINHO DE GENTE LTDA | CENTRO | Educação infantil - pré-escola | 1989 |
| ESCOLA DE EDUCACAO PROFISSIONAL BIG MASTER LTDA | CENTRO | Educação profissional de nível técnico | 1997 |
| ESCOLA DE IDIOMAS HOGETOP LTDA | UNIVERSITARIO | Ensino de idiomas | 2026 |
| ESCOLA DE IDIOMAS SANTO ANGELO LTDA | CENTRO | Ensino de idiomas | 2008 |
| ESCOLA MUNICIPAL SARGENTO PEDRO KRINSKI | BURITI | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1980 |
| ESCOLA REINO ENCANTADO LTDA | CENTRO | Educação infantil - creche | 2020 |
| ESCRITORIO CONTABIL E DESPACHANTE MISSOES LTDA | CENTRO NORTE | Atividades de contabilidade | 2008 |
| ESCRITORIO CONTABIL GINDRI & LIMA S/C LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2004 |
| ESCRITORIO DE SERVICOS CONTABEIS SALLA LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2009 |
| ESCRITORIO PLANNO CONT LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2014 |
| ESCRITORIO ZUCULOTO LTDA | CENTRO | Atividades de contabilidade | 2023 |
| ESCUDO DE BITS SERVICOS DE CIBERSEGURANCA LTDA | HALLER | Reparação e manutenção de computadores e de equipamentos periféricos | 2025 |
| ESENGER ENGENHARIA ELETRICA LTDA | OLAVO REIS | Instalação e manutenção elétrica | 2023 |
| ESPACO CAFE & ARTE WILTON DOURADO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de bebidas | 2008 |
| ESPACO CAFE & ARTE WILTON DOURADO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de bebidas | 2008 |
| ESPACO RECREATIVO LTDA | ALIANCA | Outras atividades de recreação e lazer não especificadas anteriormente | 2021 |
| ESPACO REVITAR SAUDE INTEGRADA LTDA | CENTRO | Atividades de fisioterapia | 2024 |
| ESPORTE CLUBE NACIONAL | SEPE | Clubes sociais, esportivos e similares | 2001 |
| ESPORTE CLUBE NAUTICO | RINCAO DOS MENDES | Atividades de associações de defesa de direitos sociais | 1986 |