| ELIEZER ROSA DA LUZ LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de mudanças | 2007 |
| ELISANGELA GUTERRES RODRIGUES LTDA | CENTRO | Compra e venda de imóveis próprios | 2025 |
| ELPIDIO ALVES RODRIGUES & CIA LTDA | CENTRO | Representantes comerciais e agentes do comércio de produtos alimentícios, bebidas e fumo | 1987 |
| ELPIDIO ALVES RODRIGUES & CIA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de mercadorias em geral, com predominância de produtos alimentícios - supermercados | 1988 |
| EMANUELE DA SILVEIRA SILVA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de artigos do vestuário e acessórios | 2023 |
| EMFCL - SERVICOS DE EXTRACAO DE MADEIRA EM FLORESTAS PLANTADAS E LTDA | CENTRO | Extração de madeira em florestas plantadas | 2019 |
| EMPRESA BRASILEIRA DE CORREIOS E TELEGRAFOS | CENTRO | Atividades do Correio Nacional | 1974 |
| EMPRESA POTHIN LTDA | VILA MARIANO DA ROCHA | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, municipal | 1978 |
| ENCRUPLAN PLANEJAMENTO E ASSISTENCIA AGROPECUARIA | CENTRO | Atividade Econônica não informada | 1983 |
| ENCRUZ DO SUL TABELIONATO E REGISTRO ESPECIAL | CENTRO | Administração pública em geral | 1981 |
| ENCRUZILHADA DO SUL CARTORIO DE REGISTRO DE IMOVEIS | CENTRO | Cartórios | 1981 |
| ENCRUZILHADA DO SUL JEEP CLUBE | CENTRO | Artes cênicas, espetáculos e atividades complementares não especificadas anteriormente | 2003 |
| ENCRUZILHADA DO SUL OFICIO DISTRITAL | POMPEU MACHADO | Administração pública em geral | 1981 |
| ENGENHARIA LANGASSNER LTDA | CENTRO | Serviços de cartografia, topografia e geodésia | 2020 |
| ENGENHO E AGROPECUARIA CAMPESTRE LTDA | CENTRO | Comércio varejista de medicamentos veterinários | 1994 |
| ERICSON FENSTERSEIFER & CIA LTDA | PRIMEIRO DISTRITO | Cultivo de uva | 2021 |
| ERIZELDO RODRIGUES DE ABREU & CIA LTDA | VILA XAVIER | Compra e venda de imóveis próprios | 2018 |
| ERJ COMPENSADOS E LAMINADOS LTDA | DISTRITO INDUSTRIAL DO ALTO RENNER | Fabricação de madeira laminada e de chapas de madeira compensada, prensada e aglomerada | 2022 |
| ESCOLINHA DE FUTEBOL JUDA | LAVA PES | Atividades associativas não especificadas anteriormente | 2018 |
| ESTABELECIMENTO VINICOLA ARMANDO PETERLONGO SA | SANTA BARBARA | Cultivo de uva | 2025 |
| ESTOFADOS MADESSERRA LTDA | CENTRO | Comércio varejista de móveis | 2022 |
| ESTRELA DE SORTE COMERCIO LTDA | CENTRO | Lojas de variedades, exceto lojas de departamentos ou magazines | 2025 |
| EVANI L. K. PEREIRA & CIA. LTDA | CENTRO | Padaria e confeitaria com predominância de revenda | 1972 |
| EXATA MECANICA FLORESTAL LTDA | MANOELA | Manutenção e reparação de máquinas e equipamentos para agricultura e pecuária | 2025 |
| EXPERT REPRESENTACOES E PARTICIPACOES LTDA | LOC DE TABULEIRO | Criação de bovinos para corte | 1988 |
| EXPRESSO ENCRUZILHADENSE TRANSPORTES E TURISMO LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, intermunicipal, exceto em região metropolitana | 2021 |
| EXPRESSO SB TRANSPORTES E TURISMO LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário coletivo de passageiros, com itinerário fixo, intermunicipal, exceto em região metropolitana | 1977 |
| EYMAEL SERVICOS ESPECIALIZADOS LTDA | ALTO ALEGRE | Instalação e manutenção elétrica | 2020 |
| F. DE FREITAS VARGAS LTDA | CENTRO | Comércio varejista de doces, balas, bombons e semelhantes | 2017 |
| FABRICIO DANIEL STRASSBURGER LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2020 |
| FANFA & FANFA CONSULTORIA AGRONOMICA E PECUARIA LTDA | CENTRO | Serviços de agronomia e de consultoria às atividades agrícolas e pecuárias | 2023 |
| FAZENDA ENCRUZILHADA AGROINDUSTRIA LTDA | INTERIOR | Fabricação de óleos vegetais refinados, exceto óleo de milho | 2023 |
| FAZENDA PASSO DA CRIA AGRICULTURA LTDA | 1 SUBDISTRITO | Cultivo de uva | 2015 |
| FAZENDA SABIA DA VIGIA LTDA | INTERIOR | Fabricação de óleos vegetais em bruto, exceto óleo de milho | 2020 |
| FAZENDA SAO CARLOS LTDA | ZONA RURAL | Cultivo de soja | 2022 |
| FAZENDA VERTENTE LTDA | ZONA RURAL | Cultivo de soja | 2024 |
| FAZENDA XAFRI WM LTDA | INTERIOR | Comércio atacadista de animais vivos | 2021 |
| FCL - SERVICOS FLORESTAIS E TRANSPORTES LTDA | CENTRO | Transporte rodoviário de carga, exceto produtos perigosos e mudanças, intermunicipal, interestadual e internacional | 2013 |
| FCL - SERVICOS FLORESTAIS E TRANSPORTES LTDA | CENTRO | Extração de madeira em florestas plantadas | 2018 |
| FEEDBACK CONSULTORIA AGROPECUARIA LTDA | CENTRO | Serviços de agronomia e de consultoria às atividades agrícolas e pecuárias | 2020 |
| FELIPE MEIRELES RODRIGUES LTDA | CENTRO | Atividades de condicionamento físico | 2021 |
| FERNANDES SERVICOS MEDICOS LTDA | CENTRO | Atividade médica ambulatorial restrita a consultas | 2023 |
| FERNANDO SOARES GONCALVES LTDA | CENTRO | Atividades de condicionamento físico | 2016 |
| FERRAS MATERIAS DE CONSTRUCAO LTDA | CENTRO | Comércio varejista de materiais de construção em geral | 2025 |
| FLISUL REFLORESTADORA LTDA | PARAISO II | Comércio varejista de outros produtos não especificados anteriormente | 2010 |
| FLOR DE LIZ ZEN LTDA | CENTRO | Comércio varejista de suvenires, bijuterias e artesanatos | 2018 |
| FLOR DE LIZ ZEN LTDA | CENTRO | Atividades de práticas integrativas e complementares em saúde humana | 2023 |
| FLORES & RODRIGUES USINAGEM E TERRAPLANAGEM LTDA | MARIANO DA ROCHA | Serviços de usinagem, tornearia e solda | 2019 |
| FLORESTAL JACUI LTDA | ZONA RURAL | Extração de madeira em florestas plantadas | 2018 |
| FLORESTAL LJ LTDA | INTERIOR | Extração de madeira em florestas plantadas | 2014 |